采用opti-MEM和Lipo3000分別轉(zhuǎn)染含有目的基因的pMSCV-eGFP、VSV、GAG質(zhì)粒及對照載體,每皿加入脂質(zhì)體-質(zhì)粒轉(zhuǎn)染混懸液按購買脂質(zhì)體相關(guān)說明書操作定量。繼續(xù)培養(yǎng)24h。2)24小時(shí)后,將培養(yǎng)基更換為新鮮的DMEM完全培養(yǎng)基,放進(jìn)細(xì)胞培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)48~72h。3)48~72h后收集上層培養(yǎng)液,并過μm濾膜,采用ELISA法對所獲得的慢載體進(jìn)行滴度測定。如不及時(shí)使用可以凍存于-80℃。3、慢轉(zhuǎn)染1)轉(zhuǎn)染前1天將細(xì)胞接種6孔培養(yǎng)板,時(shí)細(xì)胞的融合率約為50%,前需換液,加入1mLDMEM完全培養(yǎng)基。2)冰浴融化后加入相應(yīng)體積的液及聚凝胺(Polybrene),混勻后放入37℃孵箱中繼續(xù)培養(yǎng)3)4h后補(bǔ)充1mL培養(yǎng)基,14h后換液(24h內(nèi)換液即可)。4)72h后用倒置顯微鏡觀察熒光,監(jiān)測效率,出現(xiàn)較多熒光時(shí)將等量的轉(zhuǎn)染細(xì)胞和未轉(zhuǎn)染細(xì)胞分別加入等濃度Puromycin(Puromycin或其他篩選濃度需要事先摸索)。5)待未轉(zhuǎn)染細(xì)胞全部死亡并且可觀察到滿意熒光量時(shí),降低Puromycin濃度培養(yǎng)。也可以挑去單克隆細(xì)胞株進(jìn)行進(jìn)一步培養(yǎng),以得到滿意的穩(wěn)定表達(dá)目的基因的細(xì)胞株。6)使用qRT-PCR和Westernblot的方法檢測目的基因的表達(dá)量和蛋白水平是否顯著提高。7)由此可得三組細(xì)胞株:a.正常細(xì)胞株;b.空載載體的細(xì)胞株。細(xì)胞劃痕(wound healing)法是簡捷測定細(xì)胞遷移運(yùn)動(dòng)和修復(fù)能力的方法。湖北模式科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)
如胰腺,一般取胰島較多的胰腺尾部;肺應(yīng)取有細(xì)支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實(shí)驗(yàn)需進(jìn)行多樣本的采集,采集順序應(yīng)按照:消化,神經(jīng)系統(tǒng),皮膚,肌肉等的順序進(jìn)行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排,然后決定其切面的走向;如一長管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周圍的脂肪等,應(yīng)盡可能掉,否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來一些不必要的問題。樣品的固定(1)固定的方法:①小塊固定法:從動(dòng)物取下的小塊,立即置入液態(tài)固定劑(這是應(yīng)用經(jīng)常的方法)。②注射/灌注固定法:某些塊由于體積過大或固定液極難滲入內(nèi)部或需要對整個(gè)臟器或整個(gè)動(dòng)物進(jìn)行固定,這時(shí)宜采用注射固定法,將固定液注入血管,經(jīng)血管分支到達(dá)整個(gè)和全身,從而得到充分的固定。另,空腔比如肺,肺內(nèi)含有空氣,固定液難以滲入,建議先做肺灌注,使得肺充盈滿固定液以后再進(jìn)行保存,如果空腔中氣體沒有排出,后續(xù)可能影響固定效果(沒有灌注的肺會(huì)浮在液體表面不利于固定,切片以后也會(huì)看到很多的空泡)。③蒸汽固定法:比較細(xì)小而薄的標(biāo)本,可用鋨酸或甲醛蒸汽固定。主要用于血液或細(xì)胞涂片以及某些薄膜的固定。。江蘇大鼠科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建細(xì)胞器是細(xì)胞內(nèi)的各種功能結(jié)構(gòu),如線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體等,它們各自承擔(dān)著不同的生理功能。
轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果及TCGA數(shù)據(jù)庫分析)圖5RNA-Seq和m6A-seq聯(lián)合鑒定SOCS2是介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因PLoSOne2015,在許多不同種類的RNA中,都已觀察到N6-腺苷(m6A)的甲基化,但其在microRNAs中還沒有被研究。研究者在FTO1C1,FTO2D4和FTO3C3細(xì)胞系中,通過敲除m6A甲基轉(zhuǎn)移酶FTO篩選到表達(dá)差異的microRNA,說明miRNA受m6A甲基化的調(diào)控。進(jìn)一步通過MeRIP-Seq發(fā)現(xiàn)相當(dāng)一部分的microRNA具有m6A修飾。通過motif分析,他們發(fā)現(xiàn)了區(qū)分甲基化和非甲基化microRNA的一致序列。該文章所述的表觀遺傳修飾在基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控的復(fù)雜性上增加了一個(gè)新的層次。圖FTO敲除對甲基化的miRNAs的穩(wěn)定狀態(tài)的影響。參考文獻(xiàn)Y,DominissiniD,RechaviG,HeC:Geneexpressionregulationmediatedthroughreversiblem(6)(5):'(1):(12):(6):(1):(1):(uridine)(41):(6)(7540):(1):(7481):(4):(6)A-LAIC-seqrevealsthecensusandcomplexityofthem(6)(8):'UTRm(6)(4):(7544):(6)(6):(5):(7667):(2):"">panstyle="color:#f5c81c;">xiainducesthebreastcancerstemcellphenotypebyHIF-dependentandALKBH5-mediatedm(6)(14):"">panstyle="color:#f5c81c;">(40):(6)(3):(1):(1):(4):(11):。
常見的有理染色、WesternBlot、PCR等),實(shí)驗(yàn)儀器是否需要預(yù)約使用。如果需要外送公司檢測,需要提前聯(lián)系好商家,以及了解清楚樣本如何獲取,如何運(yùn)輸。飼養(yǎng)動(dòng)物及干預(yù)動(dòng)物購買后需要將時(shí)間節(jié)點(diǎn)提前規(guī)劃好,比如,周需要做什么?測量體重?觀察飲食?測量需要的指標(biāo)?中間有無特殊操作?比如灌胃、測量體重、做CT檢測、取血?……第幾周取材?取材需要哪些?預(yù)實(shí)驗(yàn)方案就要提前設(shè)計(jì)清楚以上內(nèi)容。取材及樣品準(zhǔn)備取材需要提前到動(dòng)物房禁食、稱體重、取出動(dòng)物、手術(shù)的、固定所需要的試劑和EP管,WesternBlot和PCR所需要的樣本儲存條件。比如凍存管、EP管,是否需要冰塊?是否需要液氮?取材當(dāng)天需要多少人?是否需要請人幫忙?如果所需要取出的樣本較多,建議大家請人一起幫忙,流水線作業(yè),這樣能節(jié)省時(shí)間,并且能保證樣品的質(zhì)量。如果請人,每個(gè)人需要負(fù)責(zé)哪一板塊的工作,比如誰負(fù)責(zé),誰負(fù)責(zé)取血液,誰負(fù)責(zé)取,誰負(fù)責(zé)拍照、誰負(fù)責(zé)儲存,都需要提前規(guī)劃交代清楚。實(shí)驗(yàn)指標(biāo)檢測如果是需要自己做的檢測,比如常見的WesternBlot、PCR,建議提前可以看看教程(無論是視頻還是貼吧,都要自己多方參考)。有了一定的理論基礎(chǔ)后,再向老師、師兄師姐學(xué)習(xí)經(jīng)驗(yàn)和技術(shù)。瘤細(xì)胞的增殖活性,從而更好地評估腫、瘤的惡性程度和預(yù)后.
