上海慕柏生物醫(yī)學(xué)科技有限公司依托單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-seq)技術(shù),為生命科學(xué)研究和臨床轉(zhuǎn)化提供細(xì)胞級(jí)精度的基因表達(dá)全景解析。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)通過解構(gòu)傳統(tǒng)測(cè)序中“細(xì)胞群體均值化”的盲區(qū),實(shí)現(xiàn)對(duì)單個(gè)細(xì)胞全轉(zhuǎn)錄組的檢測(cè),揭示細(xì)胞異質(zhì)性、稀有亞群及動(dòng)態(tài)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。其原理基于“單細(xì)胞分離—分子標(biāo)記—高通量測(cè)序”三大模塊:首先利用微流控分選(如10xGenomics)或微孔板技術(shù)(如BDRhapsody)將組織解離后的單細(xì)胞懸液逐一捕獲,并為每個(gè)細(xì)胞分配獨(dú)特的核酸條形碼(Barcode);隨后裂解細(xì)胞釋放mRNA,通過逆轉(zhuǎn)錄合成攜帶細(xì)胞標(biāo)簽的cDNA文庫(kù),并引入分子標(biāo)識(shí)符(UMI)消除PCR擴(kuò)增偏差;借助Illumina等高通量測(cè)序平臺(tái),生成數(shù)千至上萬個(gè)單細(xì)胞的基因表達(dá)矩陣,結(jié)合AI驅(qū)動(dòng)的聚類算法(如t-SNE、UMAP)和擬時(shí)序分析(如Monocle3),繪制細(xì)胞類型圖譜、分化軌跡及功能互作網(wǎng)絡(luò),精細(xì)定位疾病相關(guān)關(guān)鍵細(xì)胞亞群。作為技術(shù),慕柏生物創(chuàng)新性整合單細(xì)胞多組學(xué)與空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù),突破單一維度的研究局限。針對(duì)臨床樣本的特殊性(如石蠟包埋組織、穿刺微量樣本),公司開發(fā)了低起始量RNA修復(fù)技術(shù),結(jié)合靶向探針富集策略,將檢測(cè)靈敏度提升至單細(xì)胞級(jí)別。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)的出現(xiàn),它允許我們逐個(gè)分析單個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)情況,就像擁有了一臺(tái)高倍顯微鏡。山東有利于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組神經(jīng)科學(xué)
“單細(xì)胞分離” 是開展單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究的首要步驟。由于細(xì)胞群體的異質(zhì)性,需要將單個(gè)細(xì)胞從復(fù)雜的組織或細(xì)胞懸液中精細(xì)分離出來。常用的方法包括流式細(xì)胞術(shù),利用細(xì)胞的物理和化學(xué)特性對(duì)其進(jìn)行分選;微流控技術(shù)則能在微小的芯片通道內(nèi)實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞的捕獲與分離,為后續(xù)分析提供純凈的單細(xì)胞樣本?!稗D(zhuǎn)錄組測(cè)序” 是環(huán)節(jié)。它通過對(duì)單細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行測(cè)序,獲取基因表達(dá)信息。借助高通量測(cè)序技術(shù),能夠快速、準(zhǔn)確地測(cè)定每個(gè)細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄本序列,從而了解細(xì)胞在特定狀態(tài)下的基因活性,揭示不同細(xì)胞類型間的基因表達(dá)差異。“數(shù)據(jù)分析” 是挖掘單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)價(jià)值的關(guān)鍵。面對(duì)海量的測(cè)序數(shù)據(jù),需要運(yùn)用專門的生物信息學(xué)工具和算法。聚類分析可將具有相似基因表達(dá)模式的細(xì)胞歸為一類,識(shí)別出不同的細(xì)胞亞群。差異表達(dá)分析則用于找出在不同細(xì)胞狀態(tài)或條件下,表達(dá)水平發(fā)生變化的基因,為探索細(xì)胞功能和疾病機(jī)制提供線索。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析能夠深入解析這種異質(zhì)性,發(fā)現(xiàn)稀有細(xì)胞類型,了解細(xì)胞間的功能差異,對(duì)于cancer研究中識(shí)別tumor干細(xì)胞,以及神經(jīng)科學(xué)中探索不同神經(jīng)元亞型等都具有重要意義。河北分析單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組基因結(jié)構(gòu)通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù),我們可以直接在單個(gè)細(xì)胞水平上測(cè)定基因的表達(dá)水平。
