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來源: 發(fā)布時間:2024-03-15

如胰腺,一般取胰島較多的胰腺尾部;肺應取有細支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實驗需進行多樣本的采集,采集順序應按照:消化,神經(jīng)系統(tǒng),皮膚,肌肉等的順序進行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排,然后決定其切面的走向;如一長管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周圍的脂肪等,應盡可能掉,否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來一些不必要的問題。樣品的固定(1)固定的方法:①小塊固定法:從動物取下的小塊,立即置入液態(tài)固定劑(這是應用經(jīng)常的方法)。②注射/灌注固定法:某些塊由于體積過大或固定液極難滲入內部或需要對整個臟器或整個動物進行固定,這時宜采用注射固定法,將固定液注入血管,經(jīng)血管分支到達整個和全身,從而得到充分的固定。另,空腔比如肺,肺內含有空氣,固定液難以滲入,建議先做肺灌注,使得肺充盈滿固定液以后再進行保存,如果空腔中氣體沒有排出,后續(xù)可能影響固定效果(沒有灌注的肺會浮在液體表面不利于固定,切片以后也會看到很多的空泡)。③蒸汽固定法:比較細小而薄的標本,可用鋨酸或甲醛蒸汽固定。主要用于血液或細胞涂片以及某些薄膜的固定。。由于大部分研究使用到的是人類來源的細胞,種植到免疫正常的動物體內會發(fā)生免疫排斥反應。北京豚鼠科研技術服務服務

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外泌體的功能外泌體可能作為細胞之間物質和信號通訊的途徑,不同的細胞通過分泌攜帶不同組分的外泌體實現(xiàn)細胞間通訊,這些外泌體被受體細胞吸收,通過物質交換或釋放內含物實現(xiàn)物質和信號的交流。外泌體與受體細胞的信息交流可能通過以下4種途徑實現(xiàn):外泌體表面膜蛋白質被目的細胞表面的受體識別,從而靶細胞;外泌體在蛋白酶作用下產(chǎn)生的表面膜蛋白質碎片可作為目的細胞表面受體的配體;外泌體脂膜可以與目的細胞膜融合,將蛋白質和RNA等內容物釋放進去,此類膜融合可能改變靶細胞的一些膜特性,例如脂質和膜蛋白質的密度及種類;目的細胞通過胞吞的形式攝入外泌體經(jīng)由以上幾種途徑,外泌體將其攜帶的生物信息運輸?shù)街苓叞屑毎蚪?jīng)血液等體液運輸而被遠處組織細胞攝取,進而影響目的細胞的基本功能和基因表達。幾乎所有的細胞都可以在自發(fā)或在一定刺激條件下產(chǎn)生外泌體,不同的細胞產(chǎn)生的外泌體具有不同的功能,這些外泌體參與了一系列生理和病理過程,如發(fā)生與發(fā)展、抗原呈遞、免疫調節(jié)、組織愈合等。此外,外泌體與疾病的研究表明:外泌體可能在代謝性疾病的出現(xiàn)以及心血管健康中發(fā)揮作用。云南裸鼠科研技術服務培養(yǎng)動物疾病模型在科研中有著普遍的應用。

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3)基因/蛋白質表達定性或定量檢測在進行分子檢測的過程中,保持核酸和蛋白質的完整性至關重要,因此在取樣過程中,應盡量避免核酸及蛋白質的降解。如不注意采樣過程,將會導致樣本中的核酸及蛋白質的無差別降解,嚴重影響后續(xù)分子檢測結果。在條件允許的情況下,樣本在離體后應立刻裝入凍存管內,并立即放入液氮中進行冷凍。在RNA提取樣本的保存過程中,可以選擇非冷凍型RNA保存液或Trizol試劑進行RNA酶的。針對蛋白質提取樣本的保存,我們同樣可以使用商品化的蛋白酶劑進行短期處理。聚合酶鏈式反應(PolymeraseChnReaction,PCR)及免印跡(Westernblotting,WB),這兩種實驗手段是分子學檢測中不可或缺的一部分,也是發(fā)表至關重要的分子檢測數(shù)據(jù)。PCR主要用來對基因在基因組層面或轉錄層面的變化進行定性或定量檢測,而WB則主要用來對某一蛋白質的表達進行定量檢測。(4)轉錄組學、蛋白質組學及代謝組學檢測隨著檢測水平及相關產(chǎn)業(yè)的不斷發(fā)展,各類組學檢測的價格降低,實驗設計中也常常運用組學檢測來提升實驗設計的檔次。在我們進行轉錄組學及蛋白質組學的檢測過程中,同樣是要首先確保目標RNA或蛋白質的片段完整性。

