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逆轉(zhuǎn)錄試劑是一類普遍應(yīng)用于生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究的試劑,它們可以用于逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的實驗操作。逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)是將RNA轉(zhuǎn)錄成DNA的過程,與正常的DNA轉(zhuǎn)錄成RNA的過程相反。逆轉(zhuǎn)錄試劑可以促進這個過程的進行,從而使得研究人員能夠更好地了解RNA的結(jié)構(gòu)和功能。逆轉(zhuǎn)錄試劑通常由逆轉(zhuǎn)錄酶、緩沖液和酶的輔助因子組成。逆轉(zhuǎn)錄酶是一種酶類蛋白質(zhì),它可以在逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中起到關(guān)鍵的作用。緩沖液的主要作用是維持反應(yīng)體系的PH值和離子強度,從而保證逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的順利進行。酶的輔助因子(如酶抑制劑)則可以幫助研究人員減少誤差和提高實驗的可重復(fù)性。逆轉(zhuǎn)錄是2代測序、單細胞測序等技術(shù)的前置步驟。加尾法逆轉(zhuǎn)錄酶生產(chǎn)商
反轉(zhuǎn)錄酶的注意事項,引物的選擇,OligodT:選擇OligodT時,要求RNA必須有PolyA,所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT,所以對RNA樣品的質(zhì)量要求較高,較好不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進行RT反應(yīng),建議推薦使用OligodT引物。使用OligodT引物要比隨機引物和特異性引物的穩(wěn)定性要好。特異性引物:特異性引物只能用你設(shè)計引物時的下游引物做RT,引物設(shè)計質(zhì)量影響RT的結(jié)果,而且不同引物退火溫度本來就不相同,所以按照說明書按照一個溫度做不是較佳選擇,一般不推薦。武漢莖環(huán)法反轉(zhuǎn)錄蛋白檢測逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)的發(fā)展使RNA研究得到極大便利。
逆轉(zhuǎn)錄實驗過程中要注意RNA樣品的保存、純化、處理和轉(zhuǎn)錄酶的選擇,逆轉(zhuǎn)錄實驗前要對反應(yīng)體系進行無RNA和無反轉(zhuǎn)錄酶的對照。多逆轉(zhuǎn)錄酶都具有多種酶活性,主要包括以下幾種活性。①RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。此酶需要RNA為引物,多為色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反轉(zhuǎn)錄酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的DNA出錯率比較高。②RNaseH活性;由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNaseH從RNA5′端水解掉RNA分子。
miRNA逆轉(zhuǎn)錄莖環(huán)法:首先需要進行RNA樣品制備,可選的方法有:離心柱法抽提(不必去除gDNA);傳統(tǒng)Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分別設(shè)計。是否采用通用引物視情況而定,正向引物與通用反向引物不會形成二聚體時才能用。取200ul的PCR管,根據(jù)所得每組RNA的濃度C,每孔加入1000ng總RNA,按公式1000ng/C計算出所需RNA的體積x。然后按建議的20μL反應(yīng)體系說明,依次向200μL的PCR管內(nèi)加入下列試劑:加樣結(jié)束后,移液器吹打混勻,低速離心數(shù)秒。將逆轉(zhuǎn)錄PCR管放入PCR擴增儀內(nèi),調(diào)整參數(shù):37℃15min(反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)),85℃5s(反轉(zhuǎn)錄酶的失活反應(yīng)),4℃∞。反應(yīng)結(jié)束后根據(jù)實驗需要進行熒光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。說明:此處可以選擇U6下游引物作為U6的逆轉(zhuǎn)錄引物,注意相應(yīng)地調(diào)整無酶水的體積和反應(yīng)溫度。逆轉(zhuǎn)錄實驗中引物設(shè)計時要注意反向引物特異性和長度,避免循環(huán)擴增和特異性問題。
逆轉(zhuǎn)錄常見問題及解決方法之RNA濃度不高:a)、原始組織樣本或細胞量太少:提高加入量。b)、RNA發(fā)生降解:如果使用者確定提取RNA的試劑/器具沒有問題,RNA的降解通常發(fā)生在樣品破碎/勻漿階段。有兩個辦法可以徹底抑制內(nèi)源RNase活性:1.立即加入裂解液并且徹底而迅速地勻漿。這只適合培養(yǎng)細胞及內(nèi)源RNase含量較低的并且較容易勻漿的組織,2.對于內(nèi)源RNase含量高或不易勻漿的組織,如肝臟、胰腺、脾臟、肌肉等,或植物組織,需要切成小塊后立即投入液氮冷凍,再按說明進行破碎/勻漿。c)、加入異丙醇后室溫沉淀10min或-20C冰沉淀30min即可,無需過夜沉淀。逆轉(zhuǎn)錄實驗過程中需要考慮RNA模板質(zhì)量和RNA純化的方法。武漢莖環(huán)法反轉(zhuǎn)錄蛋白檢測
逆轉(zhuǎn)錄在病毒學(xué)、免疫學(xué)等領(lǐng)域有普遍的應(yīng)用。加尾法逆轉(zhuǎn)錄酶生產(chǎn)商
逆轉(zhuǎn)錄酶實驗一步法與兩步法具有以下區(qū)別:一步法比兩步法更快速、簡便、減少了污染機會、減少了RNA二級結(jié)構(gòu)、減少了PCR反應(yīng)的錯配率;兩步法的優(yōu)勢在于中間產(chǎn)物cDNA,便于保存;且第二步PCR只取逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)產(chǎn)物的1/10進行反應(yīng),有利于PCR條件的調(diào)整,實驗重現(xiàn)性強;兩步法可以在第二步PCR反應(yīng)體系中加入特異性引物,其靈敏度比一步法高;兩步法包括首先鏈cDNA合成和隨后的PCR反應(yīng),容易產(chǎn)生污染問題;兩步法的實驗預(yù)算要低于一步法。加尾法逆轉(zhuǎn)錄酶生產(chǎn)商