原理以慢病毒包裝為例,主要包括3個質(zhì)粒:質(zhì)粒DNA可以轉(zhuǎn)錄出慢病毒遺傳物質(zhì)(RNA),但不能翻譯出慢病毒的外殼及蛋白成分的載體質(zhì)粒,其同時含有目的基因和報告基因,psPAX2是可以表達慢病毒外殼的質(zhì)粒,其表達產(chǎn)物可通過粘附機制更易穿過細胞膜。為慢病毒的膜蛋白質(zhì)粒,通過脂質(zhì)體進行三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)到靶細胞基因組中,宿主基因組在表達時,隨宿主基因轉(zhuǎn)錄出的目的基因RNA與psPAX2、基因翻譯出的蛋白組裝為慢病毒。病毒進入細胞后,其遺傳物質(zhì)RNA逆轉(zhuǎn)錄出DNA,該基因再整合到靶細胞的基因組中,完成轉(zhuǎn)染過程。因為質(zhì)粒DNA只能轉(zhuǎn)錄出病毒RNA和表達目的基因卻不能表達出病毒的外殼和膜蛋白成分,因此其不能像普通的病毒一樣在宿主細胞能反復(fù)增殖,故對宿主細胞是無害的并且高效的將目的基因轉(zhuǎn)染到靶細胞基因組中。用途病毒產(chǎn)生,包裝病毒。材料與儀器無菌1×PBS,對數(shù)期293T細胞,細胞計數(shù)器,病毒質(zhì)粒(以慢病毒為例:psPAX2/),轉(zhuǎn)染試劑(lipMax或者lipo3000),Polybrene、病毒濃縮液(生物公司有售)等。步驟(1)293T細胞鋪板取對數(shù)生長期的293T細胞,用的胰蛋白酶消化293T細胞,計數(shù)。若是10cm大皿,建議按照10-12×106每皿的數(shù)量將293T細胞均勻鋪入。若是6孔板。這項技術(shù)可用來將含有上千種不同蛋白質(zhì)的樣品中,分離和濃縮出特定蛋白質(zhì)。河北模式科研技術(shù)服務(wù)實驗室
二甲苯Ⅰ、Ⅱ各15min至透明。(2)放入二甲苯和石蠟等量混合液處理15min,再放入石蠟Ⅰ、Ⅱ透蠟各50~60min。透蠟在恒溫箱內(nèi)進行,箱內(nèi)溫度保持在55~60℃左右。4、包埋(1)用鑷子夾取蠟?zāi)T诰凭珶羯仙约訜幔⒌谷肷僭S從溫箱中取出的純石蠟。(2)再將鑷子在酒精燈上稍加熱,夾取材料將切面朝下放入蠟?zāi)V?,排列整齊,再放上包埋盒,輕輕倒入熔蠟。5、切片、展片、貼片(1)將包埋好的石蠟塊固定在切片機上,調(diào)整厚度調(diào)節(jié)器到所需的切片厚度,一般為4~6μm。(2)切下的組織薄片要放到加熱的水中燙平,再貼到載玻片上,放45℃恒溫箱中烘干。二、HE染色1、脫蠟、復(fù)水(1)保持水浴鍋溫度為60℃,將切片放入干燥的染色缸內(nèi),放入水浴鍋中,30min至蠟熔化。(2)石蠟切片經(jīng)二甲苯Ⅰ、Ⅱ脫蠟各5min,然后放入100%、95%、90%、80%、70%各級酒精溶液中各3~5min,再放入蒸餾水中3min,以便染料可以進入組織。2、染色、脫水(1)切片放入蘇木精中染色約10~30min,用流水沖洗約15min,使切片顏色變藍。(2)將切片放入1%鹽酸乙醇液中褪色,幾秒后見切片變紅、顏色較淺即可,后將切片再放入流水中使其恢復(fù)藍色。(3)切片放入50%、70%、80%乙醇中各3~5min。湖北病理科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建總的來說,動物疾病模型是一種重要的研究工具,可以幫助科學(xué)家們更好地了解疾病的發(fā)生機制和開發(fā)新方法.