轉(zhuǎn)錄組和m6A分析顯示精子發(fā)生相關(guān)基因的表達(dá)和選擇性剪接發(fā)生了改變[19]。YTHDC2可促進(jìn)靶基因的翻譯效率,并降低其mRNA的豐度,在精子發(fā)生過程中起關(guān)鍵作用。當(dāng)減數(shù)分裂開始時(shí)YTHDC2表達(dá)上調(diào),YTHDC2敲除小鼠的生殖細(xì)胞沒有經(jīng)過偶線期的發(fā)育導(dǎo)致小鼠不育[20]。在DNA損傷反應(yīng)中,METTL3可促進(jìn)DNA聚合酶κ(Polκ)與核酸剪切修復(fù)途徑快速定位到UV引起的DNA損傷位點(diǎn),當(dāng)缺失METTL3時(shí),細(xì)胞無法迅速修復(fù)UV照射引起的突變,并且對UV照射更加敏感[25]。在淋巴細(xì)胞性小鼠過繼轉(zhuǎn)移模型中,Mettl3缺陷通過影響mRNAm6A修飾,降低SOCS家族mRNA衰減,增加mRNA和蛋白表達(dá)水平,從而抑制IL-7介導(dǎo)的STAT5活性和T細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)增殖和分化,進(jìn)而抑制腸炎的發(fā)生[21]。在肝中,METTL14通過調(diào)控pri-miRNA的m6A修飾,影響MiR-126的生成加工,從而抑制肝的轉(zhuǎn)移[22]。在乳腺細(xì)胞中,低氧刺激能促進(jìn)依賴低氧誘導(dǎo)因子HIF的ALKBH5的表達(dá),而ALKBH5過表達(dá)降低了NANOGmRNA的m6A修飾,從而穩(wěn)定mRNA提高NANOG的表達(dá)水平,終增加乳腺干細(xì)胞所占的比例[23]。此外,低氧誘導(dǎo)乳腺細(xì)胞中依賴ZNF217的NANOG和KLF4的mRNAm6A甲基化抑制,且ALKBH5敲除降低免疫缺陷小鼠乳腺的肺轉(zhuǎn)移[24]。在肺中。細(xì)胞污染的處理的技術(shù)。浙江動(dòng)物科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)
動(dòng)物疾病模型作為研究工具,在探索疾病發(fā)展和檢查的過程中發(fā)揮了巨大的作用。湖北模式科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)
原理以慢病毒包裝為例,主要包括3個(gè)質(zhì)粒:質(zhì)粒DNA可以轉(zhuǎn)錄出慢病毒遺傳物質(zhì)(RNA),但不能翻譯出慢病毒的外殼及蛋白成分的載體質(zhì)粒,其同時(shí)含有目的基因和報(bào)告基因,psPAX2是可以表達(dá)慢病毒外殼的質(zhì)粒,其表達(dá)產(chǎn)物可通過粘附機(jī)制更易穿過細(xì)胞膜。為慢病毒的膜蛋白質(zhì)粒,通過脂質(zhì)體進(jìn)行三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)到靶細(xì)胞基因組中,宿主基因組在表達(dá)時(shí),隨宿主基因轉(zhuǎn)錄出的目的基因RNA與psPAX2、基因翻譯出的蛋白組裝為慢病毒。病毒進(jìn)入細(xì)胞后,其遺傳物質(zhì)RNA逆轉(zhuǎn)錄出DNA,該基因再整合到靶細(xì)胞的基因組中,完成轉(zhuǎn)染過程。因?yàn)橘|(zhì)粒DNA只能轉(zhuǎn)錄出病毒RNA和表達(dá)目的基因卻不能表達(dá)出病毒的外殼和膜蛋白成分,因此其不能像普通的病毒一樣在宿主細(xì)胞能反復(fù)增殖,故對宿主細(xì)胞是無害的并且高效的將目的基因轉(zhuǎn)染到靶細(xì)胞基因組中。用途病毒產(chǎn)生,包裝病毒。材料與儀器無菌1×PBS,對數(shù)期293T細(xì)胞,細(xì)胞計(jì)數(shù)器,病毒質(zhì)粒(以慢病毒為例:psPAX2/),轉(zhuǎn)染試劑(lipMax或者lipo3000),Polybrene、病毒濃縮液(生物公司有售)等。步驟(1)293T細(xì)胞鋪板取對數(shù)生長期的293T細(xì)胞,用的胰蛋白酶消化293T細(xì)胞,計(jì)數(shù)。若是10cm大皿,建議按照10-12×106每皿的數(shù)量將293T細(xì)胞均勻鋪入。若是6孔板。湖北模式科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)