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南京qPCR法病毒檢測(cè)原理

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-02-25

復(fù)制型病毒/病毒載體回復(fù)突變(ReplicationCompetentVirus,RCV),可產(chǎn)生于病毒載體制造過程中的所有步驟當(dāng)中。并且,RCV感   染宿主細(xì)胞后能隨宿主細(xì)胞在培養(yǎng)液中增殖、擴(kuò)增對(duì)人體健康具有嚴(yán)重的隱患,是免細(xì)胞治     療類產(chǎn)品,如CAR-T產(chǎn)品的主要安全性風(fēng)險(xiǎn)之一。近年來(lái),CAR-T細(xì)胞制備過程中,伴隨載體的不斷升級(jí)優(yōu)化,重組產(chǎn)生的復(fù)制型逆轉(zhuǎn)錄病毒/慢病毒(ReplicationCompetentRetrovirus/Lentivirus,RCR/RCL)逐漸降低,但產(chǎn)生RCR/RCL的風(fēng)險(xiǎn)隱患至今仍不能完全排除。由2022年5月發(fā)布的《體外基因修飾系統(tǒng)學(xué)研究與評(píng)價(jià)技術(shù)指導(dǎo)原則(試行)》指出RCR/RCL檢測(cè)作為安全性檢測(cè)在細(xì)胞的研發(fā)和生產(chǎn)過程中至關(guān)重要,相關(guān)產(chǎn)品不得檢出RCR/RCL,可知病毒載體相關(guān)產(chǎn)品中,RCR/RCL病毒檢測(cè)至關(guān)重要。為什么要做復(fù)制型慢病毒檢測(cè)?南京qPCR法病毒檢測(cè)原理

用qPCR法進(jìn)行rcAAV復(fù)制型腺相關(guān)病毒檢測(cè)時(shí),出現(xiàn)擴(kuò)增曲線異常的可能原因是什么?①軟件參數(shù)設(shè)置不當(dāng)可能引起標(biāo)曲參數(shù)或檢測(cè)結(jié)果異常。如擴(kuò)增曲線信號(hào)早出現(xiàn)在14個(gè)循環(huán)左右,基線卻設(shè)置為3-15,導(dǎo)致儀器將14個(gè)循環(huán)出現(xiàn)的熒光信號(hào)默認(rèn)為基線部分,出現(xiàn)結(jié)果異常。建議將BaselineEnd設(shè)置為擴(kuò)增信號(hào)出現(xiàn)的前一個(gè)循環(huán),或由軟件自動(dòng)設(shè)置。②擴(kuò)增曲線飄起:該現(xiàn)象通常出現(xiàn)于高濃度模板情況下,擴(kuò)增曲線Ct值在10以內(nèi)的樣品。針對(duì)此類樣品檢測(cè),設(shè)置標(biāo)曲時(shí)建議盡量控制標(biāo)曲蕞濃度Ct值控制在10以上。檢測(cè)樣品時(shí)建議對(duì)樣品進(jìn)行稀釋后再測(cè)試。南京qPCR法病毒檢測(cè)原理復(fù)制型逆轉(zhuǎn)錄病毒檢測(cè)。

用qPCR進(jìn)行rcAAV復(fù)制型腺相關(guān)病毒檢測(cè)時(shí),哪些因素會(huì)對(duì)檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確性和方法靈敏度存在較大影響?參考品DNA量值溯源及質(zhì)量保證:參考品DNA的量值準(zhǔn)確與否,直接關(guān)系到樣品檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性,因此需制定完善的參考品量值溯源程序,確保結(jié)果準(zhǔn)確可靠。參考品DNA的質(zhì)量要求可從條帶大小、完整性、純度、濃度等方面做多評(píng)估,細(xì)胞來(lái)源的參考品應(yīng)考察支原體污染,質(zhì)粒參考品應(yīng)考察質(zhì)粒宿主E.coli基因組DNA殘留情況等,盡量排除干擾確保結(jié)果準(zhǔn)確可靠。