m6A修飾圖譜構建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構建疾病細胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質瘤增殖相關的FOXM1,通過qPCR、WB、免疫熒光、核質分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調節(jié)FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達、共定位,進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質重構。近。這種技術是將蛋白質視為抗原,并利用抗體與之進行特異性結合的特性,來進行研究。

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RNA甲基化修飾(m6A)研究RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是高等生物mRNA和lncRNAs上為普遍的修飾。目前發(fā)現(xiàn)microRNA,circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發(fā)生m6A修飾。m6A修飾主要發(fā)生在RRACH序列中的腺嘌呤上,其功能由“編碼器(Writer)”、“消碼器(Eraser)”和“讀碼器(Reader)”決定[1]。“編碼器(Writer)”即甲基轉移酶,目前已知這個復合物的成分有METTL3,METTL14,WTAP和KIAA1429;而ALKBH5和FTO作為去甲基酶(消碼器)可逆轉甲基化;m6A由m6A結合蛋白識別,目前發(fā)現(xiàn)m6A結合蛋白(讀碼器)有YTH結構域蛋白(包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2)和核不均一蛋白HNRNP家族(HNRNPA2B1和HNRNPC)。m6A酶系統(tǒng)METTL3是早先被鑒定為結合SAM的組件,其缺失引起小鼠胚胎干細胞、Hela細胞和HepG2細胞中m6Apeaks的減少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的細胞核內亞細胞器-核小斑(Nuclearspeckle)上,顯示m6A修飾可能和RNA的剪切加工相關。WTAP與METTL3–METTL14二聚體相互作用,并共定位于核小斑,影響甲基化效率,參與mRNA剪。而KIAA1429作為候選的甲基轉移酶復合體的新亞基。干貨分享 | 瓊脂糖核酸電泳,選擇紫外還是藍光?江蘇外包科研技術服務技術

在藥物研發(fā)過程中,科研人員可以通過對動物模型進行藥物處理,觀察其療效和副作用,為新藥的試驗提供依據(jù)。北京豚鼠科研技術服務服務

是整體甲基化進程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員,作為個被發(fā)現(xiàn)的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RNA結合能力,進而調控pre-mRNA的剪切加工過程[3]。目前已發(fā)現(xiàn)FTO調節(jié)異常與肥胖、大腦畸形和生長遲緩相關,揭示m6A可能對這些疾病具有重要的調節(jié)功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被發(fā)現(xiàn)具有去甲基作用的另一個成員,以RNaseA敏感的方式與核小斑共定位,它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外,ALKBH5和它的去甲基化活性影響新生mRNA合的成和剪切效率[7],且ALKBH5敲除雄性小鼠表現(xiàn)出精子發(fā)生異常,這可能是精子發(fā)生相關基因表達改變的結果[7]。m6AmRNA修飾執(zhí)行其功能主要通過兩個途徑:精細調控甲基化轉錄本的結構,以阻止或誘使蛋白-RNA相互作用;或被直接由m6A結合蛋白識別,誘發(fā)續(xù)反應。目前一類含有YTH功能結構域的蛋白被鑒定為m6A修飾的結合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2己被證實是m6A的結合蛋白.YTHDF1主要影響m6A修飾基因的翻譯,YTHDF2主要影響m6A修飾基因的降解,而YTHDC1結合m6A修飾的基因影響其剪接。HNRNPC是一種豐富的核RNA結合蛋白,參與pre-mRNA的加工[8]。北京豚鼠科研技術服務服務