RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄中模板的選擇:在RT-PCR實驗中,選擇總RNA或純化的mRNA作為模板進行逆轉(zhuǎn)錄十分重要。mRNA雖然能提供略高的靈敏度,但總RNA經(jīng)常使用,具有較mRNA更重要的優(yōu)勢。首先,其過程需要較少的純化流程,這保證了更好的回收模板和更好的把結(jié)果標(biāo)準(zhǔn)化為起始的細胞數(shù)。第二,避免mRNA富集步驟,為了避免不同mRNA的回收率而帶來結(jié)果偏移的可能性??傊?,在大多數(shù)的應(yīng)用中,目標(biāo)基因的相對定量比檢測的非常靈敏度更重要,因此在多數(shù)情況下,總RNA更適用。逆轉(zhuǎn)錄的反應(yīng)機理是RNA模板上的DNA合成。深圳miQP2逆轉(zhuǎn)錄試劑研發(fā)
逆轉(zhuǎn)錄(reversetranscription)是以RNA為模板合成DNA的過程,即RNA指導(dǎo)下的DNA合成。此過程中,核酸合成與轉(zhuǎn)錄(DNA到RNA)過程與遺傳信息的流動方向(RNA到DNA)相反,故稱為逆轉(zhuǎn)錄。逆轉(zhuǎn)錄與反轉(zhuǎn)錄嚴(yán)格意義上來說沒有什么區(qū)別,但是逆轉(zhuǎn)錄是某些病毒的自主行為,如逆轉(zhuǎn)錄病毒,它們在整合到宿主細胞內(nèi)前以RNA為模板形成DNA的過程;反轉(zhuǎn)錄是進行基因工程過程中,人為地提取出所需要的目的基因的信使RNA,并以之為模板人工合成DNA的過程。二者雖同為RNA→DNA的過程,但地點不同,相對性的來說,逆轉(zhuǎn)錄在體內(nèi),反轉(zhuǎn)錄在體外。武漢莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄酶供貨商逆轉(zhuǎn)錄實驗可以選擇加入RNA合成抑制劑RNAse防止RNA降解和污染。
逆轉(zhuǎn)錄的端粒復(fù)制:逆轉(zhuǎn)錄經(jīng)常與細胞惡性轉(zhuǎn)化有關(guān),艾滋、乙肝等很多疾病也有逆轉(zhuǎn)錄過程。所以相關(guān)研究可以為很多疾病的研究和防治提供幫助。逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑就一直是藥物研發(fā)熱點,例如抗HIV的nevirapine。逆轉(zhuǎn)錄酶缺乏校對(3'-5'核酸外切酶)功能,所以容易出錯。這也是很多病毒容易突變進化的原因,比如nevirapine就很容易被抵抗。不過,校對功能與逆轉(zhuǎn)錄活性并不矛盾。有人使用改良的定向進化策略從具有校對功能的DNA聚合酶(古細菌的DNA聚合酶B)進化出高保真的耐熱逆轉(zhuǎn)錄酶,稱為逆轉(zhuǎn)錄異種聚合酶(reversetranscriptionxenopolymerase),證明校對與逆轉(zhuǎn)錄是兼容的。在科研中,RTX可用于RT-PCR等過程,能夠提高精確度及簡化操作程序。
逆轉(zhuǎn)錄常見問題及解決方法之組織提?。篟NAisolater可以提取miRNA嗎?可以提取miRNA。他普遍適用于培養(yǎng)細胞、動物組織、微生物以及代謝較少的植物組織,如幼苗、幼葉等。提取的RNA有基因組DNA污染:a)、向裂解液中加入氯仿后,需要在低溫下(2-8°C)高速離心。離心后,RNA被抽提到上層的水相中,中、下層是有機相,含有氯仿。DNA即存在于中層。氯仿在常溫下會與水以一定比例互溶,因此,常溫離心會導(dǎo)致上層水相中也有少量基因組DNA污染。吸取上層液體時,應(yīng)非常小心,避免吸到中間層和下層,為此失去一點得率,保留一些上清不吸是非常值得的。RNA應(yīng)如何保存:建議分裝后在-80℃長期保存,在-20℃可以短期保存,但需要盡快使用。逆轉(zhuǎn)錄實驗相關(guān)關(guān)器材如逆轉(zhuǎn)錄儀需經(jīng)常檢查,以保證反應(yīng)可靠性。
miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA不同,成熟的miRNA的長度只有20nt左右,非常短,通常正向引物就足以覆蓋其全長甚至有余,反向引物就無處安放了。那么如何實現(xiàn)miRNA的qPCR擴增呢?解決方案就是在逆轉(zhuǎn)錄的時候設(shè)法增加逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長度。普遍的方法有兩種,加尾法和莖環(huán)法。經(jīng)過加尾法或莖環(huán)法這種特殊的逆轉(zhuǎn)錄形式處理之后,得到的cDNA長度從原始的20nt增加到80nt以上,這樣就能夠?qū)崿F(xiàn)miRNA的qPCR擴增了。RNA逆轉(zhuǎn)錄實驗注意事項:選擇合適的引物:但其對RNA的完整度和二級結(jié)構(gòu)的要求較高,而且不適用于原核生物。隨機引物可以根據(jù)堿基情況結(jié)合到幾乎所有的RNA上,包括mRNA、tRNA和rRNA。逆轉(zhuǎn)錄實驗中的RNA樣品處理時要避免使用酸性物質(zhì)、有機溶劑和酶切酶劑。北京快速反轉(zhuǎn)錄哪家專業(yè)
逆轉(zhuǎn)錄實驗時要記錄反應(yīng)體系的溫度、時間、反應(yīng)試劑的添加量等參數(shù)。深圳miQP2逆轉(zhuǎn)錄試劑研發(fā)
逆轉(zhuǎn)錄酶實驗一步法與兩步法具有以下區(qū)別:一步法比兩步法更快速、簡便、減少了污染機會、減少了RNA二級結(jié)構(gòu)、減少了PCR反應(yīng)的錯配率;兩步法的優(yōu)勢在于中間產(chǎn)物cDNA,便于保存;且第二步PCR只取逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)產(chǎn)物的1/10進行反應(yīng),有利于PCR條件的調(diào)整,實驗重現(xiàn)性強;兩步法可以在第二步PCR反應(yīng)體系中加入特異性引物,其靈敏度比一步法高;兩步法包括首先鏈cDNA合成和隨后的PCR反應(yīng),容易產(chǎn)生污染問題;兩步法的實驗預(yù)算要低于一步法。深圳miQP2逆轉(zhuǎn)錄試劑研發(fā)
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