圖2MAZTER-Seq實(shí)驗(yàn)流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來作者便是要驗(yàn)證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下,檢測(cè)到的剪切效率高于野生型(剪切效率高低m6A水平),m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠,那檢測(cè)的特異性位點(diǎn)是否準(zhǔn)確呢?作者也將該方法檢測(cè)到的新甲基化位點(diǎn)使用放射標(biāo)記層析檢測(cè),發(fā)現(xiàn)預(yù)測(cè)的位點(diǎn)準(zhǔn)確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中,作者則是與m6A抗體IP的方法進(jìn)行了比較,也證實(shí)了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測(cè)結(jié)果驗(yàn)證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外,后文中作者也在大規(guī)模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態(tài)和酵母減數(shù)分裂模型中檢測(cè)了MAZTER-Seq這一系統(tǒng);并進(jìn)一步通過這一方法檢測(cè)了哺乳動(dòng)物不同細(xì)胞間m6A水平的保守性;也探究了去甲基化酶FTO對(duì)整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術(shù),其他部分暫不過多分析了。新的技術(shù)能拓展我們的研究?jī)?nèi)容;對(duì)于這一技術(shù)。隨著科技的不斷進(jìn)步,科研人員將能夠開發(fā)出更為精確、實(shí)用的動(dòng)物模型,更好地為人類健康保駕護(hù)航。北京動(dòng)物科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室
常見的有理染色、WesternBlot、PCR等),實(shí)驗(yàn)儀器是否需要預(yù)約使用。如果需要外送公司檢測(cè),需要提前聯(lián)系好商家,以及了解清楚樣本如何獲取,如何運(yùn)輸。飼養(yǎng)動(dòng)物及干預(yù)動(dòng)物購買后需要將時(shí)間節(jié)點(diǎn)提前規(guī)劃好,比如,周需要做什么?測(cè)量體重?觀察飲食?測(cè)量需要的指標(biāo)?中間有無特殊操作?比如灌胃、測(cè)量體重、做CT檢測(cè)、取血?……第幾周取材?取材需要哪些?預(yù)實(shí)驗(yàn)方案就要提前設(shè)計(jì)清楚以上內(nèi)容。取材及樣品準(zhǔn)備取材需要提前到動(dòng)物房禁食、稱體重、取出動(dòng)物、手術(shù)的、固定所需要的試劑和EP管,WesternBlot和PCR所需要的樣本儲(chǔ)存條件。比如凍存管、EP管,是否需要冰塊?是否需要液氮?取材當(dāng)天需要多少人?是否需要請(qǐng)人幫忙?如果所需要取出的樣本較多,建議大家請(qǐng)人一起幫忙,流水線作業(yè),這樣能節(jié)省時(shí)間,并且能保證樣品的質(zhì)量。如果請(qǐng)人,每個(gè)人需要負(fù)責(zé)哪一板塊的工作,比如誰負(fù)責(zé),誰負(fù)責(zé)取血液,誰負(fù)責(zé)取,誰負(fù)責(zé)拍照、誰負(fù)責(zé)儲(chǔ)存,都需要提前規(guī)劃交代清楚。實(shí)驗(yàn)指標(biāo)檢測(cè)如果是需要自己做的檢測(cè),比如常見的WesternBlot、PCR,建議提前可以看看教程(無論是視頻還是貼吧,都要自己多方參考)。有了一定的理論基礎(chǔ)后,再向老師、師兄師姐學(xué)習(xí)經(jīng)驗(yàn)和技術(shù)。湖北模式科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建科研小白如何摸索自己的預(yù)實(shí)驗(yàn)。
