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來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-05-10

逆轉(zhuǎn)錄酶實(shí)驗(yàn)流程:從細(xì)胞材料中提取RNA→RNA加入到含有逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、dNTPs的反應(yīng)體系中→退火,引物與RNA鏈配對(duì)→延伸,逆轉(zhuǎn)錄酶合成互補(bǔ)cDNA鏈變性→常規(guī)PCR反應(yīng)流程(變性、退火、延伸,如此多次循環(huán))。RT-PCR“兩步法”與“一步法”RT-PCR的實(shí)驗(yàn)操作分為“一步法”與“兩步法”兩種。一步法RT-PCR能克隆微量mRNA而不需構(gòu)建cDNA文庫(kù)(即cDNA合成與PCR反應(yīng)在同一Buffer及酶中進(jìn)行,一步法完成),省略了cDNA與PCR之間的過(guò)程。兩步法RT-PCR首先用反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA,然后以cDNA為模板進(jìn)行PCR,即RNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴(kuò)增分兩步進(jìn)行。逆轉(zhuǎn)錄引物的設(shè)計(jì)需要考慮反向引物的特性。上海快速逆轉(zhuǎn)錄試劑純度高

逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)備工作:1、實(shí)驗(yàn)器具與材料:(1)移液頭:200ul、10ul;(2)吸頭:200ul、20ul;(3)EP管1。5ml、100ul;(4)水浴箱。2、實(shí)驗(yàn)器具的處理與準(zhǔn)備,塑料制品:(包括吸頭、EP管等)將塑料制品逐個(gè)浸泡于1‰DEPC水中(必要時(shí)小頭頭需要用吸管打入DEPC水)37℃過(guò)夜,然后送至高壓3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小時(shí)左右烘干),試驗(yàn)前將頭頭放入吸頭臺(tái)。3、試劑配制和準(zhǔn)備:(1)DEPC水:泡實(shí)驗(yàn)器具的DEPC水的配制:1000ml雙蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中靜置4小時(shí)后備用。逆轉(zhuǎn)錄中所用的DEPC水的配制:100ml鹽水瓶?jī)?nèi)裝40ml雙蒸水,加40ulDEPC,37℃過(guò)夜,送至高壓,后分裝到幾個(gè)1。5mlEP管中,-20℃中保存?zhèn)溆?。?)RT中所需要的各種試劑。上??焖倌孓D(zhuǎn)錄試劑純度高逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)前應(yīng)對(duì)所有器具和實(shí)驗(yàn)臺(tái)面消毒和清潔,避免交叉污染影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

逆轉(zhuǎn)錄酶的質(zhì)量控制:1.切口酶:在與200單位酶37oC保溫60分鐘后,超螺旋質(zhì)粒保留在90%以上。2.DNase測(cè)定:200單位酶與50ng3H-DNA37oC保溫60分鐘,分解出的放射性低于1%。3.RNase測(cè)定:200單位酶與50ng3H-RNA37oC保溫60分鐘,分解出的放射性低于3%。4.首先鏈cDNA的反應(yīng):在標(biāo)準(zhǔn)化的反應(yīng)中,200單位酶催化從1mg1.2kbRNA或1mg7.5kbRNA將同位素?fù)饺氲絚DNA中,通過(guò)放射自顯影,對(duì)于1.2kb的RNA,產(chǎn)物cDNA是單一的、全長(zhǎng)的條帶。對(duì)于7.5kb的RNA產(chǎn)物有部分是全長(zhǎng)的條帶。用這二種RNA放射性轉(zhuǎn)換到cDNA中有12%。5.RNaseH活性:200單位酶與polyA:polydT37oC保溫60分鐘,釋放出的放射性要低于1%。

大多數(shù)逆轉(zhuǎn)錄酶都具有多種酶活性,主要包括以下幾種活性。①DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過(guò)程。此酶需要RNA為引物,多為賴氨酸的tRNA,在引物tRNA3'-末端以5'→3'方向合成DNA。反轉(zhuǎn)錄酶中不具有3'→5'外切酶活性,因此沒(méi)有校正功能,所以由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的DNA出錯(cuò)率比較高。②RNaseH活性;由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNaseH從RNA5'端水解掉RNA分子。③DNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;以反轉(zhuǎn)錄合成的首先條DNA單鏈為模板,以dNTP為底物,再合成第二條DNA分子。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)相關(guān)關(guān)器材如逆轉(zhuǎn)錄儀需經(jīng)常檢查,以保證反應(yīng)可靠性。

逆轉(zhuǎn)錄的端粒復(fù)制:對(duì)于線性基因組,其滯后鏈的末端是無(wú)法完整復(fù)制的,每次約損失30-200個(gè)核苷酸(Cells.2020Feb22;9(2).)。這樣隨著細(xì)胞分裂,端粒會(huì)持續(xù)縮短,造成復(fù)制性衰老。對(duì)于大多數(shù)體細(xì)胞來(lái)說(shuō),端粒磨損是一種控制其分裂潛力的機(jī)制,但對(duì)于需要多次增殖的干細(xì)胞來(lái)說(shuō),必須設(shè)法維持端粒長(zhǎng)度。端粒酶(telomerase)可以通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程延長(zhǎng)端粒。端粒酶由端粒酶RNA(TERC)和端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(TERT)組成。TERT使用TERC作為模板,在染色體的單鏈末端合成端粒DNA的重復(fù)序列。大多數(shù)體細(xì)胞缺乏端粒酶活性,因而容易衰老。但未分化的生殖細(xì)胞,干細(xì)胞,活化的淋巴細(xì)胞和大多數(shù)疙瘩細(xì)胞具有高水平的端粒酶活性,可以克服端粒磨損并維持無(wú)限的細(xì)胞分裂。逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)首先需要逆轉(zhuǎn)錄酶的反應(yīng)活性。上海快速逆轉(zhuǎn)錄試劑純度高

逆轉(zhuǎn)錄酶通常具有多種活性,如逆轉(zhuǎn)錄活性、復(fù)制活性與RNA酶H活性。上??焖倌孓D(zhuǎn)錄試劑純度高

miRNA逆轉(zhuǎn)錄莖環(huán)法:首先需要進(jìn)行RNA樣品制備,可選的方法有:離心柱法抽提(不必去除gDNA);傳統(tǒng)Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分別設(shè)計(jì)。是否采用通用引物視情況而定,正向引物與通用反向引物不會(huì)形成二聚體時(shí)才能用。取200ul的PCR管,根據(jù)所得每組RNA的濃度C,每孔加入1000ng總RNA,按公式1000ng/C計(jì)算出所需RNA的體積x。然后按建議的20μL反應(yīng)體系說(shuō)明,依次向200μL的PCR管內(nèi)加入下列試劑:加樣結(jié)束后,移液器吹打混勻,低速離心數(shù)秒。將逆轉(zhuǎn)錄PCR管放入PCR擴(kuò)增儀內(nèi),調(diào)整參數(shù):37℃15min(反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)),85℃5s(反轉(zhuǎn)錄酶的失活反應(yīng)),4℃∞。反應(yīng)結(jié)束后根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要進(jìn)行熒光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。說(shuō)明:此處可以選擇U6下游引物作為U6的逆轉(zhuǎn)錄引物,注意相應(yīng)地調(diào)整無(wú)酶水的體積和反應(yīng)溫度。上??焖倌孓D(zhuǎn)錄試劑純度高

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