盡管逆轉(zhuǎn)錄病毒和慢病毒載體被設(shè)計(jì)為具有復(fù)制缺陷,但仍有可能在生產(chǎn)過程中或輸注到患者體內(nèi)后發(fā)生重組,從而產(chǎn)生新的具有復(fù)制能力的逆轉(zhuǎn)錄病毒/慢病毒(RCR/RCL)。FDA在有關(guān)細(xì)胞產(chǎn)品和患者中檢測(cè)RCR復(fù)制型逆轉(zhuǎn)錄病毒/RCL復(fù)制型慢病毒的指南中建議使用適當(dāng)?shù)?span style="color:#f5c81c;">生物學(xué)和/或分子檢測(cè)方法進(jìn)行病毒載體、細(xì)胞產(chǎn)品和輸注后患者中的RCR復(fù)制型逆轉(zhuǎn)錄病毒/RCL復(fù)制型慢病毒檢測(cè)。南京正揚(yáng)生物自主研發(fā)了可用于基于細(xì)胞培養(yǎng)方法的qPCR檢測(cè)以及CAR-T終產(chǎn)品qPCR檢測(cè)的RCL及RCR檢測(cè)專   用試劑盒,幫助研究者進(jìn)行分析。南京正揚(yáng)的重組腺相關(guān)病毒檢測(cè)試劑盒性能如何?

RCL/RCR病毒檢測(cè)的方法FDA推薦的RCL檢測(cè)方法是利用敏感細(xì)胞對(duì)病毒載體中可能存在的RCL進(jìn)行培養(yǎng)擴(kuò)增,并在培養(yǎng)終點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè)。?擴(kuò)增期:將待測(cè)物與對(duì)HIV-1易感并且可大量擴(kuò)增病毒的細(xì)胞系(通常用C8166)孵育,細(xì)胞傳代5次以上,培養(yǎng)至少3周。?指示期:3周后收集培養(yǎng)上清,接種于C8166細(xì)胞中培養(yǎng)7d后檢測(cè)RCL標(biāo)志物。?檢測(cè):A:P24ELLISA的方法:適用于由載體制備過程中病毒基因組之間的重組形成RCL的檢測(cè)。B:PERT法:當(dāng)RCL進(jìn)行擴(kuò)增后,也可應(yīng)用PERT檢測(cè)方法測(cè)定逆轉(zhuǎn)錄酶活性。該方法的缺點(diǎn)是在某些細(xì)胞中存在高背景。C:qPCR方法:采用實(shí)時(shí)定量PCR方法(Q-PCR)測(cè)定假型病毒CAR-T細(xì)胞醫(yī)治產(chǎn)品中重組腺相關(guān)病毒檢測(cè)的監(jiān)管要求。寧波RCL病毒檢測(cè)優(yōu)缺點(diǎn)

復(fù)制型病毒檢測(cè)試劑盒適用性樣品有哪些?南京qPCR法病毒檢測(cè)原理

用qPCR進(jìn)行rcAAV復(fù)制型腺相關(guān)病毒檢測(cè)時(shí),哪些因素會(huì)對(duì)檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確性和方法靈敏度存在較大影響?①qPCR引物探針的序列特異性:為保證方法高靈敏度和檢出率,用于qPCR檢測(cè)的特異序列必須是存在于高度保守區(qū)域內(nèi)的穩(wěn)定序列,并且需要散布在基因組上,保證不會(huì)因工藝導(dǎo)致的殘留偏好而引起漏檢。②qPCR實(shí)驗(yàn)室能力驗(yàn)證:為滿足檢測(cè)要求,應(yīng)對(duì)實(shí)驗(yàn)室硬件和軟件能力進(jìn)行確認(rèn)。實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)應(yīng)按實(shí)驗(yàn)流程分區(qū)操作,每個(gè)操作區(qū)域配置相應(yīng)設(shè)施、設(shè)備及耗材,建立實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量管理體系,考核實(shí)驗(yàn)人員的操作能力及數(shù)據(jù)分析解讀能力等。南京qPCR法病毒檢測(cè)原理