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深圳宿主細胞殘留DNA提取操作流程

來源: 發(fā)布時間:2024-05-10

核酸提取細胞裂解方法之酶裂解。酶裂解是在處理樣本時在樣本中添加一種酶來消化蛋白質(zhì)或細胞結(jié)構(gòu),如酵母細胞壁和絲狀。優(yōu)勢:實驗室中的理想方法,過程中無需機械裂解設(shè)備;選擇性的去除細胞壁,留下細胞部分采用另一種裂解方式(通常是化學(xué)裂解),方法靈活,避免了一些由機械裂解產(chǎn)生的破壞。劣勢:耗時較長(酶消化可能需要1小時)而且消化酶的價格昂貴;其次,由于消化酶可能會誘導(dǎo)細胞產(chǎn)生變化變化,進而可能影響基因表達,對后續(xù)的基因表達鑒定結(jié)果產(chǎn)生影響導(dǎo)致結(jié)果不準確,因此不適合進行基因表達分析。南京正揚生物有自動化核酸提取試劑盒嗎?深圳宿主細胞殘留DNA提取操作流程

采用納米磁珠法進行核酸提取時的注意事項:1、裂解過程中,樣品的裂解要充分,讓核酸充分暴露出來。2、在樣本核酸含量高,裂解液可充分裂解的范圍內(nèi),增加樣本量可以增加提取效果。3、清洗過程要控制次數(shù),如果清洗次數(shù)過多,會增加清洗過程中的核酸損失量。一般情況下,清洗次數(shù)在2~4次比較好。4、提取的核酸如果有蛋白及(或)鹽類殘留,可在提取過程中加入蛋白酶K降解樣品中的蛋白,減少蛋白殘留污染,同時用高濃度有機溶劑對核酸進行清洗,減少鹽殘留對酶活的抑制,從而防止雜質(zhì)對下游應(yīng)用產(chǎn)生抑制。5、在核酸提取量較低時,并不是增加磁珠用量,提取效果越好。鄭州復(fù)制型腺相關(guān)病毒核酸提取常見問題磁珠法核酸提取流程。

NaCl在核酸提取中的作用是提供一個高鹽環(huán)境,使DNA充分溶解于液相。沉淀DNA時總會加入高濃度的鹽,加鹽的目的是破壞能使蛋白質(zhì)保持穩(wěn)定的兩個因素,使蛋白和DNA分離并沉淀下來。而此時鹽的陽離子會與DNA結(jié)合形成DNA-陽離子鹽溶于溶液中,再用無水乙醇可以將DNA-陽離子鹽沉淀下來。提取DNA時先加0.14mol/L氯化鈉,因為在這種濃度的氯化鈉溶液中,DNA的溶解度比較低,而蛋白質(zhì)的溶解度增加,這樣通過過濾能將DNA分離開,以除去蛋白質(zhì)。再加入95%的酒精能使DNA沉淀,因為在這個濃度下DNA溶解度比較低。如果直接加酒精不先加氯化鈉,DNA和蛋白質(zhì)都能被酒精所沉淀,就無法將DNA和蛋白質(zhì)分離開。所以必須先加氯化鈉后加酒精,順序不能顛倒。

核酸提取中在細胞裂解后后往往需要進行純化處理。純化是指在細胞裂解后,核酸被選擇性的從周圍細胞成分中釋放出來,集中在水溶液或合適的緩沖溶液中以供下有使用。細胞裂解后的步驟,統(tǒng)稱為純化。純化方法包括:離心柱提取和純化法;苯酚/氯仿和乙醇沉淀法;納米磁珠法提取法純化法。離心柱是通過特殊硅基質(zhì)吸附材料,能夠特定吸附DNA,而RNA和蛋白質(zhì)順利通過,然后利用高鹽低PH結(jié)合核酸,低鹽高PH值洗脫,來分離純化核酸。苯酚/氯仿和乙醇沉淀法是通過酚/氯仿處理細胞破碎液或者組織勻漿后,在水相中主要溶解以DNA為主的核酸成分,在有機相中主要是脂類物質(zhì),蛋白質(zhì)位于兩相之間。納米磁珠法是運用納米技術(shù)對超順磁性納米顆粒的表面進行改良和表面修飾后,制備成超順磁性氧化硅納米磁珠。該磁珠能在微觀界面上與核酸分子特異性地識別和高效結(jié)合。利用氧化硅納米微球的超順磁性,在Chaotropic鹽(鹽酸胍、異硫氰酸胍等)和外加磁場的作用下,從血液、動物組織、食品、病原微生物等樣本中分離出DNA和RNA。宿主細胞殘留核酸提取時,提取效果不理想的原因可能有哪些?

苯酚/氯仿和乙醇沉淀法進行核酸提取的操作步驟:1、苯酚和氯仿的接觸:裂解的樣品與苯酚/氯仿通常通過強旋渦混合。旋渦確保所有有機成分都能與苯酚/氯仿混合物充分相互作用,以達到完全溶解和去除的目的。2、離心:步驟1過后可見兩個相。含有核酸的水相位于頂部,而底部的有機相含有蛋白質(zhì)、脂質(zhì)和其他大分子。然后離心樣品以完全分離這兩個相。3、相分離:用移液管小心地除去水相4、乙醇沉淀:用乙醇沉淀、純化核酸。在乙醇沉淀過程中,加入鹽和乙醇以緩沖水溶液中的核酸。鹽緩沖糖磷酸骨架,乙醇改變?nèi)芤旱慕殡姵?shù)。這使得核酸能夠從水溶液中分離出來,從而可以通過高速離心分離。5、重懸:在水或TE緩沖液中重新溶解成團的DNA或RNA。Vero細胞殘留核酸提取。深圳復(fù)制型慢病毒核酸提取常見問題

支原體檢測時,為什么要做核酸提取?深圳宿主細胞殘留DNA提取操作流程

核酸提取純化的總原則是要保證核酸一級結(jié)構(gòu)的完整性,防止降解,同時要排除其他分子的污染。因為一級結(jié)構(gòu)是核酸分子**基本的結(jié)構(gòu),儲存著全部的遺傳信息,是進一步研究的基礎(chǔ)。為了保持核酸的完整性,在提取過程中要注意防止核酸酶對核酸的降解。還要防止化學(xué)因素(酸堿等)和物理因素(高溫或機械剪切等)引起核酸變性或破壞。制備RNA要特別注意防止核酸酶的作用,因為核酸酶分布很廣,活力很高;而對DNA更重要的是防止張力剪切作用,因為DNA分子特別長,容易斷裂。對于核酸的提取純化應(yīng)達到以下三點要求:①核酸樣品中不應(yīng)存在對酶有抑制作用的有機溶劑和過高濃度的金屬離子;②其他生物大分子如蛋白質(zhì)、多糖和脂類分子的污染應(yīng)降低到比較低程度;③排除其他核酸分子的污染,如提取DNA分子時,應(yīng)去除RNA分子,反之亦然。深圳宿主細胞殘留DNA提取操作流程