我們知道WB實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣,一次實(shí)驗(yàn)歷時(shí)也不短,從提蛋白到顯影結(jié)束可能要三天,我們就講一下這里面的一些關(guān)鍵環(huán)節(jié)。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經(jīng)驗(yàn)豐富的WB實(shí)驗(yàn)者都深有體會(huì),蛋白提取是影響結(jié)重要的環(huán)節(jié)之一。該過(guò)程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點(diǎn),一是裂解前注意保持樣品處于低溫環(huán)境中,二是裂解時(shí)加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習(xí)慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環(huán)灌注,然后冰上取腦,分離各腦區(qū)(嗅球,皮層,海馬,中腦,小腦,延髓,丘腦,紋狀體)后置于,用液氮速凍后轉(zhuǎn)移至-80度冰箱長(zhǎng)期保存。接著是保證蛋白濃度,即要加入適量的裂解液,加太少會(huì)使蛋白提取不充分,加太多會(huì)讓蛋白濃度太低,一般經(jīng)驗(yàn)是這樣的,細(xì)胞樣品例如一個(gè)六孔板的細(xì)胞加60微升的裂解液,動(dòng)物組織的話(huà)每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理,具體方案見(jiàn)討論部分。如果沒(méi)有超聲破碎儀,那就用1毫升注射器不斷抽吸,冰上反復(fù)抽吸1分鐘左右,注意不要產(chǎn)生過(guò)多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取,由于文件過(guò)大,又比較血腥,不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘,這里的上樣緩沖液有兩種可選。動(dòng)物模型的表現(xiàn)與人類(lèi)疾病可能存在差異,因此需要謹(jǐn)慎使用。河北組織科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)
動(dòng)物模型在科研中有著普遍的應(yīng)用。首先,它們可以幫助科研人員深入理解的共同性,即不同物種之間存在的共有理變化過(guò)程。通過(guò)對(duì)動(dòng)物模型的研究,科研人員可以更清楚地了解的發(fā)展過(guò)程和機(jī)制,為人類(lèi)的檢查提供理論依據(jù)。其次,動(dòng)物模型還為新研發(fā)和苗測(cè)試提供了的平臺(tái)。在研發(fā)過(guò)程中,科研人員可以通過(guò)對(duì)動(dòng)物模型進(jìn)行處理,觀察其和副作用,為新的臨床試驗(yàn)提供依據(jù)。而在苗測(cè)試中,動(dòng)物模型則可以用來(lái)評(píng)估苗的性和安全性。此外,動(dòng)物模型還為科研人員提供了研究人類(lèi)的跨學(xué)科方法。例如,通過(guò)比較人類(lèi)和動(dòng)物模型的基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等數(shù)據(jù),可以發(fā)現(xiàn)與發(fā)生相關(guān)的關(guān)鍵基因和蛋白質(zhì),從而為的和檢查提供新的思路。雖然動(dòng)物模型在科研中發(fā)揮了巨大的作用,但也存在一些挑戰(zhàn)。首先,由于物種差異的存在,動(dòng)物模型的表現(xiàn)與人類(lèi)可能存在差異,因此需要謹(jǐn)慎使用。此外,動(dòng)物模型的倫理問(wèn)題也不容忽視,科研人員需要在符合倫理規(guī)定的前提下進(jìn)行相關(guān)研究。盡管存在挑戰(zhàn),動(dòng)物模型的發(fā)展前景仍然值得期待。隨著科技的不斷進(jìn)步,科研人員將能夠開(kāi)發(fā)出更為精確、實(shí)用的動(dòng)物模型。江蘇大鼠科研技術(shù)服務(wù)購(gòu)買(mǎi)科研小白如何摸索自己的預(yù)實(shí)驗(yàn)。
如胰腺,一般取胰島較多的胰腺尾部;肺應(yīng)取有細(xì)支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實(shí)驗(yàn)需進(jìn)行多樣本的采集,采集順序應(yīng)按照:消化,神經(jīng)系統(tǒng),皮膚,肌肉等的順序進(jìn)行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排,然后決定其切面的走向;如一長(zhǎng)管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周?chē)闹镜?,?yīng)盡可能掉,否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來(lái)一些不必要的問(wèn)題。樣品的固定(1)固定的方法:①小塊固定法:從動(dòng)物取下的小塊,立即置入液態(tài)固定劑(這是應(yīng)用經(jīng)常的方法)。②注射/灌注固定法:某些塊由于體積過(guò)大或固定液極難滲入內(nèi)部或需要對(duì)整個(gè)臟器或整個(gè)動(dòng)物進(jìn)行固定,這時(shí)宜采用注射固定法,將固定液注入血管,經(jīng)血管分支到達(dá)整個(gè)和全身,從而得到充分的固定。另,空腔比如肺,肺內(nèi)含有空氣,固定液難以滲入,建議先做肺灌注,使得肺充盈滿(mǎn)固定液以后再進(jìn)行保存,如果空腔中氣體沒(méi)有排出,后續(xù)可能影響固定效果(沒(méi)有灌注的肺會(huì)浮在液體表面不利于固定,切片以后也會(huì)看到很多的空泡)。③蒸汽固定法:比較細(xì)小而薄的標(biāo)本,可用鋨酸或甲醛蒸汽固定。主要用于血液或細(xì)胞涂片以及某些薄膜的固定。。
