m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機(jī)制:通過(guò)m6A甲基化測(cè)序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾病細(xì)胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達(dá)的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機(jī)制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過(guò)qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實(shí)驗(yàn)證明ALKBH5通過(guò)去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達(dá)。為研究ALKBH5對(duì)FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補(bǔ),且共表達(dá)、共定位,進(jìn)一步通過(guò)RIP,RNApulldown等實(shí)驗(yàn)證明lncRNAFOXM1-AS促進(jìn)ALKBH5和FOXM1初級(jí)轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過(guò)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達(dá)和細(xì)胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細(xì)胞中m6A修飾的特征和基因表達(dá)的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀(guān)遺傳改變極大地促進(jìn)了人類(lèi)癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀(guān)遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。細(xì)胞是生命的基本單位,所有生物體都是由一個(gè)或多個(gè)細(xì)胞組成的。下面就跟著上海東寰一起看看吧。上海疾病模型科研技術(shù)服務(wù)外包
圖2MAZTER-Seq實(shí)驗(yàn)流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來(lái)作者便是要驗(yàn)證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下,檢測(cè)到的剪切效率高于野生型(剪切效率高低m6A水平),m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠,那檢測(cè)的特異性位點(diǎn)是否準(zhǔn)確呢?作者也將該方法檢測(cè)到的新甲基化位點(diǎn)使用放射標(biāo)記層析檢測(cè),發(fā)現(xiàn)預(yù)測(cè)的位點(diǎn)準(zhǔn)確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中,作者則是與m6A抗體IP的方法進(jìn)行了比較,也證實(shí)了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測(cè)結(jié)果驗(yàn)證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外,后文中作者也在大規(guī)模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態(tài)和酵母減數(shù)分裂模型中檢測(cè)了MAZTER-Seq這一系統(tǒng);并進(jìn)一步通過(guò)這一方法檢測(cè)了哺乳動(dòng)物不同細(xì)胞間m6A水平的保守性;也探究了去甲基化酶FTO對(duì)整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術(shù),其他部分暫不過(guò)多分析了。新的技術(shù)能拓展我們的研究?jī)?nèi)容;對(duì)于這一技術(shù)。山西小鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)科研小白如何摸索自己的預(yù)實(shí)驗(yàn)。
膿毒癥動(dòng)物模型必須具備以下基本要素:有膿毒癥典型的高排低阻血流動(dòng)力學(xué)表現(xiàn)和高代謝狀態(tài);伴發(fā)多個(gè)功能障礙;有較高的自然死亡率,根據(jù)膿毒癥的轉(zhuǎn)歸,要求動(dòng)物模型的自然死亡率達(dá)到50%~70%;膿毒癥是嚴(yán)重引起機(jī)體的炎癥反應(yīng)過(guò)度造成的自身?yè)p傷,不是細(xì)菌和內(nèi)對(duì)機(jī)體的直接損傷,故出現(xiàn)功能障礙及動(dòng)物死亡距膿毒癥模型制備應(yīng)有一定的時(shí)間間距。一般在制模后6~12h后發(fā)生的功能障礙或死亡屬全身炎癥反應(yīng)所致。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的選擇在制作動(dòng)物模型時(shí)多選用雄性小鼠,因?yàn)榇菩孕∈筝^雄性小鼠更能耐受膿毒癥和失血性休克,且進(jìn)入發(fā)期的雌性小鼠性水平變化很大,而雄性小鼠在膿毒癥時(shí)更易于發(fā)生免疫抑制。為什么選擇CLP模型?盲腸結(jié)扎穿孔模型(CLP)模型是接近于人類(lèi)膿毒癥機(jī)制的模型,被稱(chēng)為膿毒癥模型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。CLP技術(shù)在20世紀(jì)70年代被建立。CLP模型非常適宜用于防治膿毒癥或膿毒性休克新藥的臨床前觀(guān)察造模方法CLP膿毒癥模型的建立主要分為兩個(gè)階段:盲腸遠(yuǎn)端結(jié)扎和盲腸穿刺。首先是手術(shù)引發(fā)的結(jié)扎部位組織變性壞死引起局部炎癥反應(yīng),其次是穿孔后使糞便內(nèi)容物漏入腹膜引起多菌性細(xì)菌性腹膜炎,進(jìn)而誘發(fā)全身性炎癥反應(yīng)。
產(chǎn)品庫(kù)科研資訊實(shí)驗(yàn)試用中心技術(shù)專(zhuān)題會(huì)議商城生意通品牌求購(gòu)發(fā)布產(chǎn)品儀器設(shè)備庫(kù)細(xì)胞分析儀器儲(chǔ)存保存設(shè)備實(shí)驗(yàn)室箱體/搖床實(shí)驗(yàn)室安全設(shè)備生物芯片3D打印儀器設(shè)備庫(kù)生物芯片影像系統(tǒng)測(cè)讀系統(tǒng)光譜系統(tǒng)分子生物實(shí)驗(yàn)儀器顯微系統(tǒng)色譜系統(tǒng)質(zhì)譜系統(tǒng)實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化基因組/蛋白組設(shè)備植物生理/動(dòng)物生理毒理/實(shí)驗(yàn)動(dòng)物設(shè)備神經(jīng)生物學(xué)儀器組織學(xué)設(shè)備過(guò)濾裝置電化學(xué)儀器細(xì)胞培養(yǎng)儀器耗材庫(kù)常用耗材移液器(Pipette)PCR耗材儀器配套耗材細(xì)胞/組織培養(yǎng)耗材分子生物學(xué)耗材耗材庫(kù)常用耗材移液器(Pipette)吸頭(Tips)瓶(Bottle)瓶(Flask)管(Tube&Vial)PCR耗材微孔板色譜柱色譜介質(zhì)細(xì)胞/組織培養(yǎng)耗材分子生物學(xué)耗材過(guò)濾耗材儀器配套耗材試劑庫(kù)細(xì)胞培養(yǎng)細(xì)胞干細(xì)胞免疫檢測(cè)/ELISA常用生化試劑酶試劑庫(kù)生物分子常用生化試劑酶蛋白質(zhì)/抗原/多肽cDNA及合成純化PCR/RT-PCR/qPCR載體及構(gòu)建文庫(kù)及構(gòu)建克隆與表達(dá)表達(dá)分析核酸/蛋白合成核酸分析核酸檢測(cè)核酸純化RNAi技術(shù)(siRNA,miRNA。裸鼠皮下成瘤模型造模意義.
