逆轉(zhuǎn)錄的過程與端粒復制,逆轉(zhuǎn)錄酶通常具有多種活性,如逆轉(zhuǎn)錄活性、復制活性與RNA酶H活性。逆轉(zhuǎn)錄活性可以RNA為模板,合成與其序列互補的DNA鏈,生成DNA-RNA雜合雙鏈。RNA酶H活性可以水解雜合雙鏈中的RNA,得到與RNA互補的DNA單鏈(cDNA)。復制活性則用來合成雙鏈DNA。HIV逆轉(zhuǎn)錄酶的活性部位。與復制類似,逆轉(zhuǎn)錄也是由5’向3’合成DNA,要求有模板和不少于四個核苷酸的引物。各種DNA聚合酶活性都需要引物,只有確認引物正確配對,才會進行DNA的合成。這是保證其忠實性的重要手段,逆轉(zhuǎn)錄酶也不例外。實驗室合成cDNA時,經(jīng)常會用合成的寡聚T(oligodT)作為引物,與mRNA的polyA配對。這個過程比較簡單,因為引物結(jié)合在RNA鏈的末端,所以整條鏈的逆轉(zhuǎn)錄是一次性完成的。逆轉(zhuǎn)錄實驗過程需適當?shù)腞NA質(zhì)量,過少或質(zhì)量不佳將影響擴增效果。成都miQP2逆轉(zhuǎn)錄酶
逆轉(zhuǎn)錄酶還有DNA內(nèi)切酶活性,這可能與病毒基因整合到宿主細胞染色體DNA中有關(guān)。逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)對于遺傳工程技術(shù)起了很大的推動作用,它已成為一種重要的工具酶。用組織細胞提取mRNA并以它為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補的cDNA,由此可構(gòu)建出cDNA文庫(cDNAlibrary),從中篩選特異的目的基因,這是在基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的方法。簡要過程表示:逆轉(zhuǎn)錄酶的作用是以dNTP為底物,以RNA為模板,tRNA(主要是色氨酸t(yī)RNA)為引物,在tRNA3'-末端上,按5'→3'方向,合成一條與RNA模板互補的cDNA單鏈,它與RNA模板形成RNA-cDNA雜交體。隨后又在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,水解掉RNA鏈,再以cDNA為模板合成第二條DNA鏈。至此,完成由RNA指導的DNA合成過程。病毒復制方式:逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于RNA病毒):RNA→DNA→RNA。擬逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于DNA病毒):DNA→RNA→DNA。上海miQP2逆轉(zhuǎn)錄試劑純度高逆轉(zhuǎn)錄實驗過程中需要考慮RNA模板質(zhì)量和RNA純化的方法。
逆轉(zhuǎn)錄的端粒復制:逆轉(zhuǎn)錄經(jīng)常與細胞惡性轉(zhuǎn)化有關(guān),艾滋、乙肝等很多疾病也有逆轉(zhuǎn)錄過程。所以相關(guān)研究可以為很多疾病的研究和防治提供幫助。逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑就一直是藥物研發(fā)熱點,例如抗HIV的nevirapine。逆轉(zhuǎn)錄酶缺乏校對(3'-5'核酸外切酶)功能,所以容易出錯。這也是很多病毒容易突變進化的原因,比如nevirapine就很容易被抵抗。不過,校對功能與逆轉(zhuǎn)錄活性并不矛盾。有人使用改良的定向進化策略從具有校對功能的DNA聚合酶(古細菌的DNA聚合酶B)進化出高保真的耐熱逆轉(zhuǎn)錄酶,稱為逆轉(zhuǎn)錄異種聚合酶(reversetranscriptionxenopolymerase),證明校對與逆轉(zhuǎn)錄是兼容的。在科研中,RTX可用于RT-PCR等過程,能夠提高精確度及簡化操作程序。
RT-PCR就是逆轉(zhuǎn)錄PCR或稱為反轉(zhuǎn)錄PCR(Reversetranscription-PCR,RT-PCR),是以RNA為材料應(yīng)用于PCR擴增中的一種實驗方法。首先通過逆轉(zhuǎn)錄酶將總RNA或信使RNA(mRNA)轉(zhuǎn)錄成互補DNA(cDNA)。其次TaqDNA聚合酶以cDNA為模板進行qPCR擴增。RT-PCR已被普遍應(yīng)用于多種分子生物學應(yīng)用中,包括基因表達分析、基因測試、RNA干擾驗證檢測、微陣列驗證、病原體檢測和疾病研究。RT-PCR的方法之一步法和兩步法:RT-PCR其操作方法分為兩種,即一步法和兩步法。一步法RT-PCR,逆轉(zhuǎn)錄同PCR擴增結(jié)合在一起,即cDNA合成與PCR擴增反應(yīng)在同一管Buffer及酶中進行,一步完成。兩步法RT-PCR,RNA首先在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下生成cDNA,再以cDNA為模板進行PCR擴增,分成兩步進行。逆轉(zhuǎn)錄后的DNA可直接用于基因克隆或測序等應(yīng)用。
莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄是一種逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的技術(shù),它利用莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子作為反向引物,在逆轉(zhuǎn)錄過程中特異性地擴增目標RNA分子。該技術(shù)在分子生物學和醫(yī)學研究中得到了普遍的應(yīng)用,特別是在RNA的研究和檢測中具有獨特的優(yōu)勢。莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)的基本原理是利用逆轉(zhuǎn)錄酶和莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA作為反向引物,將RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,并在PCR反應(yīng)中擴增。莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子具有較高的穩(wěn)定性和特異性,可以特異性地識別和結(jié)合目標RNA分子,從而在逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中作為反向引物擴增目標cDNA。此外,由于莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子與目標RNA分子的堿基序列互補,因此莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)可以避免隨機引物引起的非特異擴增。酵母菌逆轉(zhuǎn)錄酶是逆轉(zhuǎn)錄酶家族中的一個重要表示。成都快速逆轉(zhuǎn)錄酶費用
逆轉(zhuǎn)錄實驗中可以通過qPCR檢測逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)效果。成都miQP2逆轉(zhuǎn)錄酶
miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA的在qRT-PCR過程有所不同。一般來講,mRNA比較長,其長度通常在幾百至幾千個核苷酸,因此使用隨機引物(RandomPrimerp(dN)6)即可隨機結(jié)合到mRNA的各位置進行逆轉(zhuǎn)錄。由于qPCR的過程只需擴增目的片段的一部分(80~200bp),因此使用隨機引物的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物盡管不完整,也完全能夠滿足qPCR的需求。當然,也可以使用OligodT引物統(tǒng)一從mRNA的ployA尾巴開始逆轉(zhuǎn)錄。這種逆轉(zhuǎn)錄引物在擴增cDNA全長時是必須的,但要注意,原核生物的mRNA和某些lncRNA不具有ployA尾,因此不能使用OligodT引物進行逆轉(zhuǎn)錄。成都miQP2逆轉(zhuǎn)錄酶
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