建立疾病模型的目的是為了防治人類疾病。因此,疾病模型研究結(jié)果的可靠程度取決于模型與人類疾病的相似或可比擬的程度。接下來(lái)就讓上海研錄帶您了解相關(guān)知識(shí)。一個(gè)好的疾病模型應(yīng)具有以下特點(diǎn):①能夠再現(xiàn)所要研究的人類疾病,動(dòng)物疾病表現(xiàn)應(yīng)該與人類疾病相似;②動(dòng)物能重復(fù)產(chǎn)生該疾病,盡可能能在兩種動(dòng)物體內(nèi)復(fù)制該??;③動(dòng)物背景資料完整,實(shí)驗(yàn)動(dòng)物合格,生命周期要滿足實(shí)驗(yàn)需要;④動(dòng)物要價(jià)廉、來(lái)源充足、便于運(yùn)送;⑤盡可能選用小動(dòng)物。生物醫(yī)學(xué)科研專業(yè)設(shè)計(jì)中常要考慮如何建立動(dòng)物模型的問(wèn)題,因?yàn)楹芏嚓U明疾病及療效機(jī)制的實(shí)驗(yàn)不可能或不應(yīng)該在患者身上進(jìn)行。常要依賴于復(fù)制動(dòng)物模型,但一定要進(jìn)行周密設(shè)計(jì),設(shè)計(jì)時(shí)要遵循下列一些原則:(一)相似性在動(dòng)物身上復(fù)制人類疾病模型,目的在于從中找出可以推演應(yīng)用于患者的有關(guān)規(guī)律。外推法(extrapolation)要冒風(fēng)險(xiǎn),因?yàn)閯?dòng)物與人到底不是一種生物。如,在動(dòng)物身上無(wú)效的藥物不等于臨床無(wú)效,反之亦然。因此,設(shè)計(jì)動(dòng)物疾病模型的一個(gè)重要原則是,所復(fù)制的模型應(yīng)盡可能近似于人類疾病的情況。能夠找到與人類疾病相同的動(dòng)物自發(fā)性疾病當(dāng)然是比較好的。(二)重復(fù)性理想的動(dòng)物模型應(yīng)該是可重復(fù)的,甚至是可以標(biāo)準(zhǔn)化的。如。將Transwell小室放入配套培養(yǎng)板中,形成由細(xì)胞可穿透性膜分隔開(kāi)的兩室系統(tǒng),將高營(yíng)養(yǎng)液與低營(yíng)養(yǎng)液分隔開(kāi)。天津豚鼠科研技術(shù)服務(wù)分離
原代細(xì)胞是指在機(jī)體或組織中直接從生物體分離出來(lái)的、未經(jīng)傳代培養(yǎng)的細(xì)胞。這種細(xì)胞保持著其原始的生物學(xué)特性,具有高度的活性和分裂能力。原代細(xì)胞在許多生物醫(yī)學(xué)研究中具有重要地位,包括藥物篩選、疾病模型的建立以及疫苗研發(fā)等。原代細(xì)胞的獲得通常是通過(guò)組織剪切、消化或酶解等方式從機(jī)體或組織中分離出來(lái)。這些細(xì)胞脫離了它們?cè)谏矬w中的環(huán)境,但是仍然保持著其基本的生物學(xué)特性,包括細(xì)胞膜、細(xì)胞核、細(xì)胞器以及其他重要的生物分子。原代細(xì)胞在未經(jīng)過(guò)傳代培養(yǎng)的情況下,保持著其原始的生物學(xué)特性,因此,它們常常被用于藥物篩選、毒理學(xué)研究等。同時(shí),由于原代細(xì)胞具有高度活性和分裂能力,它們也被用于組織工程和再生醫(yī)學(xué)中,如皮膚移植、骨頭修復(fù)和神經(jīng)再生等。此外,原代細(xì)胞模型在疾病研究中也扮演著重要角色。由于原代細(xì)胞具有更高的生物真實(shí)性,使用它們建立的疾病模型能夠更準(zhǔn)確地模擬疾病的發(fā)展過(guò)程和藥物的作用機(jī)制,從而為新藥研發(fā)和疾病治、療提供更有效的工具。總之,原代細(xì)胞是一種具有高度活性和分裂能力的細(xì)胞,在生物醫(yī)學(xué)研究中具有重要的作用。由于其原始的生物學(xué)特性。黑龍江豚鼠科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建細(xì)胞轉(zhuǎn)染又分為瞬時(shí)轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染,瞬時(shí)轉(zhuǎn)染是指外源基因進(jìn)入受體細(xì)胞后.