用途基因功能研究、免/殺傷/增殖等、抗體活性篩選(細(xì)胞水平的結(jié)合和阻斷)、CAR分子的殺傷活性評(píng)價(jià)。材料與儀器(以慢pMSCV載體為例)包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV質(zhì)粒、帶有eGFP-Tag的pMSCV空載質(zhì)粒、GAG質(zhì)粒、VSV質(zhì)粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T細(xì)胞、opti-MEM、DMEM、FBS、雙抗、μm的濾膜、熒光顯微鏡等。步驟1、基因的構(gòu)建1)根據(jù)目的基因mRNA編碼區(qū)設(shè)計(jì)引物,分別在引物兩端加入酶切位點(diǎn)EcoRI和BglII。2)從細(xì)胞中提取目的基因mRNA,然后逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,然后從cDNA里面用引物把目的基因的CDS區(qū)擴(kuò)增出來(lái)。PCR擴(kuò)增出帶有酶切位點(diǎn)的目的基因編碼區(qū)序列,連接至pMD19-T載體后轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α,分別進(jìn)行菌落PCR鑒定和酶切鑒定。3)使用EcoRI和BglII雙酶切下目的基因序列,電泳割膠回收純化,連接到pMSCV-eGFP載體。再次轉(zhuǎn)化到感受態(tài)DH5α,菌落PCR鑒定和酶切鑒定成功后,送至公司測(cè)序、鑒定。4)鑒定成功后,將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α中,并進(jìn)行無(wú)內(nèi)質(zhì)粒抽提。GAG質(zhì)粒和VSV質(zhì)粒同樣可以轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α中,并進(jìn)行無(wú)內(nèi)質(zhì)粒抽提。質(zhì)粒抽提后冷凍于-20℃保存。2、慢包裝1)使用DMEM完全培養(yǎng)基培養(yǎng)6cm皿HEK293T至匯合度為70~80%。由于大部分研究使用到的是人類(lèi)來(lái)源的細(xì)胞,種植到免疫正常的動(dòng)物體內(nèi)會(huì)發(fā)生免疫排斥反應(yīng)。貴州乳鼠科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建
常見(jiàn)的5種實(shí)驗(yàn)動(dòng)物取血方式,你掌握幾種?上海疾病模型科研技術(shù)服務(wù)外包
用伊紅乙醇液對(duì)比染色1~3min。(4)將切片放入95%乙醇中洗去多余的紅色,然后放入無(wú)水乙醇中3~5min,吸干后將切片放入二甲苯Ⅰ、Ⅱ中各3~5min。3、觀(guān)察在鏡下可見(jiàn)卵巢呈扁橢圓形,表面為單層扁平上皮細(xì)胞或單層立方上皮,卵巢實(shí)質(zhì)分為皮質(zhì)和髓質(zhì)??梢?jiàn)上皮,原始卵泡和生長(zhǎng)卵泡。卵巢組織中各發(fā)育階段卵泡及卵巢基質(zhì)的形態(tài)結(jié)構(gòu)清晰可見(jiàn),細(xì)胞核呈藍(lán)紫色,細(xì)胞質(zhì)及間質(zhì)成分呈淺紅色,卵泡中卵母細(xì)胞、卵泡細(xì)胞、透明帶均清晰可見(jiàn)。注意事項(xiàng)1.取材注意事項(xiàng)(1)取材動(dòng)作要迅速,不宜作太久的拖延以免組織細(xì)胞的成分、結(jié)構(gòu)等發(fā)生變化。(2)切片材料應(yīng)根據(jù)需要觀(guān)察的部位進(jìn)行選擇,盡可能不要損傷所需要的部分。(3)切取的組織塊不宜太大,以利于固定劑穿透,通常以5mmx5mmx2mm或10mmx10mmx2mm為宜。2.固定注意事項(xiàng)(1)一般固定液,都以新配為好,配好后應(yīng)貯存在陰涼處,不宜放在日光下,以免引起化學(xué)變化,失去固定作用。(2)有些混合固定液的成份之間會(huì)發(fā)生氧化還原作用,一定要在使用前才混合,如果混合太早,固定時(shí)就沒(méi)有作用了。(3)固定材料時(shí),固定液必須充足,一般為材料塊的20~30倍,有些水分多的材料,中間應(yīng)更換1~2次新液。(4)材料固定完畢后。上海疾病模型科研技術(shù)服務(wù)外包