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來源: 發(fā)布時間:2023-12-14

    m6A修飾圖譜構建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構建疾細胞模型或者發(fā)組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關的FOXM1,通過qPCR、WB、免熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達、共定位,進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構。近。常見的5種實驗動物取血方式,你掌握幾種?河北血液科研技術服務構建

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    2)固定的目的①保持其原有狀態(tài):使細胞內(nèi)的蛋白質(zhì)、脂肪、糖、酶等成分轉(zhuǎn)變?yōu)椴蝗苄晕镔|(zhì),迅速防止、細胞的死后變化,防止自溶與,防止細胞過度收縮或膨脹而失去其原有形態(tài)結構,使之盡量保持生前的狀態(tài)和結構。②以便染色后易于鑒別和觀察:不同成分對染料有不同的親和力,以便染色后易于鑒別和觀察。③使塊硬化,便于制作薄片(塊在脫水、包埋、切片、染色等過程中不易損壞)。(3)固定液固定液種類:一類是單純固定液,即只有一種試劑;另一類是混合固定液,由兩種或兩種以上試劑組成。作為較好的固定液,應有下列特性,首先,有強滲透力,能迅速的滲入內(nèi)部;其次,不使過度收縮或膨脹,并能使內(nèi)欲觀察的成分得以凝固為不溶性物質(zhì);能使達到一定的硬度并獲得較佳的折光率和對某些染料具有較強的親和力。固定液通常使用10%的甲醛溶液。特殊要求的,常需要特殊的固定液,取樣之前應做好準備。如眼球樣本應使用FAS眼球固定液,脂肪應使用脂肪固定液等。此外,在進行骨樣本制備的時候,還應注意提前進行脫鈣處理,可根據(jù)具體情況選擇慢脫鈣或快脫鈣處理。總的來說,樣品的采集是實驗中至關重要的一環(huán),如果取樣環(huán)節(jié)出現(xiàn)了偏差,往往會導致后續(xù)檢測結果的偏移。上??蒲屑夹g服務培養(yǎng)裸鼠皮下成瘤模型造模意義.

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    m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態(tài)發(fā)布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉(zhuǎn)建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。

    把膜先用TBST泡洗兩遍再用5%脫脂奶粉或者BSA室溫封閉1-2小時。注意一定要讓蛋白面充分接觸封閉液。2、孵一抗脫脂奶粉封閉的話,要用TBST泡洗三遍再轉(zhuǎn)移至一抗溶液中,BSA封閉的可以直接轉(zhuǎn)移至一抗中。如果膜的寬(膜是一個長方形,這里的寬與長相對應)不大于8毫米,我習慣置于15毫升離心管中孵育,兩條膜"背對背"式放置于一個管子里(3毫升液體即可)。如果大于8毫米,就用普通的5格的一抗孵育盒(4毫升即可)。4度過夜,一般是12-18個小時,注意放置水平,用搖床。內(nèi)參等蛋白豐度很高的如果孵久了可能出現(xiàn)條帶連在一起的情況,這時可以縮短孵育時間或者降低一抗的濃度。六、孵二抗顯影1、孵二抗室溫一個小時足矣。這步要注意的是建議用5%BSA或者脫脂奶粉稀釋二抗,這樣背景會干凈許多。也要注意膜的蛋白面要充分接觸二抗溶液,我們一般一條膜一個槽地孵。2、顯影這一步有個細節(jié)可能有些同學沒注意到,就是ECL發(fā)光液要與HRP反應一分鐘后顯影效果才會更好,還有要注意的是顯影液要均勻覆蓋,一般第二次顯影(加新的顯影液)比一次好看。通過對動物模型的研究,科研人員可以更清楚地了解疾病的發(fā)展過程和機制,為人類疾病的檢查提供理論依據(jù)。

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    外泌體作為物載體由于特殊的結構和循環(huán)方式,外泌體作為物運輸?shù)妮d體具有獨特的優(yōu)勢。例如外泌體的尺寸分布能夠增強滲透滯留效應,從而有選擇性地深入組織;其外層磷脂雙分子層可以保護內(nèi)容物不受各種生物酶的影響,維持各種生物分子的活性;外泌體普遍存在于各種體液和組織中,其體積小,結構、組成與細胞膜類似,導致外泌體可以在避開免系統(tǒng)監(jiān)督的同時深入組織內(nèi)部,有較好的生物相容性;當采用內(nèi)源外泌體時,能明顯降低其他物載體可能引起的有害免反應;除此之外,某些細胞來源或經(jīng)特殊修飾過的外泌體具有良好的特異性,可以與特定的或組織結合。因此,載成為外泌體研究的一個重要分支,具有良好的應用前景。在外泌體中引入物的方式包括體內(nèi)裝載和體外裝載兩種。體內(nèi)物裝載可以通過傳統(tǒng)方法(如毒轉(zhuǎn)染、脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染或電穿孔等)轉(zhuǎn)染來源細胞,編碼感興趣的RNA或蛋白質(zhì),也可以使物與來源細胞共混,使細胞分泌產(chǎn)生含有目標生物分子的外泌體。體外物裝載則首先需要得到純化的外泌體,然后將感興趣的物通過電穿孔或脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染等方法裝入純化的外泌體。外泌體內(nèi)可裝載的物包括小分子化學物、蛋白質(zhì)和多肽、核酸物、天然產(chǎn)物等。EdU細胞增殖檢測是一種快速、準確、靈敏的細胞增殖檢測方法.海南病理科研技術服務分離

這項技術可用來將含有上千種不同蛋白質(zhì)的樣品中,分離和濃縮出特定蛋白質(zhì)。河北血液科研技術服務構建

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