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逆轉(zhuǎn)錄的作用:除了病毒外,逆轉(zhuǎn)錄還在其他方面發(fā)揮了重要的作用。例如,在一些動(dòng)物體內(nèi),逆轉(zhuǎn)錄過程會(huì)導(dǎo)致基因的重組。這種重組可以使新的基因產(chǎn)生,從而使動(dòng)物產(chǎn)生新的特征。此外,逆轉(zhuǎn)錄還可以作為某些基因的調(diào)節(jié)機(jī)制,從而控制基因的表達(dá)和功能。逆轉(zhuǎn)錄的研究一直是生物學(xué)領(lǐng)域的熱點(diǎn)之一。研究人員希望通過了解逆轉(zhuǎn)錄酶的工作機(jī)制,從而找到一些新的方法來治著某些疾病。例如,在艾滋毒的研究中,研究人員發(fā)現(xiàn)了一些能夠抑制逆轉(zhuǎn)錄酶活性的藥物,從而使得病毒無法復(fù)制。這些藥物已經(jīng)被普遍應(yīng)用于艾滋的治著中,并且取得了明顯的療效。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)前要對(duì)反應(yīng)體系進(jìn)行無RNA和無反轉(zhuǎn)錄酶的對(duì)照。重慶快速反轉(zhuǎn)錄制造商
逆轉(zhuǎn)錄常見問題及解決方法之RNA濃度不高:a)、原始組織樣本或細(xì)胞量太少:提高加入量。b)、RNA發(fā)生降解:如果使用者確定提取RNA的試劑/器具沒有問題,RNA的降解通常發(fā)生在樣品破碎/勻漿階段。有兩個(gè)辦法可以徹底抑制內(nèi)源RNase活性:1.立即加入裂解液并且徹底而迅速地勻漿。這只適合培養(yǎng)細(xì)胞及內(nèi)源RNase含量較低的并且較容易勻漿的組織,2.對(duì)于內(nèi)源RNase含量高或不易勻漿的組織,如肝臟、胰腺、脾臟、肌肉等,或植物組織,需要切成小塊后立即投入液氮冷凍,再按說明進(jìn)行破碎/勻漿。c)、加入異丙醇后室溫沉淀10min或-20C冰沉淀30min即可,無需過夜沉淀。徐州一步法逆轉(zhuǎn)錄酶逆轉(zhuǎn)錄PCR是較常用的逆轉(zhuǎn)錄應(yīng)用之一。
逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)步驟:用SSⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶進(jìn)行RT(20ul體積)1、準(zhǔn)備0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暫離心。3、65℃水浴5分鐘后,立刻0℃冰水浴至少1分鐘。4、短暫離心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶。5、短暫離心。6、50℃水浴60分鐘進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。7、70℃水浴15分鐘滅活逆轉(zhuǎn)錄酶。8、-20℃保存,或立即進(jìn)行PCR。MCERTmix含有比例優(yōu)化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使cDNA合成可從RNA轉(zhuǎn)錄本的各個(gè)區(qū)域起始,并具有相同的逆轉(zhuǎn)錄效率,較大程度保證qPCR結(jié)果的真實(shí)性和可重復(fù)性。
miRNA逆轉(zhuǎn)錄莖環(huán)法:首先需要進(jìn)行RNA樣品制備,可選的方法有:離心柱法抽提(不必去除gDNA);傳統(tǒng)Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分別設(shè)計(jì)。是否采用通用引物視情況而定,正向引物與通用反向引物不會(huì)形成二聚體時(shí)才能用。取200ul的PCR管,根據(jù)所得每組RNA的濃度C,每孔加入1000ng總RNA,按公式1000ng/C計(jì)算出所需RNA的體積x。然后按建議的20μL反應(yīng)體系說明,依次向200μL的PCR管內(nèi)加入下列試劑:加樣結(jié)束后,移液器吹打混勻,低速離心數(shù)秒。將逆轉(zhuǎn)錄PCR管放入PCR擴(kuò)增儀內(nèi),調(diào)整參數(shù):37℃15min(反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)),85℃5s(反轉(zhuǎn)錄酶的失活反應(yīng)),4℃∞。反應(yīng)結(jié)束后根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要進(jìn)行熒光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。說明:此處可以選擇U6下游引物作為U6的逆轉(zhuǎn)錄引物,注意相應(yīng)地調(diào)整無酶水的體積和反應(yīng)溫度。逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)可以進(jìn)行從RNA到DNA的轉(zhuǎn)化,從而保護(hù)RNA序列的完整性。
逆轉(zhuǎn)錄酶實(shí)驗(yàn)一步法與兩步法具有以下區(qū)別:一步法比兩步法更快速、簡(jiǎn)便、減少了污染機(jī)會(huì)、減少了RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)、減少了PCR反應(yīng)的錯(cuò)配率;兩步法的優(yōu)勢(shì)在于中間產(chǎn)物cDNA,便于保存;且第二步PCR只取逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)產(chǎn)物的1/10進(jìn)行反應(yīng),有利于PCR條件的調(diào)整,實(shí)驗(yàn)重現(xiàn)性強(qiáng);兩步法可以在第二步PCR反應(yīng)體系中加入特異性引物,其靈敏度比一步法高;兩步法包括首先鏈cDNA合成和隨后的PCR反應(yīng),容易產(chǎn)生污染問題;兩步法的實(shí)驗(yàn)預(yù)算要低于一步法。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)在反應(yīng)前應(yīng)將各反應(yīng)試劑混勻,避免試劑沉淀或剪切。徐州一步法逆轉(zhuǎn)錄酶
逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)時(shí)要記錄反應(yīng)體系的溫度、時(shí)間、反應(yīng)試劑的添加量等參數(shù)。重慶快速反轉(zhuǎn)錄制造商
逆轉(zhuǎn)錄酶還有DNA內(nèi)切酶活性,這可能與病毒基因整合到宿主細(xì)胞染色體DNA中有關(guān)。逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)對(duì)于遺傳工程技術(shù)起了很大的推動(dòng)作用,它已成為一種重要的工具酶。用組織細(xì)胞提取mRNA并以它為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補(bǔ)的cDNA,由此可構(gòu)建出cDNA文庫(kù)(cDNAlibrary),從中篩選特異的目的基因,這是在基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的方法。簡(jiǎn)要過程表示:逆轉(zhuǎn)錄酶的作用是以dNTP為底物,以RNA為模板,tRNA(主要是色氨酸t(yī)RNA)為引物,在tRNA3'-末端上,按5'→3'方向,合成一條與RNA模板互補(bǔ)的cDNA單鏈,它與RNA模板形成RNA-cDNA雜交體。隨后又在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,水解掉RNA鏈,再以cDNA為模板合成第二條DNA鏈。至此,完成由RNA指導(dǎo)的DNA合成過程。病毒復(fù)制方式:逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于RNA病毒):RNA→DNA→RNA。擬逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于DNA病毒):DNA→RNA→DNA。重慶快速反轉(zhuǎn)錄制造商
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