把膜先用TBST泡洗兩遍再用5%脫脂奶粉或者BSA室溫封閉1-2小時(shí)。注意一定要讓蛋白面充分接觸封閉液。2、孵一抗脫脂奶粉封閉的話,要用TBST泡洗三遍再轉(zhuǎn)移至一抗溶液中,BSA封閉的可以直接轉(zhuǎn)移至一抗中。如果膜的寬(膜是一個(gè)長(zhǎng)方形,這里的寬與長(zhǎng)相對(duì)應(yīng))不大于8毫米,我習(xí)慣置于15毫升離心管中孵育,兩條膜"背對(duì)背"式放置于一個(gè)管子里(3毫升液體即可)。如果大于8毫米,就用普通的5格的一抗孵育盒(4毫升即可)。4度過(guò)夜,一般是12-18個(gè)小時(shí),注意放置水平,用搖床。內(nèi)參等蛋白豐度很高的如果孵久了可能出現(xiàn)條帶連在一起的情況,這時(shí)可以縮短孵育時(shí)間或者降低一抗的濃度。六、孵二抗顯影1、孵二抗室溫一個(gè)小時(shí)足矣。這步要注意的是建議用5%BSA或者脫脂奶粉稀釋二抗,這樣背景會(huì)干凈許多。也要注意膜的蛋白面要充分接觸二抗溶液,我們一般一條膜一個(gè)槽地孵。2、顯影這一步有個(gè)細(xì)節(jié)可能有些同學(xué)沒(méi)注意到,就是ECL發(fā)光液要與HRP反應(yīng)一分鐘后顯影效果才會(huì)更好,還有要注意的是顯影液要均勻覆蓋,一般第二次顯影(加新的顯影液)比一次好看。可以普遍應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究、藥物篩選、腫、瘤診斷等領(lǐng)域。江蘇疾病科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建
小鼠尾尖用酒精擦拭尾巴,引起輕微的血管擴(kuò)張;用無(wú)菌手術(shù)刀、刀片或鋒利的剪刀,快速截?cái)嘈∈笪布?-2毫米。如果需要多次,之后每次需截除2-3毫米;從尾部像尾尖方向按摩,增加血流;用采集血液;結(jié)束后,按壓傷口或使用止血?jiǎng)﹣?lái)止血;每次量大約可達(dá)。小鼠眼球取血單手保定好小鼠;必要時(shí)剪掉小鼠胡須,防止污染血液;輕壓取血側(cè)眼部皮膚,使眼球充血突出;用彎頭鑷夾取眼球并快速在摘取;同時(shí)用左手中指輕按小鼠心臟部位,以加快心臟泵血速度;當(dāng)血液流盡時(shí),用脫臼法處死小鼠;大鼠眼眶取血先將小鼠進(jìn)行麻醉,大鼠翻正反射消失時(shí)不在繼續(xù)麻醉;抗凝處理過(guò)的玻璃毛細(xì)采樣管,掰成2-3厘米長(zhǎng)度;右手食指和拇指輕按眼眶兩側(cè)皮膚,使眼球突出,毛細(xì)管從內(nèi)側(cè)的眼球與眼瞼的縫隙處進(jìn)入,輕輕旋轉(zhuǎn)毛細(xì)管,稍微深入眼球后上方,血液流速快的時(shí)候4-5滴即可,溫柔的將毛細(xì)管取出;用棉簽按壓大鼠眼眶止血,每次可取血50-100微升,將血液放入冰盒中保存。小鼠心臟取血先將小鼠麻醉,稍靠右側(cè)平躺在手術(shù)板上固定;左側(cè)第三四根肋骨間觸摸心臟,跳動(dòng)明顯,慢慢進(jìn)針;針有回血停止進(jìn)針,開始取血;一次可以300到500微升,小鼠存活,放到加熱墊上待小鼠蘇醒后放入籠中。黑龍江科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)幫助科研人員深入理解疾病的共同性,還為新藥研發(fā)、疫苗測(cè)試等提供了有效的平臺(tái)。
RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學(xué)修飾,在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)了METTL3(甲基轉(zhuǎn)移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶,在人肝細(xì)胞(HCC)和多種實(shí)體中高表達(dá)。在臨床上,METTL3的過(guò)度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)抑制HCC細(xì)胞增殖,遷移及克隆形成。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng),內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會(huì)促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長(zhǎng)。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細(xì)胞因子信號(hào)2的抑制因子)作為METTL3介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達(dá)會(huì)消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強(qiáng)SOCS2mRNA表達(dá)。m6A介導(dǎo)的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2??傊琈ETTL3在HCC大部分高表達(dá)中,并通過(guò)m6A-YTHDF2依賴機(jī)制抑制SOCS2表達(dá)從而促進(jìn)HCC進(jìn)展。因此,作者發(fā)現(xiàn)了在肝發(fā)生過(guò)程中表觀遺傳改變的一種新機(jī)制。圖4RNA甲基化轉(zhuǎn)移酶METLLT3在肝組織中高表達(dá)。
