m6A研究又有新手段了?趕緊來(lái)了解一下吧!欄目:研究動(dòng)態(tài)發(fā)布時(shí)間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章,小編時(shí)間和大家分享一下。作者開(kāi)發(fā)這一方法的前提是有研究報(bào)道了MazF能特異性的識(shí)別無(wú)修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個(gè)A發(fā)生m6A甲基化之后將無(wú)法被MazF所識(shí)別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理,然后再對(duì)打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫(kù)測(cè)序。對(duì)于無(wú)修飾的位點(diǎn),ACA處被完全剪切,測(cè)序reads正好分布于該位點(diǎn)上下游而且比對(duì)至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點(diǎn)的reads會(huì)包含上下游的序列。作者開(kāi)發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專(zhuān)門(mén)進(jìn)行分析(圖3)。細(xì)胞劃痕(wound healing)法是簡(jiǎn)捷測(cè)定細(xì)胞遷移運(yùn)動(dòng)和修復(fù)能力的方法。上海病理科研技術(shù)服務(wù)外包
轉(zhuǎn)錄組和m6A分析顯示精子發(fā)生相關(guān)基因的表達(dá)和選擇性剪接發(fā)生了改變[19]。YTHDC2可促進(jìn)靶基因的翻譯效率,并降低其mRNA的豐度,在精子發(fā)生過(guò)程中起關(guān)鍵作用。當(dāng)減數(shù)分裂開(kāi)始時(shí)YTHDC2表達(dá)上調(diào),YTHDC2敲除小鼠的生殖細(xì)胞沒(méi)有經(jīng)過(guò)偶線期的發(fā)育導(dǎo)致小鼠不育[20]。在DNA損傷反應(yīng)中,METTL3可促進(jìn)DNA聚合酶κ(Polκ)與核酸剪切修復(fù)途徑快速定位到UV引起的DNA損傷位點(diǎn),當(dāng)缺失METTL3時(shí),細(xì)胞無(wú)法迅速修復(fù)UV照射引起的突變,并且對(duì)UV照射更加敏感[25]。在淋巴細(xì)胞性小鼠過(guò)繼轉(zhuǎn)移模型中,Mettl3缺陷通過(guò)影響mRNAm6A修飾,降低SOCS家族mRNA衰減,增加mRNA和蛋白表達(dá)水平,從而抑制IL-7介導(dǎo)的STAT5活性和T細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)增殖和分化,進(jìn)而抑制腸炎的發(fā)生[21]。在肝中,METTL14通過(guò)調(diào)控pri-miRNA的m6A修飾,影響MiR-126的生成加工,從而抑制肝的轉(zhuǎn)移[22]。在乳腺細(xì)胞中,低氧刺激能促進(jìn)依賴(lài)低氧誘導(dǎo)因子HIF的ALKBH5的表達(dá),而ALKBH5過(guò)表達(dá)降低了NANOGmRNA的m6A修飾,從而穩(wěn)定mRNA提高NANOG的表達(dá)水平,終增加乳腺干細(xì)胞所占的比例[23]。此外,低氧誘導(dǎo)乳腺細(xì)胞中依賴(lài)ZNF217的NANOG和KLF4的mRNAm6A甲基化抑制,且ALKBH5敲除降低免疫缺陷小鼠乳腺的肺轉(zhuǎn)移[24]。在肺中。貴州科研技術(shù)服務(wù)購(gòu)買(mǎi)將Transwell小室放入配套培養(yǎng)板中,形成由細(xì)胞可穿透性膜分隔開(kāi)的兩室系統(tǒng),將高營(yíng)養(yǎng)液與低營(yíng)養(yǎng)液分隔開(kāi)。
