圖2MAZTER-Seq實(shí)驗(yàn)流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來作者便是要驗(yàn)證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下，檢測到的剪切效率高于野生型（剪切效率高低m6A水平），m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠，那檢測的特異性位點(diǎn)是否準(zhǔn)確呢？作者也將該方法檢測到的新甲基化位點(diǎn)使用放射標(biāo)記層析檢測，發(fā)現(xiàn)預(yù)測的位點(diǎn)準(zhǔn)確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中，作者則是與m6A抗體IP的方法進(jìn)行了比較，也證實(shí)了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測結(jié)果驗(yàn)證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外，后文中作者也在大規(guī)模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態(tài)和酵母減數(shù)分裂模型中檢測了MAZTER-Seq這一系統(tǒng)；并進(jìn)一步通過這一方法檢測了哺乳動(dòng)物不同細(xì)胞間m6A水平的保守性；也探究了去甲基化酶FTO對整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術(shù)，其他部分暫不過多分析了。新的技術(shù)能拓展我們的研究內(nèi)容；對于這一技術(shù)?？蒲兄形覀兩婕暗降拿庖叱恋韺?shí)驗(yàn)通常指：免疫共沉淀（Co-IP）、RIP、Chip等等，將幾種實(shí)驗(yàn)簡單概述一下。浙江豚鼠科研技術(shù)服務(wù)購買

    1.首要原則：細(xì)胞不重要情況下立即丟棄，培養(yǎng)箱滅菌，所用培養(yǎng)基也都要丟棄，器械等重新滅菌或拆用新的。2.細(xì)菌污染一般都救不回來了，發(fā)現(xiàn)的時(shí)候培養(yǎng)基一般都很渾濁且細(xì)胞都死了3.污染且細(xì)胞很重要時(shí)：遇到念球菌污染，且細(xì)胞為基因改造細(xì)胞，非常重要。如231貼壁乳腺細(xì)胞，發(fā)現(xiàn)細(xì)胞周圍出現(xiàn)很小的串珠透亮圓點(diǎn)，非常像念球菌污染，此時(shí)細(xì)胞狀態(tài)尚可，且污染少。處理如下：用預(yù)熱或室溫PBS清洗3次，可適當(dāng)振搖，將污染沖洗下來。隨后加入10-20%雙抗到培養(yǎng)瓶，置于37度培養(yǎng)箱1h，之后再用PBS清洗三遍，直至視野下無可見污染。此時(shí)細(xì)胞也被沖下大部分，因此此方法只適用在細(xì)胞貼壁強(qiáng)，狀態(tài)好，密度高時(shí)使用。之后每天再更換培養(yǎng)基，每次用PBS沖洗2遍。過幾天細(xì)胞狀態(tài)尚可時(shí)，消化離心時(shí)用500r，3min，去掉上清，重復(fù)3次。這個(gè)方法是根據(jù)文獻(xiàn)可利用念球菌和細(xì)胞體積重量差異實(shí)現(xiàn)分離?；旧线@一步做完以后，污染就基本了，接下來就注意多觀察，勤換液就行。山西病理科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室建立疾病模型的目的是為了防治人類疾病。

    動(dòng)物模型在科研中有著普遍的應(yīng)用。首先，它們可以幫助科研人員深入理解的共同性，即不同物種之間存在的共有理變化過程。通過對動(dòng)物模型的研究，科研人員可以更清楚地了解的發(fā)展過程和機(jī)制，為人類的檢查提供理論依據(jù)。其次，動(dòng)物模型還為新研發(fā)和苗測試提供了的平臺。在研發(fā)過程中，科研人員可以通過對動(dòng)物模型進(jìn)行處理，觀察其和副作用，為新的臨床試驗(yàn)提供依據(jù)。而在苗測試中，動(dòng)物模型則可以用來評估苗的性和安全性。此外，動(dòng)物模型還為科研人員提供了研究人類的跨學(xué)科方法。例如，通過比較人類和動(dòng)物模型的基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等數(shù)據(jù)，可以發(fā)現(xiàn)與發(fā)生相關(guān)的關(guān)鍵基因和蛋白質(zhì)，從而為的和檢查提供新的思路。雖然動(dòng)物模型在科研中發(fā)揮了巨大的作用，但也存在一些挑戰(zhàn)。首先，由于物種差異的存在，動(dòng)物模型的表現(xiàn)與人類可能存在差異，因此需要謹(jǐn)慎使用。此外，動(dòng)物模型的倫理問題也不容忽視，科研人員需要在符合倫理規(guī)定的前提下進(jìn)行相關(guān)研究。盡管存在挑戰(zhàn)，動(dòng)物模型的發(fā)展前景仍然值得期待。隨著科技的不斷進(jìn)步，科研人員將能夠開發(fā)出更為精確、實(shí)用的動(dòng)物模型。

