RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):去除基因組DNA污染:殘留的基因組DNA(gDNA)會(huì)對(duì)熒光定量結(jié)果造成很大的干擾,為了使結(jié)果更加的真實(shí)、可重復(fù),我們需要去除gDNA干擾。我們可以在引物設(shè)計(jì)時(shí)避免gDNA的擴(kuò)增,比如將上下游引物分別設(shè)在不同的外顯子上;或者在提取RNA后使用DNaseI處理以除去gDNA。較后,我們還有非常法寶,選擇一款具有g(shù)DNA去除功能的逆轉(zhuǎn)錄試劑盒,一步到位去除gDNA,省心省力max。RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):逆轉(zhuǎn)錄酶熱穩(wěn)定性:逆轉(zhuǎn)錄酶在整個(gè)反轉(zhuǎn)錄體系中具有關(guān)鍵性影響。除了活性以外,逆轉(zhuǎn)錄酶的熱穩(wěn)定性同樣很重要,在較高溫度下進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,能夠減少RNA的二級(jí)結(jié)構(gòu),增加逆轉(zhuǎn)錄的效率。野生型的M-MLV逆轉(zhuǎn)錄酶很“怕熱”,高于37℃時(shí),穩(wěn)定性大幅下降。逆轉(zhuǎn)錄酶通常具有多種活性,如逆轉(zhuǎn)錄活性、復(fù)制活性與RNA酶H活性。成都莖環(huán)法反轉(zhuǎn)錄哪家好
莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄是一種逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的技術(shù),它利用莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子作為反向引物,在逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程中特異性地?cái)U(kuò)增目標(biāo)RNA分子。該技術(shù)在分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中得到了普遍的應(yīng)用,特別是在RNA的研究和檢測(cè)中具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)的基本原理是利用逆轉(zhuǎn)錄酶和莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA作為反向引物,將RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,并在PCR反應(yīng)中擴(kuò)增。莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子具有較高的穩(wěn)定性和特異性,可以特異性地識(shí)別和結(jié)合目標(biāo)RNA分子,從而在逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中作為反向引物擴(kuò)增目標(biāo)cDNA。此外,由于莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子與目標(biāo)RNA分子的堿基序列互補(bǔ),因此莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)可以避免隨機(jī)引物引起的非特異擴(kuò)增。成都莖環(huán)法反轉(zhuǎn)錄哪家好逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過(guò)程中避免光照,防止RNA樣品和試劑受光降解或刺激。
逆轉(zhuǎn)錄酶(M-MLV)從MoloneyMurineLeukemiaVirus分離出來(lái),可用于合成首先鏈cDNA、制作cDNA探針、RNA轉(zhuǎn)錄、測(cè)序和RNA的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。本酶是通過(guò)點(diǎn)突變使RNaseH活性缺失,所以它具有的DNA聚合酶的活性與野生型相同,同時(shí)其延伸能力也有明顯提高。逆轉(zhuǎn)錄酶(M-MLV)一個(gè)活性單位定義為在37℃,10min條件下,使1nmol的脫氧核糖核酸摻入酸性沉淀物質(zhì)所需的酶量。逆轉(zhuǎn)錄酶的三個(gè)功能:1、RNA為模板指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;2、DNA為模板指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;3、RNaseh活性。
miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA不同,成熟的miRNA的長(zhǎng)度只有20nt左右,非常短,通常正向引物就足以覆蓋其全長(zhǎng)甚至有余,反向引物就無(wú)處安放了。那么如何實(shí)現(xiàn)miRNA的qPCR擴(kuò)增呢?解決方案就是在逆轉(zhuǎn)錄的時(shí)候設(shè)法增加逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長(zhǎng)度。普遍的方法有兩種,加尾法和莖環(huán)法。經(jīng)過(guò)加尾法或莖環(huán)法這種特殊的逆轉(zhuǎn)錄形式處理之后,得到的cDNA長(zhǎng)度從原始的20nt增加到80nt以上,這樣就能夠?qū)崿F(xiàn)miRNA的qPCR擴(kuò)增了。RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):選擇合適的引物:但其對(duì)RNA的完整度和二級(jí)結(jié)構(gòu)的要求較高,而且不適用于原核生物。隨機(jī)引物可以根據(jù)堿基情況結(jié)合到幾乎所有的RNA上,包括mRNA、tRNA和rRNA。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)避免RNA樣品的過(guò)凍、過(guò)熱處理,影響逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的效果。
逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)步驟:用SSⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶進(jìn)行RT(20ul體積)1、準(zhǔn)備0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暫離心。3、65℃水浴5分鐘后,立刻0℃冰水浴至少1分鐘。4、短暫離心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶。5、短暫離心。6、50℃水浴60分鐘進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。7、70℃水浴15分鐘滅活逆轉(zhuǎn)錄酶。8、-20℃保存,或立即進(jìn)行PCR。MCERTmix含有比例優(yōu)化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使cDNA合成可從RNA轉(zhuǎn)錄本的各個(gè)區(qū)域起始,并具有相同的逆轉(zhuǎn)錄效率,較大程度保證qPCR結(jié)果的真實(shí)性和可重復(fù)性。逆轉(zhuǎn)錄是以RNA為模板合成DNA的過(guò)程,即RNA指導(dǎo)下的DNA合成。蘇州莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄試劑試劑研發(fā)
逆轉(zhuǎn)錄在病毒學(xué)、免疫學(xué)等領(lǐng)域有普遍的應(yīng)用。成都莖環(huán)法反轉(zhuǎn)錄哪家好
逆轉(zhuǎn)錄的發(fā)現(xiàn)有重要的理論意義和實(shí)踐意義。對(duì)分子生物學(xué)的中心法則進(jìn)行了修正和補(bǔ)充。經(jīng)典的中心法則認(rèn)為:DNA的功能兼有遺傳信息的傳遞和表達(dá),因此,DNA處于生命活動(dòng)的中心位置。逆轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象說(shuō)明:至少在某些生物中,RNA同樣兼有遺傳信息傳遞和表達(dá)功能。修正后的中心法則表示為:是指遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再?gòu)腞NA傳遞給蛋白質(zhì),即完成遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過(guò)程。也可以從DNA傳遞給DNA,即完成DNA的復(fù)制過(guò)程。這是所有有細(xì)胞結(jié)構(gòu)的生物所遵循的法則。某些病毒中的RNA自我復(fù)制和在某些病毒中能以RNA為模板逆轉(zhuǎn)錄成DNA的過(guò)程(某些致死病毒)。有些亞病毒例如朊病毒,這種亞病毒沒(méi)有核酸,是一種因錯(cuò)誤折疊而形成的結(jié)構(gòu)異常的蛋白質(zhì),以蛋白質(zhì)直接形成蛋白質(zhì),可促使與自身具有相同氨基酸序列的蛋白質(zhì)發(fā)生同樣的折疊錯(cuò)誤,從而導(dǎo)致大量結(jié)構(gòu)異常的蛋白質(zhì)的形成。當(dāng)然,一般不認(rèn)為亞病毒屬于生物。成都莖環(huán)法反轉(zhuǎn)錄哪家好
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