靜置25分鐘后把酒精倒干,用吸水紙吸出多余的酒精,然后配壓縮膠,同樣的操作,關(guān)鍵是梳子要插得快,要小心梳子下產(chǎn)生氣泡,然后靜置30分鐘。如果是當(dāng)天跑膠,我會(huì)等上層膠凝2個(gè)小時(shí)再用,但要注意防干燥縮水,可以在一個(gè)小時(shí)的時(shí)候沿著梳子上緣加點(diǎn)電泳液。所以我一般提前一晚制膠,泡于純水或者電泳液里置于4度冰箱暫存。三、蛋白電泳1、上樣前準(zhǔn)備把膠組裝到電泳芯上,注意密閉性(否則漏液),如果內(nèi)槽漏液就不是勻強(qiáng)電場(chǎng)了,條帶可能就不是一條直線。然后內(nèi)槽倒?jié)M電泳液,拔梳子,這一步要小心,梳子要兩邊一起緩緩?fù)习纬?,然后觀察泳道內(nèi)有無脫落的膠?;蛘吣z絲,有的話用1毫升注射器吸出。然后從冰箱取出蛋白樣品,解凍。準(zhǔn)備振蕩器。2、上樣和電泳注意,上樣后蛋白會(huì)開始慢慢在膠中彌散,所以上樣越快越好。我習(xí)慣先上蛋白Marker,再上蛋白樣品,蛋白上樣前確保樣品完全解凍和充分振蕩(推薦使用振蕩器振蕩),吸的時(shí)候沒有拉絲即可,建議上樣分鐘把樣品從冰上取出來,不然樣品中SDS可能會(huì)結(jié)晶析出,從而影響電泳效果。上層膠80V25分鐘,下層膠120V65分鐘。四、轉(zhuǎn)膜1、轉(zhuǎn)膜前準(zhǔn)備我會(huì)在電泳結(jié)束0分鐘準(zhǔn)備,把轉(zhuǎn)膜液配好置于4度冰箱預(yù)冷,然后裁膜,準(zhǔn)備轉(zhuǎn)膜裝置。
如胰腺,一般取胰島較多的胰腺尾部;肺應(yīng)取有細(xì)支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實(shí)驗(yàn)需進(jìn)行多樣本的采集,采集順序應(yīng)按照:消化,神經(jīng)系統(tǒng),皮膚,肌肉等的順序進(jìn)行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排,然后決定其切面的走向;如一長(zhǎng)管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周圍的脂肪等,應(yīng)盡可能掉,否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來一些不必要的問題。樣品的固定(1)固定的方法:①小塊固定法:從動(dòng)物取下的小塊,立即置入液態(tài)固定劑(這是應(yīng)用經(jīng)常的方法)。②注射/灌注固定法:某些塊由于體積過大或固定液極難滲入內(nèi)部或需要對(duì)整個(gè)臟器或整個(gè)動(dòng)物進(jìn)行固定,這時(shí)宜采用注射固定法,將固定液注入血管,經(jīng)血管分支到達(dá)整個(gè)和全身,從而得到充分的固定。另,空腔比如肺,肺內(nèi)含有空氣,固定液難以滲入,建議先做肺灌注,使得肺充盈滿固定液以后再進(jìn)行保存,如果空腔中氣體沒有排出,后續(xù)可能影響固定效果(沒有灌注的肺會(huì)浮在液體表面不利于固定,切片以后也會(huì)看到很多的空泡)。③蒸汽固定法:比較細(xì)小而薄的標(biāo)本,可用鋨酸或甲醛蒸汽固定。主要用于血液或細(xì)胞涂片以及某些薄膜的固定。??梢苑€(wěn)定的WB精髓與經(jīng)驗(yàn)分享。
