m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動態(tài)發(fā)布時間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一，目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報(bào)道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理，作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理，然后再對打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫測序。對于無修飾的位點(diǎn)，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點(diǎn)上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點(diǎn)的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進(jìn)行分析（圖3）。protocol 分享｜小鼠卵巢組織切片 HE 染色。黑龍江血液科研技術(shù)服務(wù)購買

    圖2MAZTER-Seq實(shí)驗(yàn)流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來作者便是要驗(yàn)證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下，檢測到的剪切效率高于野生型（剪切效率高低m6A水平），m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠，那檢測的特異性位點(diǎn)是否準(zhǔn)確呢？作者也將該方法檢測到的新甲基化位點(diǎn)使用放射標(biāo)記層析檢測，發(fā)現(xiàn)預(yù)測的位點(diǎn)準(zhǔn)確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中，作者則是與m6A抗體IP的方法進(jìn)行了比較，也證實(shí)了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測結(jié)果驗(yàn)證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外，后文中作者也在大規(guī)模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態(tài)和酵母減數(shù)分裂模型中檢測了MAZTER-Seq這一系統(tǒng)；并進(jìn)一步通過這一方法檢測了哺乳動物不同細(xì)胞間m6A水平的保守性；也探究了去甲基化酶FTO對整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術(shù)，其他部分暫不過多分析了。新的技術(shù)能拓展我們的研究內(nèi)容；對于這一技術(shù)。云南血液科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)此外，動物模型的倫理問題也不容忽視，科研人員需要在符合倫理規(guī)定的前提下進(jìn)行相關(guān)研究。

    注意事項(xiàng)1.病毒包裝的幾個關(guān)鍵點(diǎn)主要包括：細(xì)胞因素、載體系統(tǒng)(盡量使用成熟的商業(yè)化載體系統(tǒng))、構(gòu)建重組的質(zhì)粒正確與否、質(zhì)粒抽提純化情況、包裝轉(zhuǎn)染控制(24、48小時的細(xì)胞及熒光狀態(tài)判斷)、目的基因?qū)?span style="color:#f5c81c;">病毒包裝影響(基因大小、序列情況、蛋白功能毒性等都會影響到是否能包裝成功)。，需要觀察包裝病毒后的48h培養(yǎng)基顏色是否橙紅。3.病毒濃縮：病毒一般在48h和72h各收一次。如果不想濃縮病毒的話，也可以直接將收集的病毒上清作為要的細(xì)胞的培養(yǎng)基，但是可能效果會不太好。并且一般收病毒時，培養(yǎng)基的營養(yǎng)已經(jīng)損耗了很多，那樣直接培養(yǎng)細(xì)胞會損害細(xì)胞，所以建議還是進(jìn)行濃縮后再。常見問題1.包裝病毒時293T細(xì)胞狀態(tài)不好，或者鋪得過密，可以選擇放棄該次實(shí)驗(yàn)。2.目的載體過大，不易。3.避免轉(zhuǎn)染過程以及后續(xù)過程出現(xiàn)的污染。

    膿毒癥動物模型必須具備以下基本要素：有膿毒癥典型的高排低阻血流動力學(xué)表現(xiàn)和高代謝狀態(tài)；伴發(fā)多個功能障礙；有較高的自然死亡率，根據(jù)膿毒癥的轉(zhuǎn)歸，要求動物模型的自然死亡率達(dá)到50%～70%；膿毒癥是嚴(yán)重引起機(jī)體的炎癥反應(yīng)過度造成的自身損傷，不是細(xì)菌和內(nèi)對機(jī)體的直接損傷，故出現(xiàn)功能障礙及動物死亡距膿毒癥模型制備應(yīng)有一定的時間間距。一般在制模后6～12h后發(fā)生的功能障礙或死亡屬全身炎癥反應(yīng)所致。實(shí)驗(yàn)動物的選擇在制作動物模型時多選用雄性小鼠，因?yàn)榇菩孕∈筝^雄性小鼠更能耐受膿毒癥和失血性休克，且進(jìn)入發(fā)期的雌性小鼠性水平變化很大，而雄性小鼠在膿毒癥時更易于發(fā)生免疫抑制。為什么選擇CLP模型？盲腸結(jié)扎穿孔模型（CLP）模型是接近于人類膿毒癥機(jī)制的模型，被稱為膿毒癥模型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。CLP技術(shù)在20世紀(jì)70年代被建立。CLP模型非常適宜用于防治膿毒癥或膿毒性休克新藥的臨床前觀察造模方法CLP膿毒癥模型的建立主要分為兩個階段：盲腸遠(yuǎn)端結(jié)扎和盲腸穿刺。首先是手術(shù)引發(fā)的結(jié)扎部位組織變性壞死引起局部炎癥反應(yīng)，其次是穿孔后使糞便內(nèi)容物漏入腹膜引起多菌性細(xì)菌性腹膜炎，進(jìn)而誘發(fā)全身性炎癥反應(yīng)。可以發(fā)現(xiàn)與疾病發(fā)生相關(guān)的關(guān)鍵基因和蛋白質(zhì)，從而為疾病的預(yù)防和檢查提供新的思路。