上海慕柏生物醫(yī)學(xué)科技有限公司的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù),是在單個(gè)細(xì)胞層面,對(duì)細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄生成的RNA進(jìn)行高通量測(cè)序,從而繪制細(xì)胞轉(zhuǎn)錄全景圖譜的前沿技術(shù)。它能捕捉每個(gè)細(xì)胞在轉(zhuǎn)錄層面的獨(dú)特特征,識(shí)別不同細(xì)胞類型,構(gòu)建細(xì)胞發(fā)育軌跡并了解細(xì)胞間調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。該公司依托國(guó)際的10×Genomics平臺(tái),結(jié)合自主優(yōu)化流程,建立了從樣本處理、測(cè)序到生物信息分析的完整服務(wù)體系。采用10xGenomics液滴微流控技術(shù)分離單個(gè)細(xì)胞,聯(lián)合OxfordNanopore長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序平臺(tái),實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄本5’至3’端全長(zhǎng)度覆蓋,可精細(xì)檢測(cè)基因表達(dá)量、轉(zhuǎn)錄本異構(gòu)體、RNA編輯及低豐度突變。其單細(xì)胞捕獲效率突破95%,年檢測(cè)通量達(dá)百萬級(jí)細(xì)胞。公司還自主開發(fā)SmartClean數(shù)據(jù)質(zhì)控系統(tǒng),結(jié)合AI驅(qū)動(dòng)的CellVision分析算法,有效解決傳統(tǒng)技術(shù)中細(xì)胞異質(zhì)性識(shí)別不足、信號(hào)噪音干擾等行業(yè)痛點(diǎn)。在應(yīng)用上,該技術(shù)在再生醫(yī)學(xué)、免疫學(xué)等生物醫(yī)學(xué)前沿領(lǐng)域廣泛應(yīng)用,助力相關(guān)研究不斷取得突破。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序通過解析單個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)特征,可精細(xì)繪制細(xì)胞類型圖譜、識(shí)別疾病特異性細(xì)胞亞群及揭示微環(huán)境互作機(jī)制,在神經(jīng)退行性疾病研究、生殖發(fā)育生物學(xué)、免疫應(yīng)答預(yù)測(cè)等領(lǐng)域具有不可替代性。國(guó)際期刊《細(xì)胞·干細(xì)胞》研究指出,單細(xì)胞技術(shù)對(duì)細(xì)胞分化路徑的解析精度較傳統(tǒng)方法提升75%,為再生醫(yī)學(xué)提供關(guān)鍵理論依據(jù)。慕柏生物創(chuàng)新開發(fā)"多組學(xué)整合分析系統(tǒng)",將轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)與表觀遺傳、空間組學(xué)信息融合,實(shí)現(xiàn)跨模態(tài)細(xì)胞功能解析,檢測(cè)覆蓋超3萬個(gè)基因及非編碼RNA,關(guān)鍵生物標(biāo)志物驗(yàn)證符合美國(guó)病理學(xué)家協(xié)會(huì)(CAP)指南標(biāo)準(zhǔn)。公司聯(lián)合中國(guó)科學(xué)院生物物理研究所等科研機(jī)構(gòu),建立覆蓋15種重大疾病的單細(xì)胞多中心研究隊(duì)列(樣本量≥),數(shù)據(jù)通過國(guó)家藥品監(jiān)督管理局(NMPA)技術(shù)審評(píng)中心方法學(xué)驗(yàn)證,檢測(cè)靈敏度達(dá),重復(fù)性CV值<2%(經(jīng)國(guó)家衛(wèi)生健康委臨床檢驗(yàn)中心認(rèn)證)。技術(shù)體系采用微流控芯片動(dòng)態(tài)捕獲技術(shù),細(xì)胞利用率提升至90%以上,配套自主研發(fā)的AI驅(qū)動(dòng)細(xì)胞注釋平臺(tái),可自動(dòng)識(shí)別200+功能細(xì)胞亞型。檢測(cè)報(bào)告經(jīng)跨學(xué)科委員會(huì)審核,包含敏感性預(yù)測(cè)、細(xì)胞通訊網(wǎng)絡(luò)分析及臨床試驗(yàn)入組建議,原始數(shù)據(jù)存儲(chǔ)符合《生物安全法》及《個(gè)人信息保護(hù)法》要求。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)能夠識(shí)別轉(zhuǎn)錄水平變化是來源于轉(zhuǎn)錄調(diào)控還是細(xì)胞類型組成發(fā)生的變化。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是一種在單細(xì)胞水平上對(duì)RNA進(jìn)行高通量測(cè)序和分析的技術(shù),能夠揭示細(xì)胞間的異質(zhì)性,幫助研究者理解不同細(xì)胞類型和狀態(tài)的基因表達(dá)特征。與傳統(tǒng)群體測(cè)序相比,單細(xì)胞測(cè)序可捕捉單個(gè)細(xì)胞的獨(dú)特表達(dá)譜,解析細(xì)胞亞群及動(dòng)態(tài)變化。