m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機(jī)制:通過(guò)m6A甲基化測(cè)序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾病細(xì)胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達(dá)的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機(jī)制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過(guò)qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實(shí)驗(yàn)證明ALKBH5通過(guò)去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達(dá)。為研究ALKBH5對(duì)FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補(bǔ),且共表達(dá)、共定位,進(jìn)一步通過(guò)RIP,RNApulldown等實(shí)驗(yàn)證明lncRNAFOXM1-AS促進(jìn)ALKBH5和FOXM1初級(jí)轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過(guò)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達(dá)和細(xì)胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細(xì)胞中m6A修飾的特征和基因表達(dá)的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進(jìn)了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。動(dòng)物疾病模型還為新藥研發(fā)和疫苗測(cè)試提供了有效的平臺(tái)。
痙攣型腦性癱瘓(SCP)大鼠模型【簡(jiǎn)介】痙攣性腦癱指發(fā)育異常引起的運(yùn)動(dòng)和感覺(jué)功能落后,造成肢體肌張力增高、腱反射亢進(jìn)等一系列綜合征。本實(shí)驗(yàn)利用腦立體定位解剖圖譜,對(duì)大鼠的錐體束部位進(jìn)行精確的立體定位,通過(guò)微量注射器對(duì)大腦錐體束所在部位注射無(wú)水乙醇造成錐體束壞死,的模擬了痙攣型腦癱的解剖學(xué)及病理改變,術(shù)后大鼠產(chǎn)生明顯的屈曲痙攣癥狀,且屈肌肌張力增高,癥狀和體持續(xù)時(shí)間較長(zhǎng),穩(wěn)定性良好。從而建立一種可復(fù)制性良好且痙攣持續(xù)時(shí)間較長(zhǎng)的穩(wěn)定的大鼠痙攣型腦癱動(dòng)物模型,為進(jìn)一步深入的探究痙攣型腦癱的基礎(chǔ)研究和臨床診治打下基礎(chǔ)【目的】痙攣型腦性癱瘓(SCP)大鼠模型建立【動(dòng)物】SPF級(jí)SD大鼠,雄性,周齡6~8W,體重:200~250g【方法】1、大鼠麻醉,顱頂脫毛備皮;2、大鼠腦定位儀固定大鼠,顱頂正中切口,長(zhǎng)度約2cm開口暴露前囟及矢狀縫;3、縫線將皮膚左右分開固定,前囟后10mm、矢狀縫左側(cè);4、微量注射器移至開孔處修正骨孔,注射器垂直向顱內(nèi)插入,緩慢注射無(wú)水乙醇15ul,注射完移除注射器,棉球壓迫止血;5、縫合創(chuàng)口后維持25°體溫,等待蘇醒,觀察大鼠狀態(tài)?!居^察】術(shù)后3天模型大鼠攝食減少、右側(cè)肢體跛行、右前肢不負(fù)重、右前肢及右前爪屈曲痙攣明顯??梢詭椭蒲腥藛T深入理解疾病的共同性,即不同物種之間存在的共有病理變化過(guò)程。湖北血液科研技術(shù)服務(wù)購(gòu)買
動(dòng)物疾病模型在科研中有著普遍的應(yīng)用。江蘇疾病科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果及TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析)圖5RNA-Seq和m6A-seq聯(lián)合鑒定SOCS2是介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因PLoSOne2015,在許多不同種類的RNA中,都已觀察到N6-腺苷(m6A)的甲基化,但其在microRNAs中還沒(méi)有被研究。研究者在FTO1C1,FTO2D4和FTO3C3細(xì)胞系中,通過(guò)敲除m6A甲基轉(zhuǎn)移酶FTO篩選到表達(dá)差異的microRNA,說(shuō)明miRNA受m6A甲基化的調(diào)控。進(jìn)一步通過(guò)MeRIP-Seq發(fā)現(xiàn)相當(dāng)一部分的microRNA具有m6A修飾。通過(guò)motif分析,他們發(fā)現(xiàn)了區(qū)分甲基化和非甲基化microRNA的一致序列。該文章所述的表觀遺傳修飾在基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控的復(fù)雜性上增加了一個(gè)新的層次。圖FTO敲除對(duì)甲基化的miRNAs的穩(wěn)定狀態(tài)的影響。參考文獻(xiàn)Y,DominissiniD,RechaviG,HeC:Geneexpressionregulationmediatedthroughreversiblem(6)(5):(1):(12):(6):(1):(1):(uridine)(41):(6)(7540):(1):(7481):(4):(6)A-LAIC-seqrevealsthecensusandcomplexityofthem(6)(8):UTRm(6)(4):(7544):(6)(6):(5):(7667):(2):"">panstyle="color:#f5c81c;">xiainducesthebreastcancerstemcellphenotypebyHIF-dependentandALKBH5-mediatedm(6)(14):"">panstyle="color:#f5c81c;">(40):(6)(3):(1):(1):(4):(11):。江蘇疾病科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建