    我們知道WB實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣，一次實(shí)驗(yàn)歷時也不短，從提蛋白到顯影結(jié)束可能要三天，我們就講一下這里面的一些關(guān)鍵環(huán)節(jié)。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經(jīng)驗(yàn)豐富的WB實(shí)驗(yàn)者都深有體會，蛋白提取是影響結(jié)重要的環(huán)節(jié)之一。該過程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點(diǎn)，一是裂解前注意保持樣品處于低溫環(huán)境中，二是裂解時加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習(xí)慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環(huán)灌注，然后冰上取腦，分離各腦區(qū)(嗅球，皮層，海馬，中腦，小腦，延髓，丘腦，紋狀體)后置于，用液氮速凍后轉(zhuǎn)移至-80度冰箱長期保存。接著是保證蛋白濃度，即要加入適量的裂解液，加太少會使蛋白提取不充分，加太多會讓蛋白濃度太低，一般經(jīng)驗(yàn)是這樣的，細(xì)胞樣品例如一個六孔板的細(xì)胞加60微升的裂解液，動物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理，具體方案見討論部分。如果沒有超聲破碎儀，那就用1毫升注射器不斷抽吸，冰上反復(fù)抽吸1分鐘左右，注意不要產(chǎn)生過多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取，由于文件過大，又比較血腥，不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘，這里的上樣緩沖液有兩種可選。了解更多關(guān)于動物模型的問題歡迎來電咨詢，如您需要，竭誠為您服務(wù)。海南組織科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建

細(xì)胞是生命的基本單位，所有生物體都是由一個或多個細(xì)胞組成的。下面就跟著上海東寰一起看看吧。黑龍江血液科研技術(shù)服務(wù)購買

    應(yīng)根據(jù)所檢測指標(biāo)的要求，需采取不同策略處理。在如今分子學(xué)當(dāng)?shù)赖默F(xiàn)實(shí)背景下，動物實(shí)驗(yàn)除了對實(shí)驗(yàn)動物的體征及生理指標(biāo)進(jìn)行全的監(jiān)控外，各種分子檢測甚至是組學(xué)檢測也開始大行其道，動物實(shí)驗(yàn)結(jié)束之后的機(jī)制研究成為了實(shí)驗(yàn)的重頭戲。一般來說，動物實(shí)驗(yàn)檢測對象主要包括：（1）體液中各類因子定性及定量檢測由于此類檢測對象多為蛋白及各類小分子物質(zhì)，因此在取樣過程中應(yīng)注意防止此類物質(zhì)降解，在獲取后，應(yīng)及時置于溫（≤-80℃）進(jìn)行保存，在后續(xù)實(shí)驗(yàn)過程中，也應(yīng)當(dāng)注意保存條件的穩(wěn)定性，避免反復(fù)凍融。常用的方法便是酶聯(lián)免吸附測定（ELISA），除此之外，可利用生化分析儀及不同檢測方法的（比色法、比濁法等）方法對各類生化指標(biāo)及因子進(jìn)行定性及定量檢測。（2）生理變化及免組化檢測常用的理檢測多使用H&E染色對細(xì)胞質(zhì)及細(xì)胞核進(jìn)行染色標(biāo)記，以觀察細(xì)胞變化。除此之外，許多特殊染色也在理生理變化中得到了應(yīng)用，如利用Masson染色檢測纖維化變，Nissl染色檢測神經(jīng)元損傷，β-半乳糖甘酶染色檢測細(xì)胞衰老等。此外，還可以通過免組化技術(shù)對某些特異性標(biāo)記物進(jìn)行免顯色檢測，達(dá)到原位定性或定量檢測的目的。。黑龍江血液科研技術(shù)服務(wù)購買