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來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-03-06

是整體甲基化進(jìn)程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員,作為個(gè)被發(fā)現(xiàn)的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RNA結(jié)合能力,進(jìn)而調(diào)控pre-mRNA的剪切加工過(guò)程[3]。目前已發(fā)現(xiàn)FTO調(diào)節(jié)異常與肥胖、大腦畸形和生長(zhǎng)遲緩相關(guān),揭示m6A可能對(duì)這些疾病具有重要的調(diào)節(jié)功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被發(fā)現(xiàn)具有去甲基作用的另一個(gè)成員,以RNaseA敏感的方式與核小斑共定位,它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外,ALKBH5和它的去甲基化活性影響新生mRNA合的成和剪切效率[7],且ALKBH5敲除雄性小鼠表現(xiàn)出精子發(fā)生異常,這可能是精子發(fā)生相關(guān)基因表達(dá)改變的結(jié)果[7]。m6AmRNA修飾執(zhí)行其功能主要通過(guò)兩個(gè)途徑:精細(xì)調(diào)控甲基化轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu),以阻止或誘使蛋白-RNA相互作用;或被直接由m6A結(jié)合蛋白識(shí)別,誘發(fā)續(xù)反應(yīng)。目前一類含有YTH功能結(jié)構(gòu)域的蛋白被鑒定為m6A修飾的結(jié)合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2己被證實(shí)是m6A的結(jié)合蛋白.YTHDF1主要影響m6A修飾基因的翻譯,YTHDF2主要影響m6A修飾基因的降解,而YTHDC1結(jié)合m6A修飾的基因影響其剪接。HNRNPC是一種豐富的核RNA結(jié)合蛋白,參與pre-mRNA的加工[8]。盡管存在挑戰(zhàn),動(dòng)物疾病模型的發(fā)展前景仍然值得期待。裸鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)

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用伊紅乙醇液對(duì)比染色1~3min。(4)將切片放入95%乙醇中洗去多余的紅色,然后放入無(wú)水乙醇中3~5min,吸干后將切片放入二甲苯Ⅰ、Ⅱ中各3~5min。3、觀察在鏡下可見(jiàn)卵巢呈扁橢圓形,表面為單層扁平上皮細(xì)胞或單層立方上皮,卵巢實(shí)質(zhì)分為皮質(zhì)和髓質(zhì)??梢?jiàn)上皮,原始卵泡和生長(zhǎng)卵泡。卵巢組織中各發(fā)育階段卵泡及卵巢基質(zhì)的形態(tài)結(jié)構(gòu)清晰可見(jiàn),細(xì)胞核呈藍(lán)紫色,細(xì)胞質(zhì)及間質(zhì)成分呈淺紅色,卵泡中卵母細(xì)胞、卵泡細(xì)胞、透明帶均清晰可見(jiàn)。注意事項(xiàng)1.取材注意事項(xiàng)(1)取材動(dòng)作要迅速,不宜作太久的拖延以免組織細(xì)胞的成分、結(jié)構(gòu)等發(fā)生變化。(2)切片材料應(yīng)根據(jù)需要觀察的部位進(jìn)行選擇,盡可能不要損傷所需要的部分。(3)切取的組織塊不宜太大,以利于固定劑穿透,通常以5mmx5mmx2mm或10mmx10mmx2mm為宜。2.固定注意事項(xiàng)(1)一般固定液,都以新配為好,配好后應(yīng)貯存在陰涼處,不宜放在日光下,以免引起化學(xué)變化,失去固定作用。(2)有些混合固定液的成份之間會(huì)發(fā)生氧化還原作用,一定要在使用前才混合,如果混合太早,固定時(shí)就沒(méi)有作用了。(3)固定材料時(shí),固定液必須充足,一般為材料塊的20~30倍,有些水分多的材料,中間應(yīng)更換1~2次新液。(4)材料固定完畢后。天津兔科研技術(shù)服務(wù)分離通過(guò)對(duì)動(dòng)物模型的研究,科研人員可以更清楚地了解疾病的發(fā)展過(guò)程和機(jī)制,為人類疾病的檢查提供理論依據(jù)。

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我們知道WB實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣,一次實(shí)驗(yàn)歷時(shí)也不短,從提蛋白到顯影結(jié)束可能要三天,我們就講一下這里面的一些關(guān)鍵環(huán)節(jié)。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經(jīng)驗(yàn)豐富的WB實(shí)驗(yàn)者都深有體會(huì),蛋白提取是影響結(jié)重要的環(huán)節(jié)之一。該過(guò)程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點(diǎn),一是裂解前注意保持樣品處于低溫環(huán)境中,二是裂解時(shí)加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習(xí)慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環(huán)灌注,然后冰上取腦,分離各腦區(qū)(嗅球,皮層,海馬,中腦,小腦,延髓,丘腦,紋狀體)后置于,用液氮速凍后轉(zhuǎn)移至-80度冰箱長(zhǎng)期保存。接著是保證蛋白濃度,即要加入適量的裂解液,加太少會(huì)使蛋白提取不充分,加太多會(huì)讓蛋白濃度太低,一般經(jīng)驗(yàn)是這樣的,細(xì)胞樣品例如一個(gè)六孔板的細(xì)胞加60微升的裂解液,動(dòng)物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理,具體方案見(jiàn)討論部分。如果沒(méi)有超聲破碎儀,那就用1毫升注射器不斷抽吸,冰上反復(fù)抽吸1分鐘左右,注意不要產(chǎn)生過(guò)多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取,由于文件過(guò)大,又比較血腥,不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘,這里的上樣緩沖液有兩種可選。