是整體甲基化進(jìn)程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員,作為個(gè)被發(fā)現(xiàn)的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RNA結(jié)合能力,進(jìn)而調(diào)控pre-mRNA的剪切加工過(guò)程[3]。目前已發(fā)現(xiàn)FTO調(diào)節(jié)異常與肥胖、大腦畸形和生長(zhǎng)遲緩相關(guān),揭示m6A可能對(duì)這些疾病具有重要的調(diào)節(jié)功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被發(fā)現(xiàn)具有去甲基作用的另一個(gè)成員,以RNaseA敏感的方式與核小斑共定位,它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外,ALKBH5和它的去甲基化活性影響新生mRNA合的成和剪切效率[7],且ALKBH5敲除雄性小鼠表現(xiàn)出精子發(fā)生異常,這可能是精子發(fā)生相關(guān)基因表達(dá)改變的結(jié)果[7]。m6AmRNA修飾執(zhí)行其功能主要通過(guò)兩個(gè)途徑:精細(xì)調(diào)控甲基化轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu),以阻止或誘使蛋白-RNA相互作用;或被直接由m6A結(jié)合蛋白識(shí)別,誘發(fā)續(xù)反應(yīng)。目前一類含有YTH功能結(jié)構(gòu)域的蛋白被鑒定為m6A修飾的結(jié)合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2己被證實(shí)是m6A的結(jié)合蛋白.YTHDF1主要影響m6A修飾基因的翻譯,YTHDF2主要影響m6A修飾基因的降解,而YTHDC1結(jié)合m6A修飾的基因影響其剪接。HNRNPC是一種豐富的核RNA結(jié)合蛋白,參與pre-mRNA的加工[8]。
3)基因/蛋白質(zhì)表達(dá)定性或定量檢測(cè)在進(jìn)行分子檢測(cè)的過(guò)程中,保持核酸和蛋白質(zhì)的完整性至關(guān)重要,因此在取樣過(guò)程中,應(yīng)盡量避免核酸及蛋白質(zhì)的降解。如不注意采樣過(guò)程,將會(huì)導(dǎo)致樣本中的核酸及蛋白質(zhì)的無(wú)差別降解,嚴(yán)重影響后續(xù)分子檢測(cè)結(jié)果。在條件允許的情況下,樣本在離體后應(yīng)立刻裝入凍存管內(nèi),并立即放入液氮中進(jìn)行冷凍。在RNA提取樣本的保存過(guò)程中,可以選擇非冷凍型RNA保存液或Trizol試劑進(jìn)行RNA酶的。針對(duì)蛋白質(zhì)提取樣本的保存,我們同樣可以使用商品化的蛋白酶劑進(jìn)行短期處理。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymeraseChnReaction,PCR)及免印跡(Westernblotting,WB),這兩種實(shí)驗(yàn)手段是分子學(xué)檢測(cè)中不可或缺的一部分,也是發(fā)表至關(guān)重要的分子檢測(cè)數(shù)據(jù)。PCR主要用來(lái)對(duì)基因在基因組層面或轉(zhuǎn)錄層面的變化進(jìn)行定性或定量檢測(cè),而WB則主要用來(lái)對(duì)某一蛋白質(zhì)的表達(dá)進(jìn)行定量檢測(cè)。(4)轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及代謝組學(xué)檢測(cè)隨著檢測(cè)水平及相關(guān)產(chǎn)業(yè)的不斷發(fā)展,各類組學(xué)檢測(cè)的價(jià)格降低,實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中也常常運(yùn)用組學(xué)檢測(cè)來(lái)提升實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的檔次。在我們進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)及蛋白質(zhì)組學(xué)的檢測(cè)過(guò)程中,同樣是要首先確保目標(biāo)RNA或蛋白質(zhì)的片段完整性。細(xì)胞核是細(xì)胞的控制中心,它包含了遺傳物質(zhì)DNA,控制著細(xì)胞的生長(zhǎng)和分裂。
m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機(jī)制:通過(guò)m6A甲基化測(cè)序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾病細(xì)胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達(dá)的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機(jī)制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過(guò)qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實(shí)驗(yàn)證明ALKBH5通過(guò)去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達(dá)。為研究ALKBH5對(duì)FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補(bǔ),且共表達(dá)、共定位,進(jìn)一步通過(guò)RIP,RNApulldown等實(shí)驗(yàn)證明lncRNAFOXM1-AS促進(jìn)ALKBH5和FOXM1初級(jí)轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過(guò)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達(dá)和細(xì)胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細(xì)胞中m6A修飾的特征和基因表達(dá)的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進(jìn)了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。人工模型是指通過(guò)人工手段制造的疾病模型。天津豚鼠科研技術(shù)服務(wù)分離
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