    3）基因/蛋白質(zhì)表達(dá)定性或定量檢測在進(jìn)行分子檢測的過程中，保持核酸和蛋白質(zhì)的完整性至關(guān)重要，因此在取樣過程中，應(yīng)盡量避免核酸及蛋白質(zhì)的降解。如不注意采樣過程，將會(huì)導(dǎo)致樣本中的核酸及蛋白質(zhì)的無差別降解，嚴(yán)重影響后續(xù)分子檢測結(jié)果。在條件允許的情況下，樣本在離體后應(yīng)立刻裝入凍存管內(nèi)，并立即放入液氮中進(jìn)行冷凍。在RNA提取樣本的保存過程中，可以選擇非冷凍型RNA保存液或Trizol試劑進(jìn)行RNA酶的。針對蛋白質(zhì)提取樣本的保存，我們同樣可以使用商品化的蛋白酶劑進(jìn)行短期處理。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PolymeraseChnReaction，PCR）及免印跡（Westernblotting，WB），這兩種實(shí)驗(yàn)手段是分子學(xué)檢測中不可或缺的一部分，也是發(fā)表至關(guān)重要的分子檢測數(shù)據(jù)。PCR主要用來對基因在基因組層面或轉(zhuǎn)錄層面的變化進(jìn)行定性或定量檢測，而WB則主要用來對某一蛋白質(zhì)的表達(dá)進(jìn)行定量檢測。（4）轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及代謝組學(xué)檢測隨著檢測水平及相關(guān)產(chǎn)業(yè)的不斷發(fā)展，各類組學(xué)檢測的價(jià)格降低，實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中也常常運(yùn)用組學(xué)檢測來提升實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的檔次。在我們進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)及蛋白質(zhì)組學(xué)的檢測過程中，同樣是要首先確保目標(biāo)RNA或蛋白質(zhì)的片段完整性。實(shí)驗(yàn)技巧——做好細(xì)胞凍存，保證細(xì)胞質(zhì)量。

    外泌體的功能外泌體可能作為細(xì)胞之間物質(zhì)和信號通訊的途徑，不同的細(xì)胞通過分泌攜帶不同組分的外泌體實(shí)現(xiàn)細(xì)胞間通訊，這些外泌體被受體細(xì)胞吸收，通過物質(zhì)交換或釋放內(nèi)含物實(shí)現(xiàn)物質(zhì)和信號的交流。外泌體與受體細(xì)胞的信息交流可能通過以下4種途徑實(shí)現(xiàn):外泌體表面膜蛋白質(zhì)被目的細(xì)胞表面的受體識別，從而靶細(xì)胞;外泌體在蛋白酶作用下產(chǎn)生的表面膜蛋白質(zhì)碎片可作為目的細(xì)胞表面受體的配體;外泌體脂膜可以與目的細(xì)胞膜融合，將蛋白質(zhì)和RNA等內(nèi)容物釋放進(jìn)去，此類膜融合可能改變靶細(xì)胞的一些膜特性，例如脂質(zhì)和膜蛋白質(zhì)的密度及種類;目的細(xì)胞通過胞吞的形式攝入外泌體經(jīng)由以上幾種途徑，外泌體將其攜帶的生物信息運(yùn)輸?shù)街苓叞屑?xì)胞或經(jīng)血液等體液運(yùn)輸而被遠(yuǎn)處組織細(xì)胞攝取，進(jìn)而影響目的細(xì)胞的基本功能和基因表達(dá)。幾乎所有的細(xì)胞都可以在自發(fā)或在一定刺激條件下產(chǎn)生外泌體，不同的細(xì)胞產(chǎn)生的外泌體具有不同的功能，這些外泌體參與了一系列生理和病理過程，如發(fā)生與發(fā)展、抗原呈遞、免疫調(diào)節(jié)、組織愈合等。此外，外泌體與疾病的研究表明：外泌體可能在代謝性疾病的出現(xiàn)以及心血管健康中發(fā)揮作用。RNA提取過程中試劑的作用是什么？天津大鼠科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)

純干貨Western blot （WB）條帶灰度統(tǒng)計(jì)與GraphPad作圖.浙江豚鼠科研技術(shù)服務(wù)購買

    RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學(xué)修飾，在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性，剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)了METTL3（甲基轉(zhuǎn)移酶3），一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶，在人肝細(xì)胞（HCC）和多種實(shí)體中高表達(dá)。在臨床上，METTL3的過度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)抑制HCC細(xì)胞增殖，遷移及克隆形成。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外，使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng)，內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會(huì)促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長。通過轉(zhuǎn)錄組測序、m6A-Seq、MeRIP-PCR，作者確定了SOCS2（細(xì)胞因子信號2的抑制因子）作為METTL3介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達(dá)會(huì)消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強(qiáng)SOCS2mRNA表達(dá)。m6A介導(dǎo)的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2?？傊琈ETTL3在HCC大部分高表達(dá)中,并通過m6A-YTHDF2依賴機(jī)制抑制SOCS2表達(dá)從而促進(jìn)HCC進(jìn)展。因此，作者發(fā)現(xiàn)了在肝發(fā)生過程中表觀遺傳改變的一種新機(jī)制。圖4RNA甲基化轉(zhuǎn)移酶METLLT3在肝組織中高表達(dá)。浙江豚鼠科研技術(shù)服務(wù)購買