保存于嚴(yán)密緊塞或加蓋的容器里,同時(shí)在容器外上標(biāo)簽,并隨同材料在溶液中投入相應(yīng)的標(biāo)簽,以免相互混淆。標(biāo)簽上注明固定液、材料來(lái)源、日期等。標(biāo)簽上的文字,應(yīng)用黑色鉛筆或繪圖黑墨水書(shū)寫(xiě)。3.脫水注意事項(xiàng)(1)脫水原理:乙醇與石蠟不相溶,而二甲苯既能溶于乙醇又能溶于石蠟。當(dāng)組織中全部被二甲苯占有時(shí),光線可以透過(guò),組織呈現(xiàn)出不同程度的透明狀態(tài)。(2)脫水必須在有蓋的玻璃品中進(jìn)行,防止吸收空氣中的水分。(3)在更換高一級(jí)的脫水劑時(shí),不要移動(dòng)材料以免損壞,可用吸管吸出器皿中的脫水劑,再用吸水吸盡器皿內(nèi)剩余液,然后于皿中加入高一級(jí)脫水劑。(4)在低濃度酒精中,每級(jí)停留不宜太長(zhǎng),否則易使組織變軟,助長(zhǎng)材料的解體。(5)在高濃度或純酒精中,每級(jí)停留的時(shí)間也不宜太長(zhǎng),否則會(huì)使組織變脆,影響切片。(6)如需過(guò)夜,應(yīng)停留在70%酒精中。(7)脫水必須徹底,否則不易透明,甚至使透明劑內(nèi)出現(xiàn)白色混濁現(xiàn)象。4.透明注意事項(xiàng)(1)使用透明劑時(shí),要隨時(shí)蓋緊蓋子,以免空氣中的水分進(jìn)入。(2)更換每級(jí)透明劑,動(dòng)作要迅速,一方面為了不使材料塊干涸,另一方面能避免吸收濕氣。(3)在透明過(guò)程中,如果材料周?chē)霈F(xiàn)白色霧狀,說(shuō)明材料中的水未被脫凈。
原代細(xì)胞是指在機(jī)體或組織中直接從生物體分離出來(lái)的、未經(jīng)傳代培養(yǎng)的細(xì)胞。這種細(xì)胞保持著其原始的生物學(xué)特性,具有高度的活性和分裂能力。原代細(xì)胞在許多生物醫(yī)學(xué)研究中具有重要地位,包括藥物篩選、疾病模型的建立以及疫苗研發(fā)等。原代細(xì)胞的獲得通常是通過(guò)組織剪切、消化或酶解等方式從機(jī)體或組織中分離出來(lái)。這些細(xì)胞脫離了它們?cè)?span style="color:#f5c81c;">生物體中的環(huán)境,但是仍然保持著其基本的生物學(xué)特性,包括細(xì)胞膜、細(xì)胞核、細(xì)胞器以及其他重要的生物分子。原代細(xì)胞在未經(jīng)過(guò)傳代培養(yǎng)的情況下,保持著其原始的生物學(xué)特性,因此,它們常常被用于藥物篩選、毒理學(xué)研究等。同時(shí),由于原代細(xì)胞具有高度活性和分裂能力,它們也被用于組織工程和再生醫(yī)學(xué)中,如皮膚移植、骨頭修復(fù)和神經(jīng)再生等。此外,原代細(xì)胞模型在疾病研究中也扮演著重要角色。由于原代細(xì)胞具有更高的生物真實(shí)性,使用它們建立的疾病模型能夠更準(zhǔn)確地模擬疾病的發(fā)展過(guò)程和藥物的作用機(jī)制,從而為新藥研發(fā)和疾病治、療提供更有效的工具??傊?,原代細(xì)胞是一種具有高度活性和分裂能力的細(xì)胞,在生物醫(yī)學(xué)研究中具有重要的作用。由于其原始的生物學(xué)特性。EdU細(xì)胞增殖檢測(cè)是一種快速、準(zhǔn)確、靈敏的細(xì)胞增殖檢測(cè)方法.
