轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果及TCGA數(shù)據(jù)庫分析）圖5RNA-Seq和m6A-seq聯(lián)合鑒定SOCS2是介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因PLoSOne2015,在許多不同種類的RNA中，都已觀察到N6-腺苷(m6A)的甲基化，但其在microRNAs中還沒有被研究。研究者在FTO1C1,FTO2D4和FTO3C3細(xì)胞系中，通過敲除m6A甲基轉(zhuǎn)移酶FTO篩選到表達(dá)差異的microRNA,說明miRNA受m6A甲基化的調(diào)控。進(jìn)一步通過MeRIP-Seq發(fā)現(xiàn)相當(dāng)一部分的microRNA具有m6A修飾。通過motif分析，他們發(fā)現(xiàn)了區(qū)分甲基化和非甲基化microRNA的一致序列。該文章所述的表觀遺傳修飾在基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控的復(fù)雜性上增加了一個新的層次。圖FTO敲除對甲基化的miRNAs的穩(wěn)定狀態(tài)的影響。參考文獻(xiàn)Y,DominissiniD,RechaviG,HeC:Geneexpressionregulationmediatedthroughreversiblem(6)(5):(1):(12):(6):(1):(1):(uridine)(41):(6)(7540):(1):(7481):(4):(6)A-LAIC-seqrevealsthecensusandcomplexityofthem(6)(8):UTRm(6)(4):(7544):(6)(6):(5):(7667):(2):"">panstyle="color:#f5c81c;">xiainducesthebreastcancerstemcellphenotypebyHIF-dependentandALKBH5-mediatedm(6)(14):"">panstyle="color:#f5c81c;">(40):(6)(3):(1):(1):(4):(11):。常用于研究細(xì)胞的成瘤能力、細(xì)胞的轉(zhuǎn)移、細(xì)胞的耐藥和靶分子對腫瘤細(xì)胞的發(fā)展的影響等等。天津乳鼠科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建

m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動態(tài)發(fā)布時間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一，目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理，作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理，然后再對打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫測序。對于無修飾的位點，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進(jìn)行分析（圖3）。寧夏裸鼠科研技術(shù)服務(wù)外包動物疾病模型是一種用于研究人類疾病的重要工具。

產(chǎn)品庫科研資訊實驗試用中心技術(shù)專題會議商城生意通品牌求購發(fā)布產(chǎn)品儀器設(shè)備庫細(xì)胞分析儀器儲存保存設(shè)備實驗室箱體/搖床實驗室安全設(shè)備生物芯片3D打印儀器設(shè)備庫生物芯片影像系統(tǒng)測讀系統(tǒng)光譜系統(tǒng)分子生物實驗儀器顯微系統(tǒng)色譜系統(tǒng)質(zhì)譜系統(tǒng)實驗室自動化基因組/蛋白組設(shè)備植物生理/動物生理毒理/實驗動物設(shè)備神經(jīng)生物學(xué)儀器組織學(xué)設(shè)備過濾裝置電化學(xué)儀器細(xì)胞培養(yǎng)儀器耗材庫常用耗材移液器(Pipette)PCR耗材儀器配套耗材細(xì)胞/組織培養(yǎng)耗材分子生物學(xué)耗材耗材庫常用耗材移液器(Pipette)吸頭(Tips)瓶(Bottle)瓶(Flask)管(Tube&Vial)PCR耗材微孔板色譜柱色譜介質(zhì)細(xì)胞/組織培養(yǎng)耗材分子生物學(xué)耗材過濾耗材儀器配套耗材試劑庫細(xì)胞培養(yǎng)細(xì)胞干細(xì)胞免疫檢測/ELISA常用生化試劑酶試劑庫生物分子常用生化試劑酶蛋白質(zhì)/抗原/多肽cDNA及合成純化PCR/RT-PCR/qPCR載體及構(gòu)建文庫及構(gòu)建克隆與表達(dá)表達(dá)分析核酸/蛋白合成核酸分析核酸檢測核酸純化RNAi技術(shù)(siRNA,miRNA。

注意事項1.病毒包裝的幾個關(guān)鍵點主要包括：細(xì)胞因素、載體系統(tǒng)(盡量使用成熟的商業(yè)化載體系統(tǒng))、構(gòu)建重組的質(zhì)粒正確與否、質(zhì)粒抽提純化情況、包裝轉(zhuǎn)染控制(24、48小時的細(xì)胞及熒光狀態(tài)判斷)、目的基因?qū)Σ《景b影響(基因大小、序列情況、蛋白功能毒性等都會影響到是否能包裝成功)。，需要觀察包裝病毒后的48h培養(yǎng)基顏色是否橙紅。3.病毒濃縮：病毒一般在48h和72h各收一次。如果不想濃縮病毒的話，也可以直接將收集的病毒上清作為要的細(xì)胞的培養(yǎng)基，但是可能效果會不太好。并且一般收病毒時，培養(yǎng)基的營養(yǎng)已經(jīng)損耗了很多，那樣直接培養(yǎng)細(xì)胞會損害細(xì)胞，所以建議還是進(jìn)行濃縮后再。常見問題1.包裝病毒時293T細(xì)胞狀態(tài)不好，或者鋪得過密，可以選擇放棄該次實驗。2.目的載體過大，不易。3.避免轉(zhuǎn)染過程以及后續(xù)過程出現(xiàn)的污染。干貨分享｜選對實驗室常用培養(yǎng)基DMEM和1640。