上海慕柏生物醫(yī)學(xué)科技有限公司提供的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù),采用10xGenomics液滴微流控技術(shù)分離單個(gè)細(xì)胞,結(jié)合OxfordNanopore長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序平臺(tái),實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄本5’至3’端全長(zhǎng)度覆蓋,精細(xì)檢測(cè)基因表達(dá)量、轉(zhuǎn)錄本異構(gòu)體(如可變剪切、融合基因)、RNA編輯及低豐度突變。該技術(shù)廣泛應(yīng)用于研究,可解析細(xì)胞異質(zhì)性,挖掘驅(qū)動(dòng)基因,助力精細(xì)醫(yī)療;在神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域,能揭示神經(jīng)元分子特征,探究自閉癥、阿爾茨海默病等神經(jīng)退行性疾病機(jī)制;還可追蹤胚胎發(fā)育中細(xì)胞分化軌跡,解析基因表達(dá)動(dòng)態(tài)變化。公司服務(wù)涵蓋單細(xì)胞懸液制備、分選、文庫(kù)構(gòu)建、測(cè)序及生物信息學(xué)分析,提供從基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)到高級(jí)數(shù)據(jù)分析的全流程支持??蛻艨筛鶕?jù)需求選擇測(cè)全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本(如Smart-seq2)或3’/5’端的技術(shù)(如10xGenomics),滿足從機(jī)制研究到臨床轉(zhuǎn)化的多元需求。全基因組探針可以幫助科學(xué)家在基因組水平上更好地了解生物體內(nèi)基因和基因組的結(jié)構(gòu)與功能。河北分析單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組基因結(jié)構(gòu)
轉(zhuǎn)錄調(diào)控是一個(gè)復(fù)雜而精細(xì)的過程,涉及到眾多轉(zhuǎn)錄因子、調(diào)控元件和信號(hào)通路的相互作用。山東有利于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組神經(jīng)科學(xué)
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組是指某一時(shí)刻單個(gè)細(xì)胞內(nèi)所有mRNA的總表達(dá)量,其表達(dá)量反映該細(xì)胞的總體特征2。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)通過高通量測(cè)序技術(shù),在單細(xì)胞分辨率下精細(xì)測(cè)定基因表達(dá),突破傳統(tǒng)群體細(xì)胞研究的局限性,能揭示細(xì)胞異質(zhì)性,解析胚胎發(fā)育、微環(huán)境及疾病機(jī)制,為精細(xì)醫(yī)療提供關(guān)鍵數(shù)據(jù)支持1。上海慕柏生物醫(yī)學(xué)科技有限公司在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組業(yè)務(wù)方面實(shí)力雄厚1。公司依托國(guó)際的10×Genomics平臺(tái),結(jié)合自主優(yōu)化的實(shí)驗(yàn)流程,建立了從樣本處理、測(cè)序到生物信息分析的完整服務(wù)體系1。其采用10xGenomics液滴微流控技術(shù)分離單個(gè)細(xì)胞,結(jié)合OxfordNanopore長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序平臺(tái),實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄本5’至3’端全長(zhǎng)度覆蓋,可精細(xì)檢測(cè)基因表達(dá)量、轉(zhuǎn)錄本異構(gòu)體等1。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)配備高精度微流控芯片等先進(jìn)單細(xì)胞分離設(shè)備,確保細(xì)胞分離純度3。生物信息分析團(tuán)隊(duì)利用自主開發(fā)的算法和數(shù)據(jù)庫(kù),能深度挖掘數(shù)據(jù),為客戶精細(xì)定位細(xì)胞亞群、繪制細(xì)胞發(fā)育軌跡3。此外,公司還自主開發(fā)了AI驅(qū)動(dòng)的單細(xì)胞數(shù)據(jù)云平臺(tái)(ISO27001認(rèn)證),支持百萬級(jí)細(xì)胞并行分析3。服務(wù)涵蓋單細(xì)胞懸液制備、分選、文庫(kù)構(gòu)建、測(cè)序及生物信息學(xué)分析,提供從基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)到高級(jí)數(shù)據(jù)分析的全流程支持。山東有利于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組神經(jīng)科學(xué)