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反轉(zhuǎn)錄酶的注意事項(xiàng),在進(jìn)行RT反應(yīng)之前,應(yīng)考慮以下幾個(gè)方面:RNA:成功的cDNA合成來自高質(zhì)量的RNA,高質(zhì)量的RNA至少應(yīng)保證全長(zhǎng)并且不含逆轉(zhuǎn)錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。在提取RNA的過程中,要特別防止RNase的污染,同時(shí)在逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中經(jīng)常加入RNase抑制劑以增加cDNA合成的長(zhǎng)度和產(chǎn)量。RNase抑制劑要在首先鏈cDNA合成反應(yīng)中,在緩沖液和還原劑(如DTT)存在的條件下加入,因?yàn)閏DNA合成前的過程會(huì)使抑制劑變性,從而釋放結(jié)合的可以降解RNA的RNase。蛋白R(shí)Nase抑制劑只防止RNaseA,B,C對(duì)RNA的降解,并不能防止皮膚上的RNase,因此盡管使用了這些抑制劑,也要小心不要從手指上引入RNase,實(shí)驗(yàn)過程中經(jīng)常更換新手套。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)完成反應(yīng)后要及時(shí)保存和處理PCR產(chǎn)物,并記錄實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和結(jié)果等。廣州miQP2逆轉(zhuǎn)錄供貨商
反轉(zhuǎn)錄酶的注意事項(xiàng),引物的選擇,OligodT:選擇OligodT時(shí),要求RNA必須有PolyA,所以真核生物的mRNA都適用。適合長(zhǎng)鏈甚至全長(zhǎng)mRNA的RT,所以對(duì)RNA樣品的質(zhì)量要求較高,較好不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進(jìn)行RT反應(yīng),建議推薦使用OligodT引物。使用OligodT引物要比隨機(jī)引物和特異性引物的穩(wěn)定性要好。特異性引物:特異性引物只能用你設(shè)計(jì)引物時(shí)的下游引物做RT,引物設(shè)計(jì)質(zhì)量影響RT的結(jié)果,而且不同引物退火溫度本來就不相同,所以按照說明書按照一個(gè)溫度做不是較佳選擇,一般不推薦。廣州miQP2逆轉(zhuǎn)錄供貨商逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過程中要注意RNA樣品的保存、純化、處理和轉(zhuǎn)錄酶的選擇。
逆轉(zhuǎn)錄酶還有DNA內(nèi)切酶活性,這可能與病毒基因整合到宿主細(xì)胞染色體DNA中有關(guān)。逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)對(duì)于遺傳工程技術(shù)起了很大的推動(dòng)作用,它已成為一種重要的工具酶。用組織細(xì)胞提取mRNA并以它為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補(bǔ)的cDNA,由此可構(gòu)建出cDNA文庫(cDNAlibrary),從中篩選特異的目的基因,這是在基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的方法。簡(jiǎn)要過程表示:逆轉(zhuǎn)錄酶的作用是以dNTP為底物,以RNA為模板,tRNA(主要是色氨酸t(yī)RNA)為引物,在tRNA3'-末端上,按5'→3'方向,合成一條與RNA模板互補(bǔ)的cDNA單鏈,它與RNA模板形成RNA-cDNA雜交體。隨后又在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,水解掉RNA鏈,再以cDNA為模板合成第二條DNA鏈。至此,完成由RNA指導(dǎo)的DNA合成過程。病毒復(fù)制方式:逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于RNA病毒):RNA→DNA→RNA。擬逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于DNA病毒):DNA→RNA→DNA。
逆轉(zhuǎn)錄酶是存在于RNA病毒體內(nèi)的依賴RNA的DNA聚合酶。RT-PCR實(shí)驗(yàn)中的逆轉(zhuǎn)錄酶需要具有以下二種活性:依賴RNA的DNA聚合酶活性:以RNA為模板合成cDNA的首先條鏈。依賴DNA的DNA聚合酶活性:以一條DNA鏈為模板合成互補(bǔ)的雙鏈DNA。在選擇逆轉(zhuǎn)錄酶時(shí),建議選擇無RNaseH①活性(RNaseH-)的逆轉(zhuǎn)錄酶。具有RNaseH活性的逆轉(zhuǎn)錄酶的RNaseH活性會(huì)與聚合酶活性競(jìng)爭(zhēng)RNA模板與DNA引物(或cDNA延伸鏈)形成的雜合鏈,并降解雜合鏈中的RNA鏈。被RNaseH活性所降解的RNA模板不能再作為合成cDNA的有效底物,降低了cDNA合成的產(chǎn)量與長(zhǎng)度。逆轉(zhuǎn)錄在病毒學(xué)、免疫學(xué)等領(lǐng)域有普遍的應(yīng)用。
RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):RNA定量:除了掌握RNA的完整性之外,反轉(zhuǎn)錄之前還需要對(duì)RNA濃度進(jìn)行測(cè)定。一般反轉(zhuǎn)錄試劑盒會(huì)對(duì)上樣量有要求,建議totalRNA上樣量小于5μg。超過這個(gè)范圍,會(huì)使反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物產(chǎn)生偏好性(表達(dá)豐度高的基因優(yōu)先被反轉(zhuǎn)錄)而造成定量結(jié)果不準(zhǔn)確。逆轉(zhuǎn)錄引物的選擇:逆轉(zhuǎn)錄引物一般包含3種:oligodT引物,隨機(jī)引物和特異性引物。對(duì)于短的且不具備發(fā)卡結(jié)構(gòu)的真核細(xì)胞mRNA,三種都可用。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過程中避免光照,防止RNA樣品和試劑受光降解或刺激。逆轉(zhuǎn)錄也可作為RNA表達(dá)譜的分析方法。武漢彩色逆轉(zhuǎn)錄混合多少錢
逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)首先需要逆轉(zhuǎn)錄酶的反應(yīng)活性。廣州miQP2逆轉(zhuǎn)錄供貨商
逆轉(zhuǎn)錄的過程:生物體中的逆轉(zhuǎn)錄過程就比較復(fù)雜,比如逆轉(zhuǎn)錄病毒(retrovirus)。病毒是真正的“極簡(jiǎn)風(fēng)”,所有東西都?jí)嚎s到非常。比如它的基因組中,經(jīng)常有些基因是重疊、嵌套結(jié)構(gòu),充分利用每一個(gè)堿基。所以它也不會(huì)專門編碼一個(gè)引發(fā)酶來合成引物,它一般是在組裝時(shí)帶走宿主的tRNA,在下次侵染時(shí)當(dāng)作引物使用。被用作引物的tRNA會(huì)結(jié)合在病毒基因組RNA鏈的中間,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因組RNA兩端的一段重復(fù)序列,“跳”回另一端,完成整條鏈的逆轉(zhuǎn)錄。之后水解RNA鏈的時(shí)候,會(huì)留下一些片段作為復(fù)制的引物。雙鏈DNA的合成同樣也需要經(jīng)過一次跳躍(jump),以合成完整雙鏈。較后兩端具有相同的序列,稱為長(zhǎng)末端重復(fù)(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳躍時(shí)用來配對(duì)的序列,還有整合信號(hào)、啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、polyA位點(diǎn)等重要結(jié)構(gòu)。廣州miQP2逆轉(zhuǎn)錄供貨商