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逆轉(zhuǎn)錄酶實(shí)驗(yàn)流程:從細(xì)胞材料中提取RNA→RNA加入到含有逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、dNTPs的反應(yīng)體系中→退火,引物與RNA鏈配對→延伸,逆轉(zhuǎn)錄酶合成互補(bǔ)cDNA鏈變性→常規(guī)PCR反應(yīng)流程(變性、退火、延伸,如此多次循環(huán))。RT-PCR“兩步法”與“一步法”RT-PCR的實(shí)驗(yàn)操作分為“一步法”與“兩步法”兩種。一步法RT-PCR能克隆微量mRNA而不需構(gòu)建cDNA文庫(即cDNA合成與PCR反應(yīng)在同一Buffer及酶中進(jìn)行,一步法完成),省略了cDNA與PCR之間的過程。兩步法RT-PCR首先用反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA,然后以cDNA為模板進(jìn)行PCR,即RNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴(kuò)增分兩步進(jìn)行。逆轉(zhuǎn)錄是許多病毒復(fù)制中必不可少的步驟。泉州cDNA合成逆轉(zhuǎn)錄試劑
雖然莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)在分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中具有普遍的應(yīng)用,但在實(shí)際應(yīng)用中還存在一些挑戰(zhàn)。例如,莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子需要經(jīng)過復(fù)雜的化學(xué)合成和純化過程,從而增加了技術(shù)的難度和成本。此外,莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)也面臨著樣品污染、PCR反應(yīng)中的非特異擴(kuò)增等問題,需要在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和數(shù)據(jù)分析中進(jìn)行有效的控制和糾正??傊?,莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)是一種重要的分子生物學(xué)技術(shù),它具有特異性高、全長擴(kuò)增、無需RNA純化等優(yōu)點(diǎn),在RNA的研究和檢測中得到了普遍的應(yīng)用。隨著分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究的不斷發(fā)展,莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)的應(yīng)用范圍也會(huì)不斷擴(kuò)展,并為科研和臨床診斷提供更多的技術(shù)支持。一步法逆轉(zhuǎn)錄酶公司逆轉(zhuǎn)錄PCR在檢測病毒、診斷疾病等方面有普遍應(yīng)用。
逆轉(zhuǎn)錄酶(M-MLV)從MoloneyMurineLeukemiaVirus分離出來,可用于合成首先鏈cDNA、制作cDNA探針、RNA轉(zhuǎn)錄、測序和RNA的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。本酶是通過點(diǎn)突變使RNaseH活性缺失,所以它具有的DNA聚合酶的活性與野生型相同,同時(shí)其延伸能力也有明顯提高。逆轉(zhuǎn)錄酶(M-MLV)一個(gè)活性單位定義為在37℃,10min條件下,使1nmol的脫氧核糖核酸摻入酸性沉淀物質(zhì)所需的酶量。逆轉(zhuǎn)錄酶的三個(gè)功能:1、RNA為模板指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;2、DNA為模板指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;3、RNaseh活性。
逆轉(zhuǎn)錄常見問題及解決方法之RNA濃度不高:a)、原始組織樣本或細(xì)胞量太少:提高加入量。b)、RNA發(fā)生降解:如果使用者確定提取RNA的試劑/器具沒有問題,RNA的降解通常發(fā)生在樣品破碎/勻漿階段。有兩個(gè)辦法可以徹底抑制內(nèi)源RNase活性:1.立即加入裂解液并且徹底而迅速地勻漿。這只適合培養(yǎng)細(xì)胞及內(nèi)源RNase含量較低的并且較容易勻漿的組織,2.對于內(nèi)源RNase含量高或不易勻漿的組織,如肝臟、胰腺、脾臟、肌肉等,或植物組織,需要切成小塊后立即投入液氮冷凍,再按說明進(jìn)行破碎/勻漿。c)、加入異丙醇后室溫沉淀10min或-20C冰沉淀30min即可,無需過夜沉淀。逆轉(zhuǎn)錄可用于新型病毒的檢測。
miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA的在qRT-PCR過程有所不同。一般來講,mRNA比較長,其長度通常在幾百至幾千個(gè)核苷酸,因此使用隨機(jī)引物(RandomPrimerp(dN)6)即可隨機(jī)結(jié)合到mRNA的各位置進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。由于qPCR的過程只需擴(kuò)增目的片段的一部分(80~200bp),因此使用隨機(jī)引物的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物盡管不完整,也完全能夠滿足qPCR的需求。當(dāng)然,也可以使用OligodT引物統(tǒng)一從mRNA的ployA尾巴開始逆轉(zhuǎn)錄。這種逆轉(zhuǎn)錄引物在擴(kuò)增cDNA全長時(shí)是必須的,但要注意,原核生物的mRNA和某些lncRNA不具有ployA尾,因此不能使用OligodT引物進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)前應(yīng)對所有器具和實(shí)驗(yàn)臺面消毒和清潔,避免交叉污染影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。北京快速逆轉(zhuǎn)錄混合哪家劃算
逆轉(zhuǎn)錄是一種將RNA反轉(zhuǎn)錄為DNA的生物化學(xué)過程。泉州cDNA合成逆轉(zhuǎn)錄試劑
RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄引物設(shè)計(jì)原則:1.上下游引物要保守:擴(kuò)增子長度需選擇一段保守片段(100-200bp)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,選擇片段需跨越內(nèi)含子,因內(nèi)含子的基因組DNA序列不會(huì)被擴(kuò)增,也可減少從污染的基因組DNA中擴(kuò)增得到的假陽性風(fēng)險(xiǎn)。引物選取同樣需要保守。2.引物長度和Tm值:引物設(shè)計(jì)長度為18-25bp,Tm值在50-65℃之間,引物中GC含量在40-60%。設(shè)計(jì)引物時(shí)盡量避免出現(xiàn)4個(gè)或超過4個(gè)G堿基。RT-PCR實(shí)驗(yàn)陰性對照:反轉(zhuǎn)錄陰性對照應(yīng)包括在所有的RT-PCR的實(shí)驗(yàn)中,用來檢測DNA是否污染(如基因組DNA或PCR產(chǎn)物)。該對照所指不加反轉(zhuǎn)錄酶,通過反轉(zhuǎn)錄過程得到cDNA在進(jìn)行熒光定量PCR檢測。如檢測到擴(kuò)增,則樣本中可能含有基因組DNA污染。泉州cDNA合成逆轉(zhuǎn)錄試劑
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