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杭州miQP2逆轉(zhuǎn)錄酶

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-04-23

RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄中模板的選擇:在RT-PCR實(shí)驗(yàn)中,選擇總RNA或純化的mRNA作為模板進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄十分重要。mRNA雖然能提供略高的靈敏度,但總RNA經(jīng)常使用,具有較mRNA更重要的優(yōu)勢(shì)。首先,其過(guò)程需要較少的純化流程,這保證了更好的回收模板和更好的把結(jié)果標(biāo)準(zhǔn)化為起始的細(xì)胞數(shù)。第二,避免mRNA富集步驟,為了避免不同mRNA的回收率而帶來(lái)結(jié)果偏移的可能性??傊?,在大多數(shù)的應(yīng)用中,目標(biāo)基因的相對(duì)定量比檢測(cè)的非常靈敏度更重要,因此在多數(shù)情況下,總RNA更適用。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)中的RNA樣品處理時(shí)要避免使用酸性物質(zhì)、有機(jī)溶劑和酶切酶劑。杭州miQP2逆轉(zhuǎn)錄酶

M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶比AMV反轉(zhuǎn)錄酶缺乏連續(xù)性,因此要獲得像AMV反轉(zhuǎn)錄酶反應(yīng)中產(chǎn)生同樣量的cDNA就要求使用較多單位的M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶。用1微克的mRNA起始合成首先條鏈的cDNA,要用8單位的M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶才相當(dāng)于1單位的AMV反轉(zhuǎn)錄酶的作用。該酶很容易被亞精胺(Spermidine)所抑制,該酶非常不能用Promega的RiboprobeAMV反轉(zhuǎn)錄酶5X反應(yīng)緩沖液,也不能用Promega的RiboclonecDNA首先條鏈緩沖液,因?yàn)檫@二種緩沖液均含有亞精胺。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)可以選擇加入RNA合成抑制劑RNAse防止RNA降解和污染,逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過(guò)程需適當(dāng)?shù)腞NA質(zhì)量,過(guò)少或質(zhì)量不佳將影響擴(kuò)增效果。廈門反轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程是病毒的復(fù)制形式之一,如RNA病毒中的逆轉(zhuǎn)錄病毒。

逆轉(zhuǎn)錄的過(guò)程與端粒復(fù)制,逆轉(zhuǎn)錄酶通常具有多種活性,如逆轉(zhuǎn)錄活性、復(fù)制活性與RNA酶H活性。逆轉(zhuǎn)錄活性可以RNA為模板,合成與其序列互補(bǔ)的DNA鏈,生成DNA-RNA雜合雙鏈。RNA酶H活性可以水解雜合雙鏈中的RNA,得到與RNA互補(bǔ)的DNA單鏈(cDNA)。復(fù)制活性則用來(lái)合成雙鏈DNA。HIV逆轉(zhuǎn)錄酶的活性部位。與復(fù)制類似,逆轉(zhuǎn)錄也是由5’向3’合成DNA,要求有模板和不少于四個(gè)核苷酸的引物。各種DNA聚合酶活性都需要引物,只有確認(rèn)引物正確配對(duì),才會(huì)進(jìn)行DNA的合成。這是保證其忠實(shí)性的重要手段,逆轉(zhuǎn)錄酶也不例外。實(shí)驗(yàn)室合成cDNA時(shí),經(jīng)常會(huì)用合成的寡聚T(oligodT)作為引物,與mRNA的polyA配對(duì)。這個(gè)過(guò)程比較簡(jiǎn)單,因?yàn)橐锝Y(jié)合在RNA鏈的末端,所以整條鏈的逆轉(zhuǎn)錄是一次性完成的。

miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA加尾法逆轉(zhuǎn)錄:增加miRNA逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長(zhǎng)度較直接的方法就是增加miRNA的長(zhǎng)度,即在miRNA的3端后面添加一段序列,然后進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。因此,加尾法是由兩個(gè)酶共同作用完成的,它們分別是PolyA聚合酶和逆轉(zhuǎn)錄酶。PolyA聚合酶負(fù)責(zé)給miRNA加上PolyA尾,增加其長(zhǎng)度。之后逆轉(zhuǎn)錄引物結(jié)合到PolyA序列上,由逆轉(zhuǎn)錄酶完成加長(zhǎng)版cDNA的合成。miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR中的qPCR:miRNA熒光定量PCR的過(guò)程跟普通mRNA的相似,但由于加尾法逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的5端均為通用序列,因此其qPCR反向引物都是相同的(通用引物R),不同的是根據(jù)miRNA序列設(shè)計(jì)的正向引物。正向引物的特異性就變得非常重要。對(duì)于內(nèi)參,生工生物的miRNA加尾法首先鏈cDNA合成試劑盒(B532451)中內(nèi)置了內(nèi)參U6的正向引物,使用該引物與通用引物R即可進(jìn)行內(nèi)參U6的擴(kuò)增。逆轉(zhuǎn)錄在研究RNA表達(dá)調(diào)控等領(lǐng)域有普遍的應(yīng)用前景。

RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):去除基因組DNA污染:殘留的基因組DNA(gDNA)會(huì)對(duì)熒光定量結(jié)果造成很大的干擾,為了使結(jié)果更加的真實(shí)、可重復(fù),我們需要去除gDNA干擾。我們可以在引物設(shè)計(jì)時(shí)避免gDNA的擴(kuò)增,比如將上下游引物分別設(shè)在不同的外顯子上;或者在提取RNA后使用DNaseI處理以除去gDNA。較后,我們還有非常法寶,選擇一款具有g(shù)DNA去除功能的逆轉(zhuǎn)錄試劑盒,一步到位去除gDNA,省心省力max。RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):逆轉(zhuǎn)錄酶熱穩(wěn)定性:逆轉(zhuǎn)錄酶在整個(gè)反轉(zhuǎn)錄體系中具有關(guān)鍵性影響。除了活性以外,逆轉(zhuǎn)錄酶的熱穩(wěn)定性同樣很重要,在較高溫度下進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,能夠減少RNA的二級(jí)結(jié)構(gòu),增加逆轉(zhuǎn)錄的效率。野生型的M-MLV逆轉(zhuǎn)錄酶很“怕熱”,高于37℃時(shí),穩(wěn)定性大幅下降。逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)可以進(jìn)行從RNA到DNA的轉(zhuǎn)化,從而保護(hù)RNA序列的完整性。武漢彩色逆轉(zhuǎn)錄酶制造商

逆轉(zhuǎn)錄的反應(yīng)條件和反應(yīng)體系的優(yōu)化十分重要。杭州miQP2逆轉(zhuǎn)錄酶

雖然莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)在分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中具有普遍的應(yīng)用,但在實(shí)際應(yīng)用中還存在一些挑戰(zhàn)。例如,莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子需要經(jīng)過(guò)復(fù)雜的化學(xué)合成和純化過(guò)程,從而增加了技術(shù)的難度和成本。此外,莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)也面臨著樣品污染、PCR反應(yīng)中的非特異擴(kuò)增等問(wèn)題,需要在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和數(shù)據(jù)分析中進(jìn)行有效的控制和糾正??傊?,莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)是一種重要的分子生物學(xué)技術(shù),它具有特異性高、全長(zhǎng)擴(kuò)增、無(wú)需RNA純化等優(yōu)點(diǎn),在RNA的研究和檢測(cè)中得到了普遍的應(yīng)用。隨著分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究的不斷發(fā)展,莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)的應(yīng)用范圍也會(huì)不斷擴(kuò)展,并為科研和臨床診斷提供更多的技術(shù)支持。杭州miQP2逆轉(zhuǎn)錄酶

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