m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機(jī)制:通過(guò)m6A甲基化測(cè)序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾病細(xì)胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達(dá)的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機(jī)制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過(guò)qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實(shí)驗(yàn)證明ALKBH5通過(guò)去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達(dá)。為研究ALKBH5對(duì)FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補(bǔ),且共表達(dá)、共定位,進(jìn)一步通過(guò)RIP,RNApulldown等實(shí)驗(yàn)證明lncRNAFOXM1-AS促進(jìn)ALKBH5和FOXM1初級(jí)轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過(guò)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達(dá)和細(xì)胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細(xì)胞中m6A修飾的特征和基因表達(dá)的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進(jìn)了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。常見(jiàn)的5種實(shí)驗(yàn)動(dòng)物取血方式,你掌握幾種?

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必須仔細(xì)考慮所有可能影響實(shí)驗(yàn)的條件和技術(shù)參數(shù)以獲得可重復(fù)且一致的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。因此,要求實(shí)驗(yàn)人員深入了解和熟練掌握操作過(guò)程才能準(zhǔn)確地構(gòu)建CLP模型。造模評(píng)價(jià)該模型通過(guò)模型動(dòng)物自身引發(fā)膿毒癥,與臨床膿毒癥類似的地方在于有連續(xù)分散的細(xì)菌源,血中內(nèi)檢出率及細(xì)菌培養(yǎng)陽(yáng)性率高,動(dòng)物體溫降低以及血流動(dòng)力學(xué)早期高排低阻晚期低排低阻的特征也與臨床相仿,在建模的同時(shí)模擬臨床膿毒癥方法,輔以充分的液體復(fù)蘇和適當(dāng)輔助(如藥物),另外這個(gè)模型可控性高,標(biāo)準(zhǔn)化水平高。該模型中膿毒癥的嚴(yán)重程度受3個(gè)重要因素的影響:結(jié)扎盲腸的長(zhǎng)度、穿孔針的大小和CLP后的支持。結(jié)扎盲腸的長(zhǎng)度是死亡率的主要決定因素,隨著結(jié)扎盲腸的長(zhǎng)度的增加,促炎細(xì)胞因子的水平也在增加。來(lái)源:[1]李晗,田李均,韓旭東.膿毒癥體內(nèi)外模型研究進(jìn)展.中國(guó)與化療雜志,2020,20(01):.[2]彭鳳輝,鄧曉彬,呂立文.膿毒癥動(dòng)物模型的研究進(jìn)展.廣西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào),2020,37。腫瘤細(xì)胞具有極強(qiáng)的增殖能力,在一個(gè)適宜,裸鼠成瘤是常見(jiàn)的驗(yàn)證腫瘤細(xì)胞體內(nèi)增殖模型。山西模式科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)

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且研究表明HNRNPC通過(guò)m6A與RNA結(jié)合調(diào)控目標(biāo)轉(zhuǎn)錄本的豐度和選擇性剪切[9].圖1m6A修飾的酶系統(tǒng)[10]m6A生物學(xué)功能越來(lái)越多的證據(jù)表明m6A修飾在哺乳動(dòng)物中發(fā)揮重要的生物功能。例如,在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控RNA的穩(wěn)定性[11]、定位[12]、運(yùn)輸、剪切[13]和翻譯[14]。ClaudioR.等發(fā)現(xiàn)依賴METTL3的pri-miRNA甲基化,會(huì)促進(jìn)DGCR8識(shí)別和加工,從而促進(jìn)microRNA的成熟[15]。此外,m6A識(shí)別蛋白HNRNPA2B1促進(jìn)pri-miRNA加工成pre-miRNA[16]。另外,環(huán)狀RNA上m6A的修飾能促進(jìn)環(huán)狀RNA的翻譯[17]。m6A修飾在基因表達(dá)調(diào)控中起著重要的作用,其調(diào)控機(jī)制的異??赡芘c人類疾病或相關(guān)。目前發(fā)現(xiàn)m6A可能會(huì)影響精子發(fā)育(ALKBH5,METTL3,Ythdc2)、發(fā)育(METTL3、FTO、ALKBH5)、免疫(METTL3)、UV誘導(dǎo)的DNA損傷反應(yīng)(METTL3,F(xiàn)TO)、生成(YTHDF2)或轉(zhuǎn)移(METTL14)、干細(xì)胞更新(METTL14)、脂肪分化(FTO)、生物節(jié)律、細(xì)胞發(fā)育分化、細(xì)胞分裂及其它的一些生命過(guò)程。例如,ALKBH5敲除的雄性小鼠增加了mRNA中的m(6)A修飾,其特點(diǎn)是凋亡影響減數(shù)分裂中期的精子細(xì)胞,引起生育能力受損[7]。METTL3和METTL14增加弱精癥精子的m6A水平[18],在生殖細(xì)胞中,METTL3的敲除嚴(yán)重抑制精子分化和減數(shù)分裂的發(fā)生。裸鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)