M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶比AMV反轉(zhuǎn)錄酶缺乏連續(xù)性,因此要獲得像AMV反轉(zhuǎn)錄酶反應(yīng)中產(chǎn)生同樣量的cDNA就要求使用較多單位的M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶。用1微克的mRNA起始合成首先條鏈的cDNA,要用8單位的M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶才相當(dāng)于1單位的AMV反轉(zhuǎn)錄酶的作用。該酶很容易被亞精胺(Spermidine)所抑制,該酶非常不能用Promega的RiboprobeAMV反轉(zhuǎn)錄酶5X反應(yīng)緩沖液,也不能用Promega的RiboclonecDNA首先條鏈緩沖液,因為這二種緩沖液均含有亞精胺。逆轉(zhuǎn)錄實驗可以選擇加入RNA合成抑制劑RNAse防止RNA降解和污染,逆轉(zhuǎn)錄實驗過程需適當(dāng)?shù)腞NA質(zhì)量,過少或質(zhì)量不佳將影響擴(kuò)增效果。逆轉(zhuǎn)錄是蛋白質(zhì)的先導(dǎo)RNA的合成方式。一體化反轉(zhuǎn)錄測序
逆轉(zhuǎn)錄常見問題及解決方法之RNA濃度不高:a)、原始組織樣本或細(xì)胞量太少:提高加入量。b)、RNA發(fā)生降解:如果使用者確定提取RNA的試劑/器具沒有問題,RNA的降解通常發(fā)生在樣品破碎/勻漿階段。有兩個辦法可以徹底抑制內(nèi)源RNase活性:1.立即加入裂解液并且徹底而迅速地勻漿。這只適合培養(yǎng)細(xì)胞及內(nèi)源RNase含量較低的并且較容易勻漿的組織,2.對于內(nèi)源RNase含量高或不易勻漿的組織,如肝臟、胰腺、脾臟、肌肉等,或植物組織,需要切成小塊后立即投入液氮冷凍,再按說明進(jìn)行破碎/勻漿。c)、加入異丙醇后室溫沉淀10min或-20C冰沉淀30min即可,無需過夜沉淀。成都一體化反轉(zhuǎn)錄蛋白檢測逆轉(zhuǎn)錄酶是逆轉(zhuǎn)錄過程中的重要酶類。
反轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase,也可寫成逆轉(zhuǎn)錄酶)又稱為依賴RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中發(fā)現(xiàn)了一種特殊的DNA聚合酶,該酶以RNA為模板,以dNTP為底物,tRNA(主要是色氨酸t(yī)RNA)為引物,在tRNA3'-OH末端上,根據(jù)堿基配對的原則,按5'-3'方向合成一條與RNA模板互補(bǔ)的DNA單鏈,這條DNA單鏈叫做互補(bǔ)DNA(complementaryDNA,CDNA)。反轉(zhuǎn)錄酶(Reversetranscriptase)是以RNA為模板指導(dǎo)三磷酸脫氧核苷酸合成互補(bǔ)DNA(cDNA)的酶。哺乳類C型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶和鼠類B型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶都是一條多肽鏈。鳥類RNA病毒的反轉(zhuǎn)錄酶則由兩上亞基結(jié)構(gòu)。真核生物中也都分離出具有不同結(jié)構(gòu)的反轉(zhuǎn)錄酶。
逆轉(zhuǎn)錄過程由逆轉(zhuǎn)錄酶催化,此酶也稱依賴RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA為模板催化DNA鏈的合成。合成的DNA鏈稱為與RNA互補(bǔ)DNA(complementaryDNA,cDNA)。逆轉(zhuǎn)錄酶在生物界存在于逆轉(zhuǎn)錄病毒以及真核細(xì)胞(如端粒酶)中,擬逆轉(zhuǎn)錄病毒沒有單獨(dú)的逆轉(zhuǎn)錄酶,其DNA聚合酶帶有逆轉(zhuǎn)錄酶的活性,可能與病毒的惡性轉(zhuǎn)化有關(guān)。人類免疫缺陷病毒(HIV)就是一種逆轉(zhuǎn)錄病毒,含有逆轉(zhuǎn)錄酶。在小鼠及人的正常細(xì)胞和胚胎細(xì)胞中也有逆轉(zhuǎn)錄酶,例如端粒酶就是一種逆轉(zhuǎn)錄酶,推測可能與細(xì)胞分化和胚胎發(fā)育有關(guān)。質(zhì)粒RNA檢測中的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)需要特定反應(yīng)體系。
反轉(zhuǎn)錄酶的注意事項,在進(jìn)行RT反應(yīng)之前,應(yīng)考慮以下幾個方面:RNA:成功的cDNA合成來自高質(zhì)量的RNA,高質(zhì)量的RNA至少應(yīng)保證全長并且不含逆轉(zhuǎn)錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。在提取RNA的過程中,要特別防止RNase的污染,同時在逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中經(jīng)常加入RNase抑制劑以增加cDNA合成的長度和產(chǎn)量。RNase抑制劑要在首先鏈cDNA合成反應(yīng)中,在緩沖液和還原劑(如DTT)存在的條件下加入,因為cDNA合成前的過程會使抑制劑變性,從而釋放結(jié)合的可以降解RNA的RNase。蛋白RNase抑制劑只防止RNaseA,B,C對RNA的降解,并不能防止皮膚上的RNase,因此盡管使用了這些抑制劑,也要小心不要從手指上引入RNase,實驗過程中經(jīng)常更換新手套。逆轉(zhuǎn)錄過程中的缺陷會導(dǎo)致錯誤擴(kuò)增和偏差。蘇州一體化逆轉(zhuǎn)錄多少錢
逆轉(zhuǎn)錄實驗過程需適當(dāng)?shù)腞NA質(zhì)量,過少或質(zhì)量不佳將影響擴(kuò)增效果。一體化反轉(zhuǎn)錄測序
miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA的在qRT-PCR過程有所不同。一般來講,mRNA比較長,其長度通常在幾百至幾千個核苷酸,因此使用隨機(jī)引物(RandomPrimerp(dN)6)即可隨機(jī)結(jié)合到mRNA的各位置進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。由于qPCR的過程只需擴(kuò)增目的片段的一部分(80~200bp),因此使用隨機(jī)引物的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物盡管不完整,也完全能夠滿足qPCR的需求。當(dāng)然,也可以使用OligodT引物統(tǒng)一從mRNA的ployA尾巴開始逆轉(zhuǎn)錄。這種逆轉(zhuǎn)錄引物在擴(kuò)增cDNA全長時是必須的,但要注意,原核生物的mRNA和某些lncRNA不具有ployA尾,因此不能使用OligodT引物進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。一體化反轉(zhuǎn)錄測序
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