原理以慢病毒包裝為例，主要包括3個質(zhì)粒：質(zhì)粒DNA可以轉(zhuǎn)錄出慢病毒遺傳物質(zhì)(RNA)，但不能翻譯出慢病毒的外殼及蛋白成分的載體質(zhì)粒，其同時含有目的基因和報告基因，psPAX2是可以表達(dá)慢病毒外殼的質(zhì)粒，其表達(dá)產(chǎn)物可通過粘附機制更易穿過細(xì)胞膜。為慢病毒的膜蛋白質(zhì)粒，通過脂質(zhì)體進(jìn)行三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)到靶細(xì)胞基因組中，宿主基因組在表達(dá)時，隨宿主基因轉(zhuǎn)錄出的目的基因RNA與psPAX2、基因翻譯出的蛋白組裝為慢病毒。病毒進(jìn)入細(xì)胞后，其遺傳物質(zhì)RNA逆轉(zhuǎn)錄出DNA，該基因再整合到靶細(xì)胞的基因組中，完成轉(zhuǎn)染過程。因為質(zhì)粒DNA只能轉(zhuǎn)錄出病毒RNA和表達(dá)目的基因卻不能表達(dá)出病毒的外殼和膜蛋白成分，因此其不能像普通的病毒一樣在宿主細(xì)胞能反復(fù)增殖，故對宿主細(xì)胞是無害的并且高效的將目的基因轉(zhuǎn)染到靶細(xì)胞基因組中。用途病毒產(chǎn)生，包裝病毒。材料與儀器無菌1×PBS，對數(shù)期293T細(xì)胞，細(xì)胞計數(shù)器，病毒質(zhì)粒(以慢病毒為例：psPAX2/)，轉(zhuǎn)染試劑(lipMax或者lipo3000)，Polybrene、病毒濃縮液(生物公司有售)等。步驟(1)293T細(xì)胞鋪板取對數(shù)生長期的293T細(xì)胞，用的胰蛋白酶消化293T細(xì)胞，計數(shù)。若是10cm大皿，建議按照10-12×106每皿的數(shù)量將293T細(xì)胞均勻鋪入。若是6孔板。細(xì)胞由細(xì)胞膜、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核和細(xì)胞器等組成。細(xì)胞膜是細(xì)胞的外層，它控制物質(zhì)的進(jìn)出。廣西組織科研技術(shù)服務(wù)分離

實驗技巧——做好細(xì)胞凍存，保證細(xì)胞質(zhì)量。天津乳鼠科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建

原理HE染色主要使用蘇木精和伊紅這兩種染液，其中蘇木精堿性染液為藍(lán)色，可以將組織的酸性結(jié)構(gòu)染成藍(lán)紫色（細(xì)胞核呈現(xiàn)藍(lán)色；軟骨基質(zhì)、鈣鹽顆粒呈深藍(lán)；粘液呈灰藍(lán)）；伊紅是一種化學(xué)合成的酸性染料，在水中解離成帶負(fù)電荷的陰離子，易于蛋白質(zhì)氨基中的正電荷結(jié)合使細(xì)胞漿染色。細(xì)胞漿、肌肉、結(jié)締組織、嗜伊紅顆粒等被染成不同程度的紅色或粉紅色。材料與儀器小鼠、固定液、酒精、二甲苯、石蠟、蜂蠟蘇木精染液、伊紅酒精溶液、鹽酸酒精溶液甘油蛋白粘片劑、中性樹膠石蠟包埋機、切片機、恒溫箱、蠟杯酒精燈、解剖剪、培養(yǎng)皿、鑷子、單面刀片染色缸、蓋玻片、載玻片、玻片盤、顯微鏡溫度計、水浴鍋步驟一、制作卵巢石蠟切片1、取材小鼠腹腔注射戊巴比妥鈉（50mg/kg）進(jìn)行麻醉，頸椎脫臼法處死小鼠，取出雙側(cè)卵巢。取下所需組織，切成一小塊3~4mm厚。2、固定、洗滌、脫水（1）將切好的卵巢組織用生理鹽水洗一下，使用中性福爾馬林固定液固定30~50min。后用流水沖洗3次，每次5min。（2）卵巢組織依次經(jīng)70%、80%、90%乙醇溶液脫水，各30min。（3）再放入95%、100%乙醇溶液各2次，每次20min。3、透明、透蠟（1）使用純酒精、二甲苯等量混合液處理組織15min。天津乳鼠科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建