m6A研究又有新手段了?趕緊來(lái)了解一下吧!欄目:研究動(dòng)態(tài)發(fā)布時(shí)間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章,小編時(shí)間和大家分享一下。作者開(kāi)發(fā)這一方法的前提是有研究報(bào)道了MazF能特異性的識(shí)別無(wú)修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個(gè)A發(fā)生m6A甲基化之后將無(wú)法被MazF所識(shí)別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理,然后再對(duì)打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫(kù)測(cè)序。對(duì)于無(wú)修飾的位點(diǎn),ACA處被完全剪切,測(cè)序reads正好分布于該位點(diǎn)上下游而且比對(duì)至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點(diǎn)的reads會(huì)包含上下游的序列。作者開(kāi)發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專(zhuān)門(mén)進(jìn)行分析(圖3)。常用實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型按產(chǎn)生原因分為以下5類(lèi):自發(fā)性動(dòng)物模型、誘發(fā)型模型、遺傳工程模型、醫(yī)學(xué)模型陰性模型。
外泌體生物發(fā)生和神經(jīng)元細(xì)胞中分泌小泡的調(diào)節(jié)之間的交集為外泌體和神經(jīng)退行性疾病的發(fā)病機(jī)制之間假定的聯(lián)提供了新的見(jiàn)解。與研究外泌體在其他疾病中的作用相比,外泌體中的研究進(jìn)展迅速,而且外泌體與的幾個(gè)主要特征有關(guān)。外泌體影響、生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移、副綜合征和耐藥性。外泌體在進(jìn)展中的作用可能是動(dòng)態(tài)的,并且與的類(lèi)型、遺傳學(xué)和分期有關(guān)。外泌體的應(yīng)用外泌體用于免疫基于免疫細(xì)胞來(lái)源的外泌體能夠介導(dǎo)和調(diào)節(jié)機(jī)體對(duì)的免疫反應(yīng),外泌體在免疫方面的潛力受到關(guān)注。其中樹(shù)枝狀細(xì)胞產(chǎn)生的外泌體包含大量的MHC-多肽復(fù)合物和免疫刺激相關(guān)的分子,能夠相關(guān)的T細(xì)胞,介導(dǎo)體內(nèi)抗應(yīng)答,在多個(gè)臨床試驗(yàn)中表現(xiàn)出良好的抗療效。有研究者考察了樹(shù)枝狀細(xì)胞外泌體對(duì)非小細(xì)胞肺患者的療效。結(jié)果表明,患者對(duì)樹(shù)枝狀細(xì)胞外泌體耐受性良好,1/3患者表現(xiàn)出了對(duì)樹(shù)枝狀細(xì)胞外泌體的T細(xì)胞響應(yīng),2/4患者自然殺傷細(xì)胞活性得以。另有研究者公布了利用自體樹(shù)突狀細(xì)胞外泌體免疫轉(zhuǎn)移性黑色素瘤的臨床一期試驗(yàn)結(jié)果,發(fā)現(xiàn)自體樹(shù)突狀細(xì)胞外泌體無(wú)明顯毒性,并且具有刺激自然殺傷細(xì)胞的能力。以上臨床試驗(yàn)證明了外泌體免疫療法的安全性和可行性,為進(jìn)一步臨床研究奠定了基礎(chǔ)。幫助科研人員深入理解疾病的共同性,還為新藥研發(fā)、疫苗測(cè)試等提供了有效的平臺(tái)。山西疾病科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室
由于大部分研究使用到的是人類(lèi)來(lái)源的細(xì)胞,種植到免疫正常的動(dòng)物體內(nèi)會(huì)發(fā)生免疫排斥反應(yīng)。河北組織科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)
一種是用beta巰基乙醇打開(kāi)蛋白質(zhì)分子二硫鍵的,另一種是用DTT(二硫蘇糖醇)。兩者的作用是一樣的,但特點(diǎn)不一樣,前者更容易與氧氣反應(yīng),穩(wěn)定性比后者差,如果在常溫下暴露在空中,前者只能維持24小時(shí)的活性,后者卻可以維持7天左右。所以該如何選擇?如果是蛋白樣品較少,跑幾次就可以用完的樣品,這時(shí)選擇beta巰基乙醇。如果樣品很多,計(jì)劃跑上幾十次的,優(yōu)先選擇DTT,建議變性后分裝保存。二、SDS-PAGE凝膠配制1、配膠前準(zhǔn)備首先強(qiáng)調(diào)一下,一塊好的膠是跑好蛋白的前提,所以這個(gè)環(huán)節(jié)也不容忽視。玻璃板的選擇,一種是1毫米厚度的,另一種是,這個(gè)厚度選擇也是有講究的,如果上樣體積小于10微升,優(yōu)先選1毫米,否則選。原因是什么?答案在轉(zhuǎn)膜部分揭曉。還有分離膠的濃度也要選擇適合的。然后玻璃板和梳子要洗干凈,晾干。裝板,注意厚板和薄板的底部要對(duì)齊,否則會(huì)漏膠。加制膠的各成分前,要觀察液體是否有沉淀,有沉淀的盡量不要用。2、制膠按配方說(shuō)明依次加入各組分,加完SDS后先簡(jiǎn)單手動(dòng)搖勻幾下,然后迅速加入過(guò)硫酸銨和TEMED,搖勻,緊接著就灌膠。然后我習(xí)慣用95%的酒精壓膠,我也用過(guò)純水,感覺(jué)純水壓沒(méi)那么好,由于水的密度較大,會(huì)把分界處的膠壓得膨大。河北組織科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)