啟醫(yī)療,個(gè)體化用藥貝克曼庫爾特細(xì)胞專題--助力病毒載體純化、細(xì)胞特性分析產(chǎn)品庫儀器設(shè)備耗材試劑抗體技術(shù)服務(wù)生物芯片芯片掃描儀|芯片點(diǎn)樣儀|生物芯片系統(tǒng)|生物芯片|其它測(cè)讀系統(tǒng)洗板機(jī)|多功能篩選系統(tǒng)|大型分析系統(tǒng)|化學(xué)發(fā)光檢測(cè)儀|分光光度計(jì)|其它|光譜系統(tǒng)原子吸收光譜儀|可見光光譜儀|熒光光譜儀|紅外光譜儀|近紅外光譜儀|LIBS光譜儀|拉曼光譜儀|紫外/可見/近紅外光譜儀|其它分子生物實(shí)驗(yàn)儀器電泳設(shè)備|紫外設(shè)備|普通PCR儀|定量PCR儀|數(shù)字PCR儀|DNA/有機(jī)/多肽合成|轉(zhuǎn)基因儀|其它顯微系統(tǒng)倒置顯微鏡|實(shí)體顯微鏡|生物顯微鏡|電子顯微鏡其它顯微鏡|顯微操縱|附件和濾光片|其它色譜系統(tǒng)液相色譜系統(tǒng)|制備液相色譜系統(tǒng)|毛細(xì)管LC系統(tǒng)氣相色譜系統(tǒng)|離子色譜系統(tǒng)|色譜系統(tǒng)檢測(cè)器樣品管理工具|色譜系統(tǒng)附件質(zhì)譜系統(tǒng)飛行質(zhì)譜|四極桿質(zhì)譜|離子阱質(zhì)譜|等離子質(zhì)譜|毛細(xì)管電泳/質(zhì)譜聯(lián)用系統(tǒng)|雜交質(zhì)譜|質(zhì)譜標(biāo)準(zhǔn)品|其它實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化氨基酸分析系統(tǒng)|蛋白純化系統(tǒng)|蛋白質(zhì)翻譯系統(tǒng)|全自動(dòng)分液系統(tǒng)|核酸提取純化全自動(dòng)血液采樣系統(tǒng)|基因組/蛋白組設(shè)備DNA測(cè)序儀|全基因組測(cè)序儀|基因分型系統(tǒng)|雙向電泳系統(tǒng)|蛋白質(zhì)純化|蛋白質(zhì)斑點(diǎn)切取系統(tǒng)|其它神經(jīng)生物學(xué)儀器動(dòng)物功能檢測(cè)設(shè)備|動(dòng)物處理設(shè)備|。可以發(fā)現(xiàn)與疾病發(fā)生相關(guān)的關(guān)鍵基因和蛋白質(zhì),從而為疾病的預(yù)防和檢查提供新的思路。湖南小鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室
細(xì)胞由細(xì)胞膜、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核和細(xì)胞器等組成。細(xì)胞膜是細(xì)胞的外層,它控制物質(zhì)的進(jìn)出。北京動(dòng)物科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室
代謝組學(xué)的研究對(duì)象大都是相對(duì)分子量在1000以內(nèi)的小分子物質(zhì),因此常用的血液樣本在取樣后,應(yīng)小心操作,防止溶血,盡快分離出血清,分置于溫環(huán)境下保存。由于用于理實(shí)驗(yàn)的動(dòng)物采集相對(duì)其他樣品的采集,操作更繁瑣,在處理過程中許多細(xì)節(jié)容易忽略,造成數(shù)據(jù)不完美(甚至不能用)。因此接下來將重點(diǎn)介紹樣品采集的注意事項(xiàng)及其固定。樣品采集注意事項(xiàng)應(yīng)新鮮,操作時(shí)間盡可能短,否則細(xì)胞發(fā)生死后變化、自融及現(xiàn)象。是動(dòng)物心臟還在跳動(dòng)時(shí)采集,樣本取出后在5分鐘以內(nèi)置于固定液內(nèi),避免長(zhǎng)時(shí)間暴露在空氣環(huán)境中。塊盡量小而薄。塊的厚度以不超過5mm為宜,較為理想的厚度為2mm左右,主要目的是使固定液迅速而均勻的滲入塊內(nèi)部。勿使塊受擠壓。在采集過程中,應(yīng)盡量選擇較為鋒利的手術(shù),如手術(shù)刀片等,避免操作過程中擠壓挫傷標(biāo)本。擠壓過的均不可用。固定液的量一般以塊大小的20倍為宜,能夠在容器內(nèi)自由移動(dòng)。盡量保持的原有形態(tài)。新鮮經(jīng)固定后,或多或少產(chǎn)生收縮現(xiàn)象(如胃腸),為此可將展平,以盡可能維持原形。保持清潔。塊上如有血液、污物、粘液、食物、糞便等,可用生理鹽水沖洗,然后再入固定液,但要注意防止損傷。要熟悉采集部位。要能準(zhǔn)確的按解剖部位采集。北京動(dòng)物科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室