m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動態(tài)發(fā)布時間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一，目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理，作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理，然后再對打斷的RNA進行逆轉(zhuǎn)建庫測序。對于無修飾的位點，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析（圖3）。干貨分享｜選對實驗室常用培養(yǎng)基DMEM和1640。天津模式科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)

    制作該模型的方法為大鼠腹腔麻醉消毒后選取腹部正中切口打開腹腔長約2cm，尋找盲腸，小心分離其遠(yuǎn)端與大腸的系膜，在盲腸遠(yuǎn)端1/2處用無菌4號絲線緊緊結(jié)扎，并用無菌7號針頭在已結(jié)扎盲腸遠(yuǎn)端處貫通穿刺，然后把盲腸推回腹腔，關(guān)閉腹腔。影響因素多數(shù)研究一致認(rèn)為盲腸結(jié)扎位置是CLP模型中死亡率和疾病嚴(yán)重程度的主要決定因素。結(jié)論為：①結(jié)扎25%或以下的盲腸死亡率幾乎為零，為輕度膿毒癥；②結(jié)扎50%～60%的盲腸導(dǎo)致術(shù)后死亡率為60%，為中度膿毒癥；③結(jié)扎75%或以上的盲腸導(dǎo)致小鼠在術(shù)后2～3d內(nèi)全部死亡，為重度膿毒癥。而在不同程度膿毒癥中，死亡主要集中在初的48h內(nèi)。有研究通過改變盲腸結(jié)扎位置和穿刺針直徑來調(diào)節(jié)膿毒癥的嚴(yán)重程度，其中提到與結(jié)扎長度小于1cm的小鼠相比，結(jié)扎長度超過1cm的小鼠死亡率增加至100%；增加穿刺針的直徑也使得存活率從100%（22G針）降低至55%（19G針）。結(jié)論為：在上述兩個因素中，盲腸結(jié)扎位置比針頭大小影響更為。CLP誘導(dǎo)的膿毒癥術(shù)后6h即可出現(xiàn)菌血癥，術(shù)后約12h出現(xiàn)膿毒癥相關(guān)臨床癥狀，包括發(fā)熱、寒戰(zhàn)、毛發(fā)豎立、全身無力和活動減少等，術(shù)后18h開始死亡。總之，在制作CLP模型時。浙江病理科研技術(shù)服務(wù)實驗細(xì)胞是生命的基本單位，所有生物體都是由一個或多個細(xì)胞組成的。下面就跟著上海東寰一起看看吧。

    RNA甲基化修飾（m6A）研究RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上，而N6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine,m6A）是高等生物mRNA和lncRNAs上為普遍的修飾。目前發(fā)現(xiàn)microRNA，circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發(fā)生m6A修飾。m6A修飾主要發(fā)生在RRACH序列中的腺嘌呤上，其功能由“編碼器(Writer)”、“消碼器(Eraser)”和“讀碼器(Reader)”決定[1]?！熬幋a器(Writer)”即甲基轉(zhuǎn)移酶，目前已知這個復(fù)合物的成分有METTL3，METTL14,WTAP和KIAA1429；而ALKBH5和FTO作為去甲基酶（消碼器）可逆轉(zhuǎn)甲基化；m6A由m6A結(jié)合蛋白識別，目前發(fā)現(xiàn)m6A結(jié)合蛋白（讀碼器）有YTH結(jié)構(gòu)域蛋白（包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3，YTHDC1和YTHDC2）和核不均一蛋白HNRNP家族（HNRNPA2B1和HNRNPC）。m6A酶系統(tǒng)METTL3是早先被鑒定為結(jié)合SAM的組件，其缺失引起小鼠胚胎干細(xì)胞、Hela細(xì)胞和HepG2細(xì)胞中m6Apeaks的減少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的細(xì)胞核內(nèi)亞細(xì)胞器－核小斑（Nuclearspeckle）上，顯示ｍ６Ａ修飾可能和ＲＮＡ的剪切加工相關(guān)。WTAP與METTL3–METTL14二聚體相互作用，并共定位于核小斑，影響甲基化效率，參與mRNA剪。而KIAA1429作為候選的甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體的新亞基。