靜置25分鐘后把酒精倒干,用吸水紙吸出多余的酒精,然后配壓縮膠,同樣的操作,關(guān)鍵是梳子要插得快,要小心梳子下產(chǎn)生氣泡,然后靜置30分鐘。如果是當(dāng)天跑膠,我會(huì)等上層膠凝2個(gè)小時(shí)再用,但要注意防干燥縮水,可以在一個(gè)小時(shí)的時(shí)候沿著梳子上緣加點(diǎn)電泳液。所以我一般提前一晚制膠,泡于純水或者電泳液里置于4度冰箱暫存。三、蛋白電泳1、上樣前準(zhǔn)備把膠組裝到電泳芯上,注意密閉性(否則漏液),如果內(nèi)槽漏液就不是勻強(qiáng)電場(chǎng)了,條帶可能就不是一條直線。然后內(nèi)槽倒?jié)M電泳液,拔梳子,這一步要小心,梳子要兩邊一起緩緩?fù)习纬?,然后觀察泳道內(nèi)有無(wú)脫落的膠?;蛘吣z絲,有的話用1毫升注射器吸出。然后從冰箱取出蛋白樣品,解凍。準(zhǔn)備振蕩器。2、上樣和電泳注意,上樣后蛋白會(huì)開(kāi)始慢慢在膠中彌散,所以上樣越快越好。我習(xí)慣先上蛋白Marker,再上蛋白樣品,蛋白上樣前確保樣品完全解凍和充分振蕩(推薦使用振蕩器振蕩),吸的時(shí)候沒(méi)有拉絲即可,建議上樣分鐘把樣品從冰上取出來(lái),不然樣品中SDS可能會(huì)結(jié)晶析出,從而影響電泳效果。上層膠80V25分鐘,下層膠120V65分鐘。四、轉(zhuǎn)膜1、轉(zhuǎn)膜前準(zhǔn)備我會(huì)在電泳結(jié)束0分鐘準(zhǔn)備,把轉(zhuǎn)膜液配好置于4度冰箱預(yù)冷,然后裁膜,準(zhǔn)備轉(zhuǎn)膜裝置??破罩R(shí) —了解IgM、IgG、IgA、IgE四種抗體。寧夏外包科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)
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必須仔細(xì)考慮所有可能影響實(shí)驗(yàn)的條件和技術(shù)參數(shù)以獲得可重復(fù)且一致的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。因此,要求實(shí)驗(yàn)人員深入了解和熟練掌握操作過(guò)程才能準(zhǔn)確地構(gòu)建CLP模型。造模評(píng)價(jià)該模型通過(guò)模型動(dòng)物自身引發(fā)膿毒癥,與臨床膿毒癥類(lèi)似的地方在于有連續(xù)分散的細(xì)菌源,血中內(nèi)檢出率及細(xì)菌培養(yǎng)陽(yáng)性率高,動(dòng)物體溫降低以及血流動(dòng)力學(xué)早期高排低阻晚期低排低阻的特征也與臨床相仿,在建模的同時(shí)模擬臨床膿毒癥方法,輔以充分的液體復(fù)蘇和適當(dāng)輔助(如藥物),另外這個(gè)模型可控性高,標(biāo)準(zhǔn)化水平高。該模型中膿毒癥的嚴(yán)重程度受3個(gè)重要因素的影響:結(jié)扎盲腸的長(zhǎng)度、穿孔針的大小和CLP后的支持。結(jié)扎盲腸的長(zhǎng)度是死亡率的主要決定因素,隨著結(jié)扎盲腸的長(zhǎng)度的增加,促炎細(xì)胞因子的水平也在增加。來(lái)源:[1]李晗,田李均,韓旭東.膿毒癥體內(nèi)外模型研究進(jìn)展.中國(guó)與化療雜志,2020,20(01):.[2]彭鳳輝,鄧曉彬,呂立文.膿毒癥動(dòng)物模型的研究進(jìn)展.廣西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào),2020,37。上海病理科研技術(shù)服務(wù)外包