逆轉(zhuǎn)錄引物:加尾法逆轉(zhuǎn)錄引物的結(jié)構(gòu)并不是想象中那么簡單的oligodT,其包含三個關(guān)鍵結(jié)構(gòu):①為了與PolyA序列互補配對,OligodT序列必不可少。②在OligodT序列的5端,存在一段通用序列,用于qPCR過程中反向引物與cDNA的結(jié)合。③OligodT序列的3端存在一個或兩個錨定堿基,V或者VN。(兼并堿基,V表示A、G或C,N表示ATCG中的任意一種)。如果沒有錨定堿基,逆轉(zhuǎn)錄引物中的OligodT就會隨機結(jié)合到PolyA的任意位置,這樣會造成同一miRNA的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長度不一,給較后的熔解曲線檢測帶來麻煩。因此,錨定堿基的作用就是特異性地結(jié)合到miRNA上,從而讓逆轉(zhuǎn)錄引物結(jié)合到緊挨著miRNA的那段PolyA序列上。只有這樣,才能夠保證同一miRNA的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物大小相同。逆轉(zhuǎn)錄也可作為RNA表達(dá)譜的分析方法。揚州帶gDNA Remover反轉(zhuǎn)錄
逆轉(zhuǎn)錄試劑在許多生物學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中都有普遍的應(yīng)用。例如,在病毒學(xué)研究中,逆轉(zhuǎn)錄試劑可以被用來檢測病毒RNA的存在和濃度。此外,在基因表達(dá)和基因調(diào)控的研究中,逆轉(zhuǎn)錄試劑也可以用來研究mRNA的表達(dá)模式和在細(xì)胞內(nèi)的分布狀態(tài)。雖然逆轉(zhuǎn)錄試劑在研究中發(fā)揮著重要的作用,但研究人員在選擇試劑時需要考慮多種因素。例如,試劑的純度、穩(wěn)定性和活性都會影響實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。此外,試劑的價格和供貨渠道也是研究人員需要考慮的因素之一。一步法逆轉(zhuǎn)錄RT-qPCR逆轉(zhuǎn)錄實驗過程中需要考慮RNA模板質(zhì)量和RNA純化的方法。
miRNA加尾法逆轉(zhuǎn)錄:miRNA,即microRNA,是一類非常短的RNA分子,只有幾十到幾百個核首酸,在正常細(xì)胞存活期間會產(chǎn)生大量的miRNA。miRNA起著重要的抑制作用,它可以抑制特定mRNA的表達(dá)以及細(xì)胞中內(nèi)含物翻譯和轉(zhuǎn)錄等功能他們是催化機制,負(fù)責(zé)影響細(xì)胞及其產(chǎn)物的生物學(xué)復(fù)雜性和穩(wěn)定性,對于宿主機體影響是非常重要的。miRNA加尾法是一種獲得miRNA及其前體的研究方法之。較重要的是,它是RNA千擾技術(shù)的一個重要組成部分。過去的研究發(fā)現(xiàn),通過miRNA加尾法獲得的新miRNA表達(dá)調(diào)節(jié)了細(xì)胞信號傳導(dǎo)、細(xì)胞分裂和細(xì)胞凋亡等多重信號傳遞通路,其過程非常復(fù)雜。
逆轉(zhuǎn)錄的過程與端粒復(fù)制,逆轉(zhuǎn)錄酶通常具有多種活性,如逆轉(zhuǎn)錄活性、復(fù)制活性與RNA酶H活性。逆轉(zhuǎn)錄活性可以RNA為模板,合成與其序列互補的DNA鏈,生成DNA-RNA雜合雙鏈。RNA酶H活性可以水解雜合雙鏈中的RNA,得到與RNA互補的DNA單鏈(cDNA)。復(fù)制活性則用來合成雙鏈DNA。HIV逆轉(zhuǎn)錄酶的活性部位。與復(fù)制類似,逆轉(zhuǎn)錄也是由5’向3’合成DNA,要求有模板和不少于四個核苷酸的引物。各種DNA聚合酶活性都需要引物,只有確認(rèn)引物正確配對,才會進(jìn)行DNA的合成。這是保證其忠實性的重要手段,逆轉(zhuǎn)錄酶也不例外。實驗室合成cDNA時,經(jīng)常會用合成的寡聚T(oligodT)作為引物,與mRNA的polyA配對。這個過程比較簡單,因為引物結(jié)合在RNA鏈的末端,所以整條鏈的逆轉(zhuǎn)錄是一次性完成的。酵母菌逆轉(zhuǎn)錄酶是逆轉(zhuǎn)錄酶家族中的一個重要表示。
反轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase,也可寫成逆轉(zhuǎn)錄酶)又稱為依賴RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中發(fā)現(xiàn)了一種特殊的DNA聚合酶,該酶以RNA為模板,以dNTP為底物,tRNA(主要是色氨酸t(yī)RNA)為引物,在tRNA3'-OH末端上,根據(jù)堿基配對的原則,按5'-3'方向合成一條與RNA模板互補的DNA單鏈,這條DNA單鏈叫做互補DNA(complementaryDNA,CDNA)。反轉(zhuǎn)錄酶(Reversetranscriptase)是以RNA為模板指導(dǎo)三磷酸脫氧核苷酸合成互補DNA(cDNA)的酶。哺乳類C型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶和鼠類B型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶都是一條多肽鏈。鳥類RNA病毒的反轉(zhuǎn)錄酶則由兩上亞基結(jié)構(gòu)。真核生物中也都分離出具有不同結(jié)構(gòu)的反轉(zhuǎn)錄酶。逆轉(zhuǎn)錄實驗中引物設(shè)計時要注意反向引物特異性和長度,避免循環(huán)擴(kuò)增和特異性問題。揚州帶gDNA Remover反轉(zhuǎn)錄
逆轉(zhuǎn)錄實驗中可以通過qPCR檢測逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)效果。揚州帶gDNA Remover反轉(zhuǎn)錄
逆轉(zhuǎn)錄酶的質(zhì)量控制:1.切口酶:在與200單位酶37oC保溫60分鐘后,超螺旋質(zhì)粒保留在90%以上。2.DNase測定:200單位酶與50ng3H-DNA37oC保溫60分鐘,分解出的放射性低于1%。3.RNase測定:200單位酶與50ng3H-RNA37oC保溫60分鐘,分解出的放射性低于3%。4.首先鏈cDNA的反應(yīng):在標(biāo)準(zhǔn)化的反應(yīng)中,200單位酶催化從1mg1.2kbRNA或1mg7.5kbRNA將同位素?fù)饺氲絚DNA中,通過放射自顯影,對于1.2kb的RNA,產(chǎn)物cDNA是單一的、全長的條帶。對于7.5kb的RNA產(chǎn)物有部分是全長的條帶。用這二種RNA放射性轉(zhuǎn)換到cDNA中有12%。5.RNaseH活性:200單位酶與polyA:polydT37oC保溫60分鐘,釋放出的放射性要低于1%。揚州帶gDNA Remover反轉(zhuǎn)錄
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