    在人類疾病研究中數(shù)據(jù)表明，常用實驗動物模型按產(chǎn)生原因分為以下5類：自發(fā)性動物模型、誘發(fā)型動物模型、遺傳工程動物模型、生物醫(yī)學(xué)動物模型和陰性動物模型。下面上海研錄帶大家一起看看吧：1、自發(fā)性動物模型：是指動物未經(jīng)任何有意識的人工處理，在自然條件下或基因突變條件下所產(chǎn)生的疾病模型。主要包括突變型的遺傳病模型和近郊系的疾病模型。2、誘發(fā)型動物模型：亦稱實驗性動物模型。是使用物理、化學(xué)或生物致病因素誘導(dǎo)動物產(chǎn)生某些類似人類疾病表現(xiàn)而制備的動物模型。此模型具有制備方法簡單，實驗條件容易控制，重復(fù)性好等特點，廣泛應(yīng)用于藥物篩選、毒理、傳染病、病理機制的研究。3、遺傳工程動物模型：是利用遺傳工程技術(shù)對動物基因組進行修飾，用于研究基因功能或疾病機制的動物模型。也稱基因修飾動物模型，是指利用胚胎工程和基因工程等生物技術(shù)有目的的干預(yù)動物的遺傳組成，導(dǎo)致動物出現(xiàn)新的性狀，并使其能夠有效地遺傳下去，形成新的可供生命科學(xué)研究的和其他目的所用的動物模型。4、生物醫(yī)學(xué)動物模型：也是指利用健康生物的特定生物學(xué)特征，研究人類疾病相似表現(xiàn)得模型。這類動物模型與人類疾病存在一定的差異，研究者應(yīng)加以比較，從中獲得有關(guān)材料。建立疾病模型的目的是為了防治人類疾病。

    2）固定的目的①保持其原有狀態(tài)：使細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)、脂肪、糖、酶等成分轉(zhuǎn)變?yōu)椴蝗苄晕镔|(zhì)，迅速防止、細(xì)胞的死后變化，防止自溶與，防止細(xì)胞過度收縮或膨脹而失去其原有形態(tài)結(jié)構(gòu)，使之盡量保持生前的狀態(tài)和結(jié)構(gòu)。②以便染色后易于鑒別和觀察：不同成分對染料有不同的親和力，以便染色后易于鑒別和觀察。③使塊硬化，便于制作薄片（塊在脫水、包埋、切片、染色等過程中不易損壞）。（3）固定液固定液種類：一類是單純固定液，即只有一種試劑；另一類是混合固定液，由兩種或兩種以上試劑組成。作為較好的固定液，應(yīng)有下列特性，首先，有強滲透力，能迅速的滲入內(nèi)部；其次，不使過度收縮或膨脹，并能使內(nèi)欲觀察的成分得以凝固為不溶性物質(zhì)；能使達(dá)到一定的硬度并獲得較佳的折光率和對某些染料具有較強的親和力。固定液通常使用10%的甲醛溶液。特殊要求的，常需要特殊的固定液，取樣之前應(yīng)做好準(zhǔn)備。如眼球樣本應(yīng)使用FAS眼球固定液，脂肪應(yīng)使用脂肪固定液等。此外，在進行骨樣本制備的時候，還應(yīng)注意提前進行脫鈣處理，可根據(jù)具體情況選擇慢脫鈣或快脫鈣處理?？偟膩碚f，樣品的采集是實驗中至關(guān)重要的一環(huán)，如果取樣環(huán)節(jié)出現(xiàn)了偏差，往往會導(dǎo)致后續(xù)檢測結(jié)果的偏移。EdU細(xì)胞增殖檢測是一種新型的細(xì)胞增殖檢測方法。湖南疾病模型科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)

ELISA試劑盒在國內(nèi)有許多種叫法，例如：ELISA檢測試劑盒、ELISAKit。天津模式科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)

    一種是用beta巰基乙醇打開蛋白質(zhì)分子二硫鍵的，另一種是用DTT(二硫蘇糖醇)。兩者的作用是一樣的，但特點不一樣，前者更容易與氧氣反應(yīng)，穩(wěn)定性比后者差，如果在常溫下暴露在空中，前者只能維持24小時的活性，后者卻可以維持7天左右。所以該如何選擇?如果是蛋白樣品較少，跑幾次就可以用完的樣品，這時選擇beta巰基乙醇。如果樣品很多，計劃跑上幾十次的，優(yōu)先選擇DTT,建議變性后分裝保存。二、SDS-PAGE凝膠配制1、配膠前準(zhǔn)備首先強調(diào)一下，一塊好的膠是跑好蛋白的前提，所以這個環(huán)節(jié)也不容忽視。玻璃板的選擇，一種是1毫米厚度的，另一種是，這個厚度選擇也是有講究的，如果上樣體積小于10微升，優(yōu)先選1毫米，否則選。原因是什么?答案在轉(zhuǎn)膜部分揭曉。還有分離膠的濃度也要選擇適合的。然后玻璃板和梳子要洗干凈，晾干。裝板，注意厚板和薄板的底部要對齊，否則會漏膠。加制膠的各成分前，要觀察液體是否有沉淀，有沉淀的盡量不要用。2、制膠按配方說明依次加入各組分，加完SDS后先簡單手動搖勻幾下，然后迅速加入過硫酸銨和TEMED,搖勻，緊接著就灌膠。然后我習(xí)慣用95%的酒精壓膠，我也用過純水，感覺純水壓沒那么好，由于水的密度較大，會把分界處的膠壓得膨大。天津模式科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)