如果實驗平臺的儀器需要提前預(yù)約,建議提前規(guī)劃好使用的時間。反復(fù)總結(jié)尋找答案在整個預(yù)實驗的過程中可能會出現(xiàn)很多問題。比如造模效果欠佳、灌胃操作不當(dāng)、腹腔注射操作失誤、使用不當(dāng)?shù)纫饎游锼劳?。每遇到問題都需要自己想辦法解決,可以從導(dǎo)師、師兄師姐、文獻、貼吧、視頻教程等找到答案。比如筆者曾遇到同樣的給,發(fā)現(xiàn)有的大鼠得很深,有的大鼠還活蹦亂跳,在反復(fù)嘗試調(diào)整濃度,給劑量,更換方式,后來才發(fā)現(xiàn)是動物體重秤的準(zhǔn)度有問題,導(dǎo)致體重秤得不準(zhǔn)。因此,需要自己反復(fù)琢磨到底是實驗過程中哪一個環(huán)節(jié)出現(xiàn)問題,逐一排除。也要求在每一個實驗步驟需要標(biāo)準(zhǔn)化,統(tǒng)一化,盡可能的排除干擾因素,這樣方便在遇到問題快的找到答案。同時,建議每日總結(jié),大到動物死亡原因分析,小到灌胃操作耗時多長時間。建議反復(fù)總結(jié)出每天實驗的優(yōu)缺點。做任何一個操作之前,建議提前腦海中反復(fù)模擬,準(zhǔn)備好相關(guān)工具和試劑,避免臨用之際缺少的,影響實驗操作節(jié)奏和個人心情。筆者曾經(jīng)灌胃操作的時候發(fā)現(xiàn)竟然忘帶了,只好重新回實驗室準(zhǔn)備,那真叫一個郁悶。仔細記錄每日實驗過程無論是碩士還是博士,導(dǎo)師給我們上的堂課往往就是交代我們要詳細記好實驗記錄,只要是和實驗相關(guān)的。
用伊紅乙醇液對比染色1~3min。(4)將切片放入95%乙醇中洗去多余的紅色,然后放入無水乙醇中3~5min,吸干后將切片放入二甲苯Ⅰ、Ⅱ中各3~5min。3、觀察在鏡下可見卵巢呈扁橢圓形,表面為單層扁平上皮細胞或單層立方上皮,卵巢實質(zhì)分為皮質(zhì)和髓質(zhì)。可見上皮,原始卵泡和生長卵泡。卵巢組織中各發(fā)育階段卵泡及卵巢基質(zhì)的形態(tài)結(jié)構(gòu)清晰可見,細胞核呈藍紫色,細胞質(zhì)及間質(zhì)成分呈淺紅色,卵泡中卵母細胞、卵泡細胞、透明帶均清晰可見。注意事項1.取材注意事項(1)取材動作要迅速,不宜作太久的拖延以免組織細胞的成分、結(jié)構(gòu)等發(fā)生變化。(2)切片材料應(yīng)根據(jù)需要觀察的部位進行選擇,盡可能不要損傷所需要的部分。(3)切取的組織塊不宜太大,以利于固定劑穿透,通常以5mmx5mmx2mm或10mmx10mmx2mm為宜。2.固定注意事項(1)一般固定液,都以新配為好,配好后應(yīng)貯存在陰涼處,不宜放在日光下,以免引起化學(xué)變化,失去固定作用。(2)有些混合固定液的成份之間會發(fā)生氧化還原作用,一定要在使用前才混合,如果混合太早,固定時就沒有作用了。(3)固定材料時,固定液必須充足,一般為材料塊的20~30倍,有些水分多的材料,中間應(yīng)更換1~2次新液。(4)材料固定完畢后。干貨分享 | PCR反應(yīng)污染原因追蹤及污染處理方法。
m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態(tài)發(fā)布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉(zhuǎn)建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。動物實驗這些取樣細節(jié),你有注意嗎?寧夏疾病科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建
細胞劃痕(wound healing)法是簡捷測定細胞遷移運動和修復(fù)能力的方法。河北模式科研技術(shù)服務(wù)實驗室
采用opti-MEM和Lipo3000分別轉(zhuǎn)染含有目的基因的pMSCV-eGFP、VSV、GAG質(zhì)粒及對照載體,每皿加入脂質(zhì)體-質(zhì)粒轉(zhuǎn)染混懸液按購買脂質(zhì)體相關(guān)說明書操作定量。繼續(xù)培養(yǎng)24h。2)24小時后,將培養(yǎng)基更換為新鮮的DMEM完全培養(yǎng)基,放進細胞培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)48~72h。3)48~72h后收集上層培養(yǎng)液,并過μm濾膜,采用ELISA法對所獲得的慢載體進行滴度測定。如不及時使用可以凍存于-80℃。3、慢轉(zhuǎn)染1)轉(zhuǎn)染前1天將細胞接種6孔培養(yǎng)板,時細胞的融合率約為50%,前需換液,加入1mLDMEM完全培養(yǎng)基。2)冰浴融化后加入相應(yīng)體積的液及聚凝胺(Polybrene),混勻后放入37℃孵箱中繼續(xù)培養(yǎng)3)4h后補充1mL培養(yǎng)基,14h后換液(24h內(nèi)換液即可)。4)72h后用倒置顯微鏡觀察熒光,監(jiān)測效率,出現(xiàn)較多熒光時將等量的轉(zhuǎn)染細胞和未轉(zhuǎn)染細胞分別加入等濃度Puromycin(Puromycin或其他篩選濃度需要事先摸索)。5)待未轉(zhuǎn)染細胞全部死亡并且可觀察到滿意熒光量時,降低Puromycin濃度培養(yǎng)。也可以挑去單克隆細胞株進行進一步培養(yǎng),以得到滿意的穩(wěn)定表達目的基因的細胞株。6)使用qRT-PCR和Westernblot的方法檢測目的基因的表達量和蛋白水平是否顯著提高。7)由此可得三組細胞株:a.正常細胞株;b.空載載體的細胞株。河北模式科研技術(shù)服務(wù)實驗室